MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008312	TATT	2	8	488172	488179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_008312	GTA	2	6	488180	488185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_008312	GAT	2	6	488190	488195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_008312	ACC	2	6	488202	488207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_008312	ATT	2	6	488216	488221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_008312	TAA	3	9	488231	488239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_008312	ATT	2	6	488261	488266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_008312	CTA	2	6	488332	488337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_008312	CAAA	2	8	488375	488382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_008312	GAG	2	6	488387	488392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_008312	CAA	2	6	488433	488438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_008312	AT	3	6	488480	488485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_008312	A	7	7	488532	488538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_008312	TCA	2	6	488551	488556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474203
11515	NC_008312	CTAG	2	8	488563	488570	25 %	25 %	25 %	25 %	113474203
11516	NC_008312	TCT	2	6	488575	488580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474203
11517	NC_008312	TAC	2	6	488583	488588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474203
11518	NC_008312	CTA	2	6	488596	488601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474203
11519	NC_008312	CTA	2	6	488612	488617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474203
11520	NC_008312	CTTTTT	2	12	488624	488635	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	113474203
11521	NC_008312	TTC	2	6	488652	488657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474203
11522	NC_008312	TAC	2	6	488768	488773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474203
11523	NC_008312	T	6	6	488797	488802	0 %	100 %	0 %	0 %	113474203
11524	NC_008312	CAA	2	6	488846	488851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474203
11525	NC_008312	ATA	2	6	488860	488865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474203
11526	NC_008312	ATT	2	6	488869	488874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474203
11527	NC_008312	TAA	2	6	488904	488909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474203
11528	NC_008312	A	6	6	488925	488930	100 %	0 %	0 %	0 %	113474203
11529	NC_008312	AAT	2	6	488962	488967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474203
11530	NC_008312	GCC	2	6	488978	488983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113474203
11531	NC_008312	AT	3	6	488994	488999	50 %	50 %	0 %	0 %	113474203
11532	NC_008312	CAA	2	6	489101	489106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474203
11533	NC_008312	A	6	6	489128	489133	100 %	0 %	0 %	0 %	113474203
11534	NC_008312	T	7	7	489166	489172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_008312	TAT	2	6	489179	489184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_008312	AC	3	6	489219	489224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11537	NC_008312	A	8	8	489230	489237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_008312	ACT	2	6	489256	489261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474204
11539	NC_008312	GAC	2	6	489305	489310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474204
11540	NC_008312	CGT	2	6	489371	489376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474204
11541	NC_008312	TAC	2	6	489419	489424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474204
11542	NC_008312	AAAT	2	8	489477	489484	75 %	25 %	0 %	0 %	113474204
11543	NC_008312	A	6	6	489505	489510	100 %	0 %	0 %	0 %	113474204
11544	NC_008312	A	6	6	489574	489579	100 %	0 %	0 %	0 %	113474204
11545	NC_008312	A	7	7	489633	489639	100 %	0 %	0 %	0 %	113474204
11546	NC_008312	ATA	2	6	489712	489717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474204
11547	NC_008312	ACC	2	6	489747	489752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474204
11548	NC_008312	CTT	3	9	489757	489765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474204
11549	NC_008312	TAA	2	6	489866	489871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474204
11550	NC_008312	GGT	2	6	489886	489891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474204
11551	NC_008312	CTA	2	6	489949	489954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474204
11552	NC_008312	CAA	2	6	489980	489985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474204
11553	NC_008312	AT	3	6	490114	490119	50 %	50 %	0 %	0 %	113474204
11554	NC_008312	AAAC	2	8	490158	490165	75 %	0 %	0 %	25 %	113474204
11555	NC_008312	T	6	6	490250	490255	0 %	100 %	0 %	0 %	113474204
11556	NC_008312	TAA	2	6	490271	490276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474204
11557	NC_008312	CTA	2	6	490289	490294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474204
11558	NC_008312	ATT	2	6	490320	490325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474204
11559	NC_008312	TTG	2	6	490335	490340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474204
11560	NC_008312	TTTA	2	8	490348	490355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_008312	T	7	7	490374	490380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_008312	GAAT	2	8	490381	490388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_008312	TATT	2	8	490395	490402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_008312	T	7	7	490426	490432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_008312	TA	3	6	490447	490452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_008312	AAT	2	6	490512	490517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_008312	TAG	2	6	490677	490682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_008312	AT	4	8	490734	490741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_008312	AAAT	2	8	490830	490837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_008312	ACTTA	2	10	490845	490854	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11571	NC_008312	T	7	7	490864	490870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_008312	AGAT	3	12	490874	490885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_008312	ATT	2	6	490888	490893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_008312	TTA	2	6	490994	490999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_008312	TAAT	2	8	491038	491045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_008312	T	7	7	491045	491051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_008312	ATA	2	6	491068	491073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_008312	T	6	6	491093	491098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_008312	AAAT	2	8	491123	491130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_008312	TAA	2	6	491211	491216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_008312	AGC	2	6	491223	491228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_008312	AATAT	2	10	491272	491281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_008312	ACA	2	6	491312	491317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_008312	ATC	2	6	491336	491341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_008312	GAT	2	6	491378	491383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_008312	TAA	2	6	491394	491399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_008312	CTT	2	6	491475	491480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_008312	GAA	2	6	491528	491533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_008312	AACC	2	8	491631	491638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11590	NC_008312	TCC	2	6	491667	491672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_008312	GCCA	2	8	491698	491705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11592	NC_008312	GCAC	2	8	491738	491745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_008312	CAG	2	6	491785	491790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_008312	GTG	2	6	491800	491805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_008312	TTAA	2	8	491850	491857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_008312	A	6	6	491936	491941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_008312	TGCT	2	8	492057	492064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_008312	CTG	2	6	492068	492073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_008312	T	6	6	492092	492097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_008312	T	7	7	492111	492117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_008312	T	6	6	492143	492148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_008312	TTA	2	6	492157	492162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_008312	A	8	8	492205	492212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_008312	T	6	6	492268	492273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_008312	AGT	2	6	492303	492308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_008312	ATT	2	6	492342	492347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_008312	TAA	3	9	492353	492361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_008312	TCA	2	6	492363	492368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_008312	TAA	2	6	492395	492400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_008312	ATAA	2	8	492414	492421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_008312	ATGA	2	8	492443	492450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_008312	AGA	2	6	492585	492590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474205
11613	NC_008312	A	6	6	492647	492652	100 %	0 %	0 %	0 %	113474205
11614	NC_008312	CTAC	2	8	492694	492701	25 %	25 %	0 %	50 %	113474205
11615	NC_008312	ATTTAG	2	12	492759	492770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	113474205
11616	NC_008312	CTA	2	6	492964	492969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474205
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11618	NC_008312	AGC	2	6	493005	493010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474205
11619	NC_008312	GCT	2	6	493096	493101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474205
11620	NC_008312	TGC	2	6	493104	493109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474205
11621	NC_008312	AGG	2	6	493116	493121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474205
11622	NC_008312	GAG	2	6	493228	493233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474205
11623	NC_008312	GATA	2	8	493281	493288	50 %	25 %	25 %	0 %	113474205
11624	NC_008312	ACG	2	6	493323	493328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474205
11625	NC_008312	TAC	2	6	493590	493595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474205
11626	NC_008312	AGTT	2	8	493602	493609	25 %	50 %	25 %	0 %	113474205
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