MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008312	AAAG	2	8	21657	21664	75 %	0 %	25 %	0 %	113473950
502	NC_008312	AAT	2	6	21684	21689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473950
503	NC_008312	CTA	3	9	21698	21706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473950
504	NC_008312	T	6	6	21770	21775	0 %	100 %	0 %	0 %	113473950
505	NC_008312	TAT	2	6	21809	21814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473950
506	NC_008312	CTT	2	6	21875	21880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473950
507	NC_008312	C	6	6	21988	21993	0 %	0 %	0 %	100 %	113473950
508	NC_008312	AAT	2	6	22044	22049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473950
509	NC_008312	GGC	2	6	22377	22382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113473950
510	NC_008312	ACC	2	6	22401	22406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113473950
511	NC_008312	ATT	2	6	22436	22441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008312	ATG	2	6	22455	22460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008312	T	6	6	22485	22490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008312	GAG	2	6	22505	22510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008312	T	7	7	22532	22538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008312	TCAA	2	8	22540	22547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_008312	ATT	2	6	22578	22583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008312	GAA	2	6	22588	22593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008312	ATTA	2	8	22608	22615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008312	ACC	2	6	22638	22643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_008312	GCT	2	6	22654	22659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008312	ATC	2	6	22668	22673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008312	GA	3	6	22730	22735	50 %	0 %	50 %	0 %	113473951
524	NC_008312	CTGA	2	8	22874	22881	25 %	25 %	25 %	25 %	113473951
525	NC_008312	CAAGT	2	10	22893	22902	40 %	20 %	20 %	20 %	113473951
526	NC_008312	T	6	6	22940	22945	0 %	100 %	0 %	0 %	113473951
527	NC_008312	ATTT	2	8	22967	22974	25 %	75 %	0 %	0 %	113473951
528	NC_008312	CAG	2	6	23024	23029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113473951
529	NC_008312	ATA	2	6	23062	23067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473951
530	NC_008312	TTC	2	6	23094	23099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008312	TTAAA	2	10	23104	23113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008312	A	6	6	23111	23116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008312	AGT	2	6	23136	23141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008312	ATTA	2	8	23150	23157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008312	ATA	2	6	23197	23202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008312	TAAT	2	8	23218	23225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008312	TAG	2	6	23240	23245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008312	AACTG	2	10	23408	23417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
539	NC_008312	CT	3	6	23466	23471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008312	ACA	2	6	23481	23486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008312	AGG	2	6	23604	23609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008312	A	6	6	23610	23615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008312	T	9	9	23616	23624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008312	TTA	2	6	23642	23647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008312	TCA	2	6	23701	23706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008312	TTA	2	6	24065	24070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473952
547	NC_008312	TCT	2	6	24082	24087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473952
548	NC_008312	ATTA	2	8	24141	24148	50 %	50 %	0 %	0 %	113473952
549	NC_008312	T	6	6	24172	24177	0 %	100 %	0 %	0 %	113473952
550	NC_008312	TCA	2	6	24184	24189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473952
551	NC_008312	CCT	2	6	24206	24211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113473952
552	NC_008312	T	7	7	24231	24237	0 %	100 %	0 %	0 %	113473952
553	NC_008312	ACC	2	6	24240	24245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113473952
554	NC_008312	TTC	2	6	24249	24254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473952
555	NC_008312	GTTT	2	8	24283	24290	0 %	75 %	25 %	0 %	113473952
556	NC_008312	TAT	2	6	24341	24346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008312	AAG	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008312	TAC	2	6	24431	24436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008312	ATT	2	6	24444	24449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008312	TTA	2	6	24487	24492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008312	TTG	2	6	24493	24498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008312	CTT	2	6	24519	24524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008312	CATT	2	8	24529	24536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_008312	TGG	2	6	24564	24569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008312	T	6	6	24608	24613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008312	TAT	2	6	24621	24626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008312	A	6	6	24646	24651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008312	CCT	2	6	24676	24681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_008312	CACC	2	8	24754	24761	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
570	NC_008312	A	8	8	24831	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008312	GCT	2	6	24874	24879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008312	CTT	2	6	24938	24943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008312	ATTA	2	8	24990	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	113473953
574	NC_008312	GGGC	2	8	25015	25022	0 %	0 %	75 %	25 %	113473953
575	NC_008312	TAA	2	6	25027	25032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473953
576	NC_008312	A	6	6	25061	25066	100 %	0 %	0 %	0 %	113473953
577	NC_008312	TAA	2	6	25082	25087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473953
578	NC_008312	TGA	2	6	25088	25093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473953
579	NC_008312	T	7	7	25133	25139	0 %	100 %	0 %	0 %	113473953
580	NC_008312	T	7	7	25181	25187	0 %	100 %	0 %	0 %	113473953
581	NC_008312	ATT	2	6	25341	25346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008312	TAACTA	2	12	25347	25358	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
583	NC_008312	TAAT	2	8	25361	25368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008312	AAT	2	6	25379	25384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008312	CTT	2	6	25406	25411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008312	AT	3	6	25433	25438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008312	CTT	3	9	25464	25472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473954
588	NC_008312	T	6	6	25471	25476	0 %	100 %	0 %	0 %	113473954
589	NC_008312	AATC	2	8	25566	25573	50 %	25 %	0 %	25 %	113473954
590	NC_008312	GTC	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473954
591	NC_008312	ATA	2	6	25679	25684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473954
592	NC_008312	TCAGCA	2	12	25688	25699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113473954
593	NC_008312	TGG	2	6	25726	25731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473954
594	NC_008312	CATACC	2	12	25759	25770	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
595	NC_008312	CATACC	2	12	25801	25812	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
596	NC_008312	CATACC	2	12	25843	25854	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
597	NC_008312	CATACC	2	12	25885	25896	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
598	NC_008312	CATACC	2	12	25927	25938	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
599	NC_008312	CATACC	2	12	25969	25980	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
600	NC_008312	CATACC	2	12	26011	26022	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
601	NC_008312	CATACC	2	12	26053	26064	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
602	NC_008312	CATACC	2	12	26095	26106	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
603	NC_008312	CATACC	2	12	26137	26148	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
604	NC_008312	CATACC	2	12	26179	26190	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
605	NC_008312	CATACC	2	12	26263	26274	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
606	NC_008312	CATACC	2	12	26305	26316	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
607	NC_008312	CAT	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
608	NC_008312	ATC	2	6	26807	26812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
609	NC_008312	CCTCAG	2	12	26871	26882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113473954
610	NC_008312	ATC	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
611	NC_008312	GAC	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113473954
612	NC_008312	AACT	2	8	26991	26998	50 %	25 %	0 %	25 %	113473954
613	NC_008312	TGA	2	6	27000	27005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473954
614	NC_008312	CAATC	2	10	27015	27024	40 %	20 %	0 %	40 %	113473954
615	NC_008312	TCA	2	6	27164	27169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
616	NC_008312	CAT	2	6	27225	27230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
617	NC_008312	CCT	2	6	27254	27259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113473954
618	NC_008312	CTT	2	6	27273	27278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473954
619	NC_008312	TCA	2	6	27383	27388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
620	NC_008312	TGA	2	6	27391	27396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473954
621	NC_008312	A	8	8	27396	27403	100 %	0 %	0 %	0 %	113473954
622	NC_008312	TCA	2	6	27404	27409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
623	NC_008312	ATT	2	6	27412	27417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473954
624	NC_008312	TTC	2	6	27418	27423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473954
625	NC_008312	T	6	6	27437	27442	0 %	100 %	0 %	0 %	113473954
626	NC_008312	ATT	2	6	27493	27498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473954
627	NC_008312	CTG	2	6	27519	27524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473954
628	NC_008312	CTG	2	6	27548	27553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473954
629	NC_008312	GA	3	6	27558	27563	50 %	0 %	50 %	0 %	113473954
630	NC_008312	TCT	2	6	27608	27613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473954
631	NC_008312	T	6	6	27653	27658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008312	TTA	2	6	27699	27704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008312	AAT	2	6	27707	27712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008312	GTC	2	6	27858	27863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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