MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_007520	TGC	2	6	2423166	2423171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486532
47502	NC_007520	TTG	2	6	2423183	2423188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486532
47503	NC_007520	AGTC	2	8	2423325	2423332	25 %	25 %	25 %	25 %	78486533
47504	NC_007520	TCT	2	6	2423376	2423381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486533
47505	NC_007520	TTC	2	6	2423398	2423403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486533
47506	NC_007520	TCA	2	6	2423408	2423413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486533
47507	NC_007520	CTT	2	6	2423493	2423498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486533
47508	NC_007520	GAT	2	6	2423583	2423588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78486533
47509	NC_007520	ATT	2	6	2423639	2423644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486534
47510	NC_007520	TGT	2	6	2423702	2423707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486534
47511	NC_007520	CCGG	2	8	2423731	2423738	0 %	0 %	50 %	50 %	78486534
47512	NC_007520	GAA	2	6	2423739	2423744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78486534
47513	NC_007520	GAA	2	6	2423748	2423753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78486534
47514	NC_007520	TTG	2	6	2423790	2423795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486534
47515	NC_007520	CATC	2	8	2423801	2423808	25 %	25 %	0 %	50 %	78486534
47516	NC_007520	TGT	2	6	2423830	2423835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486534
47517	NC_007520	ATC	2	6	2423895	2423900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47518	NC_007520	ACCC	2	8	2423999	2424006	25 %	0 %	0 %	75 %	78486534
47519	NC_007520	TCT	2	6	2424022	2424027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486534
47520	NC_007520	TCA	2	6	2424038	2424043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47521	NC_007520	T	6	6	2424044	2424049	0 %	100 %	0 %	0 %	78486534
47522	NC_007520	TTTC	2	8	2424080	2424087	0 %	75 %	0 %	25 %	78486534
47523	NC_007520	CTT	2	6	2424111	2424116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486534
47524	NC_007520	AAC	2	6	2424160	2424165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78486534
47525	NC_007520	TAA	2	6	2424183	2424188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486534
47526	NC_007520	GAT	2	6	2424189	2424194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78486534
47527	NC_007520	CCA	2	6	2424212	2424217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486534
47528	NC_007520	T	6	6	2424227	2424232	0 %	100 %	0 %	0 %	78486534
47529	NC_007520	AAT	2	6	2424258	2424263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486534
47530	NC_007520	T	6	6	2424308	2424313	0 %	100 %	0 %	0 %	78486534
47531	NC_007520	AAT	2	6	2424327	2424332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486534
47532	NC_007520	TGAC	2	8	2424366	2424373	25 %	25 %	25 %	25 %	78486534
47533	NC_007520	CAT	2	6	2424422	2424427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47534	NC_007520	ATA	2	6	2424441	2424446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486534
47535	NC_007520	ACC	2	6	2424513	2424518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486534
47536	NC_007520	TTGC	2	8	2424543	2424550	0 %	50 %	25 %	25 %	78486534
47537	NC_007520	ATC	2	6	2424555	2424560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47538	NC_007520	CAT	2	6	2424596	2424601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47539	NC_007520	CAT	2	6	2424627	2424632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47540	NC_007520	TG	3	6	2424700	2424705	0 %	50 %	50 %	0 %	78486534
47541	NC_007520	CAT	2	6	2424924	2424929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47542	NC_007520	ATC	2	6	2424969	2424974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47543	NC_007520	CGC	2	6	2424978	2424983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78486534
47544	NC_007520	CAC	2	6	2425013	2425018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486534
47545	NC_007520	TTTGGC	2	12	2425083	2425094	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78486534
47546	NC_007520	GGC	2	6	2425198	2425203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78486534
47547	NC_007520	ACC	2	6	2425271	2425276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486534
47548	NC_007520	TCA	2	6	2425292	2425297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486534
47549	NC_007520	CT	3	6	2425400	2425405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47550	NC_007520	T	6	6	2425439	2425444	0 %	100 %	0 %	0 %	78486535
47551	NC_007520	T	6	6	2425479	2425484	0 %	100 %	0 %	0 %	78486535
47552	NC_007520	TCG	2	6	2425549	2425554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486535
47553	NC_007520	TC	3	6	2425608	2425613	0 %	50 %	0 %	50 %	78486535
47554	NC_007520	CGGA	2	8	2425705	2425712	25 %	0 %	50 %	25 %	78486535
47555	NC_007520	GA	4	8	2425779	2425786	50 %	0 %	50 %	0 %	78486535
47556	NC_007520	GTT	2	6	2425891	2425896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486535
47557	NC_007520	ACG	2	6	2425942	2425947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78486536
47558	NC_007520	GC	3	6	2426009	2426014	0 %	0 %	50 %	50 %	78486536
47559	NC_007520	CTT	2	6	2426071	2426076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47560	NC_007520	CTT	2	6	2426105	2426110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47561	NC_007520	T	6	6	2426134	2426139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47562	NC_007520	ATTTT	2	10	2426196	2426205	20 %	80 %	0 %	0 %	78486537
47563	NC_007520	TC	3	6	2426224	2426229	0 %	50 %	0 %	50 %	78486537
47564	NC_007520	CTT	2	6	2426242	2426247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486537
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47575	NC_007520	CGTC	2	8	2426792	2426799	0 %	25 %	25 %	50 %	78486538
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47579	NC_007520	GC	3	6	2426906	2426911	0 %	0 %	50 %	50 %	78486538
47580	NC_007520	TTA	2	6	2426965	2426970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486538
47581	NC_007520	CAACC	2	10	2426977	2426986	40 %	0 %	0 %	60 %	78486538
47582	NC_007520	GCA	2	6	2427041	2427046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78486538
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47585	NC_007520	TA	4	8	2427232	2427239	50 %	50 %	0 %	0 %	78486538
47586	NC_007520	T	6	6	2427274	2427279	0 %	100 %	0 %	0 %	78486538
47587	NC_007520	GGC	2	6	2427294	2427299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78486538
47588	NC_007520	CTG	2	6	2427349	2427354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486538
47589	NC_007520	ATT	2	6	2427355	2427360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486538
47590	NC_007520	A	6	6	2427386	2427391	100 %	0 %	0 %	0 %	78486538
47591	NC_007520	TTAA	2	8	2427392	2427399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47592	NC_007520	CAA	2	6	2427430	2427435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47593	NC_007520	CAA	2	6	2427475	2427480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47594	NC_007520	T	6	6	2427502	2427507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47595	NC_007520	GCTT	2	8	2427550	2427557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47596	NC_007520	CGA	2	6	2427591	2427596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47597	NC_007520	GTCG	2	8	2427613	2427620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47598	NC_007520	CAC	2	6	2427635	2427640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47599	NC_007520	AAAC	2	8	2427641	2427648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47600	NC_007520	TTAA	2	8	2427668	2427675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47601	NC_007520	AAT	2	6	2427676	2427681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47602	NC_007520	AACAA	2	10	2427698	2427707	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.