MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008312	CAG	2	6	422224	422229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_008312	ATT	2	6	422281	422286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_008312	A	6	6	422305	422310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_008312	TAA	2	6	422311	422316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_008312	GA	3	6	422328	422333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_008312	AAACT	2	10	422341	422350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10007	NC_008312	A	7	7	422377	422383	100 %	0 %	0 %	0 %	113474167
10008	NC_008312	A	6	6	422400	422405	100 %	0 %	0 %	0 %	113474167
10009	NC_008312	ATT	3	9	422440	422448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10010	NC_008312	GGT	2	6	422473	422478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474167
10011	NC_008312	TTGG	2	8	422540	422547	0 %	50 %	50 %	0 %	113474167
10012	NC_008312	T	6	6	422560	422565	0 %	100 %	0 %	0 %	113474167
10013	NC_008312	GCA	2	6	422734	422739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474167
10014	NC_008312	ATTA	2	8	422763	422770	50 %	50 %	0 %	0 %	113474167
10015	NC_008312	AAC	2	6	422796	422801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474167
10016	NC_008312	TTAGT	2	10	422834	422843	20 %	60 %	20 %	0 %	113474167
10017	NC_008312	TAG	2	6	422859	422864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474167
10018	NC_008312	TTA	2	6	422899	422904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10019	NC_008312	ATTTT	2	10	422935	422944	20 %	80 %	0 %	0 %	113474167
10020	NC_008312	A	6	6	422949	422954	100 %	0 %	0 %	0 %	113474167
10021	NC_008312	A	7	7	422988	422994	100 %	0 %	0 %	0 %	113474167
10022	NC_008312	TAA	2	6	423021	423026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474167
10023	NC_008312	TTA	2	6	423043	423048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10024	NC_008312	ATT	2	6	423055	423060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10025	NC_008312	TA	3	6	423097	423102	50 %	50 %	0 %	0 %	113474167
10026	NC_008312	CTT	2	6	423131	423136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474167
10027	NC_008312	ATT	2	6	423151	423156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10028	NC_008312	CAG	2	6	423162	423167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474167
10029	NC_008312	T	7	7	423173	423179	0 %	100 %	0 %	0 %	113474167
10030	NC_008312	TAT	2	6	423252	423257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10031	NC_008312	TATTG	2	10	423259	423268	20 %	60 %	20 %	0 %	113474167
10032	NC_008312	AATA	2	8	423288	423295	75 %	25 %	0 %	0 %	113474167
10033	NC_008312	TTAT	2	8	423307	423314	25 %	75 %	0 %	0 %	113474167
10034	NC_008312	TTA	2	6	423325	423330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10035	NC_008312	TTA	2	6	423370	423375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474167
10036	NC_008312	TCA	2	6	423424	423429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474167
10037	NC_008312	AGC	2	6	423604	423609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_008312	A	6	6	423611	423616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_008312	AT	3	6	423646	423651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_008312	AAT	2	6	423657	423662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_008312	TATAA	2	10	423685	423694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_008312	TA	4	8	423757	423764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_008312	AT	3	6	423765	423770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_008312	AATA	2	8	423790	423797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_008312	ATTT	2	8	423806	423813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_008312	T	6	6	423811	423816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_008312	ATT	2	6	423868	423873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_008312	CAA	2	6	423892	423897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_008312	TAC	2	6	424005	424010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474168
10050	NC_008312	TTA	2	6	424016	424021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474168
10051	NC_008312	AAC	2	6	424083	424088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474168
10052	NC_008312	A	7	7	424140	424146	100 %	0 %	0 %	0 %	113474168
10053	NC_008312	T	6	6	424273	424278	0 %	100 %	0 %	0 %	113474168
10054	NC_008312	AAC	2	6	424307	424312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474168
10055	NC_008312	AAT	2	6	424320	424325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474168
10056	NC_008312	CAT	2	6	424369	424374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474168
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10058	NC_008312	CAT	2	6	424417	424422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474168
10059	NC_008312	GAA	2	6	424483	424488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474168
10060	NC_008312	GAA	2	6	424504	424509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474168
10061	NC_008312	TAT	2	6	424523	424528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474168
10062	NC_008312	GAA	2	6	424540	424545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474168
10063	NC_008312	A	6	6	424549	424554	100 %	0 %	0 %	0 %	113474168
10064	NC_008312	ATG	2	6	424610	424615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474168
10065	NC_008312	GAA	2	6	424618	424623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474168
10066	NC_008312	GAAA	2	8	424653	424660	75 %	0 %	25 %	0 %	113474168
10067	NC_008312	AAG	2	6	424718	424723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474168
10068	NC_008312	A	6	6	424837	424842	100 %	0 %	0 %	0 %	113474168
10069	NC_008312	TGC	2	6	424911	424916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_008312	ATT	2	6	424922	424927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_008312	TAA	2	6	424928	424933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_008312	AAT	2	6	424974	424979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_008312	CTTA	2	8	424986	424993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10074	NC_008312	GTA	2	6	425031	425036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_008312	ATA	2	6	425092	425097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_008312	A	6	6	425104	425109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_008312	AAT	2	6	425223	425228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474169
10078	NC_008312	A	6	6	425263	425268	100 %	0 %	0 %	0 %	113474169
10079	NC_008312	ACA	2	6	425278	425283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474169
10080	NC_008312	ACT	2	6	425377	425382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474169
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10082	NC_008312	AAAG	2	8	425430	425437	75 %	0 %	25 %	0 %	113474169
10083	NC_008312	GAA	2	6	425529	425534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474169
10084	NC_008312	TTA	2	6	425563	425568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474169
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10087	NC_008312	CAG	2	6	425828	425833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474169
10088	NC_008312	TCA	2	6	425846	425851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474169
10089	NC_008312	TAA	2	6	425916	425921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474169
10090	NC_008312	TGC	2	6	425925	425930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474169
10091	NC_008312	ACA	2	6	425956	425961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474169
10092	NC_008312	A	6	6	425970	425975	100 %	0 %	0 %	0 %	113474169
10093	NC_008312	TCGT	2	8	425985	425992	0 %	50 %	25 %	25 %	113474169
10094	NC_008312	AGA	2	6	426027	426032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474169
10095	NC_008312	GTAA	2	8	426037	426044	50 %	25 %	25 %	0 %	113474169
10096	NC_008312	ACT	2	6	426049	426054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474169
10097	NC_008312	GTG	2	6	426095	426100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474169
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10100	NC_008312	GTT	2	6	426308	426313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474169
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10102	NC_008312	CAC	2	6	426355	426360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474169
10103	NC_008312	CTT	2	6	426374	426379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474169
10104	NC_008312	GCT	2	6	426424	426429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474169
10105	NC_008312	ACC	2	6	426447	426452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474169
10106	NC_008312	GAG	2	6	426470	426475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474169
10107	NC_008312	CAT	2	6	426491	426496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474169
10108	NC_008312	TTCT	2	8	426525	426532	0 %	75 %	0 %	25 %	113474169
10109	NC_008312	CAGAAT	2	12	426591	426602	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113474169
10110	NC_008312	T	7	7	426602	426608	0 %	100 %	0 %	0 %	113474169
10111	NC_008312	GCA	2	6	426616	426621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474169
10112	NC_008312	ACC	2	6	426639	426644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474169
10113	NC_008312	AAT	2	6	426663	426668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474169
10114	NC_008312	CAT	2	6	426671	426676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474169
10115	NC_008312	GTC	2	6	426684	426689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474169
10116	NC_008312	AAT	2	6	426690	426695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474169
10117	NC_008312	GTA	2	6	426711	426716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_008312	T	7	7	426718	426724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_008312	GAA	2	6	426735	426740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_008312	ATT	2	6	426753	426758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_008312	ATA	2	6	426828	426833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_008312	ATT	2	6	426853	426858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_008312	CTAC	2	8	426892	426899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_008312	CTC	2	6	426973	426978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_008312	CTT	2	6	427053	427058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_008312	T	6	6	427057	427062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_008312	AGT	2	6	427100	427105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10150	NC_008312	AGAT	2	8	428106	428113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_008312	CGC	2	6	428123	428128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10154	NC_008312	TTG	2	6	428237	428242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10237	NC_008312	ATGT	2	8	431839	431846	25 %	50 %	25 %	0 %	113474174
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10241	NC_008312	ATA	2	6	432019	432024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474174
10242	NC_008312	TGTAT	2	10	432057	432066	20 %	60 %	20 %	0 %	113474174
10243	NC_008312	GGT	2	6	432096	432101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474174
10244	NC_008312	TCT	2	6	432118	432123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_008312	TAGATA	2	12	432131	432142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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10247	NC_008312	GTT	2	6	432170	432175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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