MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36003	NC_007520	CATTA	2	10	1829530	1829539	40 %	40 %	0 %	20 %	78486016
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36005	NC_007520	TTTA	2	8	1829639	1829646	25 %	75 %	0 %	0 %	78486017
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36013	NC_007520	AAC	2	6	1830077	1830082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78486017
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36243	NC_007520	TC	3	6	1841339	1841344	0 %	50 %	0 %	50 %	78486028
36244	NC_007520	AAATC	2	10	1841383	1841392	60 %	20 %	0 %	20 %	78486028
36245	NC_007520	CAT	2	6	1841516	1841521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486028
36246	NC_007520	GT	3	6	1841531	1841536	0 %	50 %	50 %	0 %	78486028
36247	NC_007520	AAGC	2	8	1841554	1841561	50 %	0 %	25 %	25 %	78486028
36248	NC_007520	TCA	2	6	1841604	1841609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486028
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36250	NC_007520	TAA	2	6	1841653	1841658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486028
36251	NC_007520	ATGA	2	8	1841777	1841784	50 %	25 %	25 %	0 %	78486028
36252	NC_007520	T	6	6	1841794	1841799	0 %	100 %	0 %	0 %	78486028
36253	NC_007520	CAT	2	6	1841836	1841841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486028
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36255	NC_007520	CAA	2	6	1841975	1841980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78486028
36256	NC_007520	TGC	2	6	1841988	1841993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486028
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36260	NC_007520	CTG	2	6	1842205	1842210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486029
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36262	NC_007520	TCAG	2	8	1842308	1842315	25 %	25 %	25 %	25 %	78486029
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36267	NC_007520	ATG	2	6	1842757	1842762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78486029
36268	NC_007520	TCAA	2	8	1842857	1842864	50 %	25 %	0 %	25 %	78486029
36269	NC_007520	TG	3	6	1842879	1842884	0 %	50 %	50 %	0 %	78486029
36270	NC_007520	TTA	2	6	1842986	1842991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486029
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36272	NC_007520	AT	3	6	1843166	1843171	50 %	50 %	0 %	0 %	78486029
36273	NC_007520	TTC	2	6	1843265	1843270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486029
36274	NC_007520	TCT	2	6	1843286	1843291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486029
36275	NC_007520	TC	3	6	1843323	1843328	0 %	50 %	0 %	50 %	78486030
36276	NC_007520	AT	3	6	1843329	1843334	50 %	50 %	0 %	0 %	78486030
36277	NC_007520	GGT	2	6	1843501	1843506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78486030
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36283	NC_007520	ACGA	2	8	1843849	1843856	50 %	0 %	25 %	25 %	78486030
36284	NC_007520	ACC	2	6	1843913	1843918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486030
36285	NC_007520	TCT	2	6	1843929	1843934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486030
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36288	NC_007520	AG	3	6	1844084	1844089	50 %	0 %	50 %	0 %	78486030
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36293	NC_007520	AGG	2	6	1844240	1844245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78486030
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36295	NC_007520	TCA	2	6	1844371	1844376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486030
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36304	NC_007520	ACC	2	6	1844828	1844833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486031
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36306	NC_007520	TAACG	2	10	1844861	1844870	40 %	20 %	20 %	20 %	78486031
36307	NC_007520	GC	3	6	1844883	1844888	0 %	0 %	50 %	50 %	78486031
36308	NC_007520	TTTC	2	8	1844911	1844918	0 %	75 %	0 %	25 %	78486031
36309	NC_007520	TGA	2	6	1844940	1844945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78486031
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36312	NC_007520	CTT	2	6	1845166	1845171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36313	NC_007520	TTG	2	6	1845243	1845248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486032
36314	NC_007520	TGT	2	6	1845367	1845372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486032
36315	NC_007520	A	6	6	1845427	1845432	100 %	0 %	0 %	0 %	78486032
36316	NC_007520	AT	3	6	1845464	1845469	50 %	50 %	0 %	0 %	78486032
36317	NC_007520	CTTGTT	2	12	1845470	1845481	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	78486032
36318	NC_007520	A	7	7	1845550	1845556	100 %	0 %	0 %	0 %	78486032
36319	NC_007520	A	6	6	1845582	1845587	100 %	0 %	0 %	0 %	78486032
36320	NC_007520	TTCTA	2	10	1845603	1845612	20 %	60 %	0 %	20 %	78486032
36321	NC_007520	TTGAC	2	10	1845699	1845708	20 %	40 %	20 %	20 %	78486032
36322	NC_007520	CTT	2	6	1845727	1845732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486032
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36327	NC_007520	CAA	2	6	1845934	1845939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78486032
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36330	NC_007520	T	6	6	1846133	1846138	0 %	100 %	0 %	0 %	78486032
36331	NC_007520	TTG	2	6	1846142	1846147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78486032
36332	NC_007520	ATT	2	6	1846164	1846169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486033
36333	NC_007520	CAA	2	6	1846243	1846248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78486033
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36336	NC_007520	ATC	2	6	1846423	1846428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486033
36337	NC_007520	TCA	2	6	1846460	1846465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78486033
36338	NC_007520	CCGG	2	8	1846496	1846503	0 %	0 %	50 %	50 %	78486033
36339	NC_007520	TTTC	2	8	1846530	1846537	0 %	75 %	0 %	25 %	78486033
36340	NC_007520	GCA	2	6	1846662	1846667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78486033
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36342	NC_007520	CCA	2	6	1846767	1846772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78486033
36343	NC_007520	CT	3	6	1846846	1846851	0 %	50 %	0 %	50 %	78486033
36344	NC_007520	AGAT	2	8	1846878	1846885	50 %	25 %	25 %	0 %	78486033
36345	NC_007520	T	7	7	1846898	1846904	0 %	100 %	0 %	0 %	78486033
36346	NC_007520	T	6	6	1846916	1846921	0 %	100 %	0 %	0 %	78486033
36347	NC_007520	TGC	2	6	1846925	1846930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486033
36348	NC_007520	TAT	2	6	1846986	1846991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486033
36349	NC_007520	CAAC	2	8	1847079	1847086	50 %	0 %	0 %	50 %	78486033
36350	NC_007520	AAT	2	6	1847113	1847118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486033
36351	NC_007520	GCT	2	6	1847229	1847234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486033
36352	NC_007520	TGCA	2	8	1847281	1847288	25 %	25 %	25 %	25 %	78486033
36353	NC_007520	AGA	2	6	1847296	1847301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78486033
36354	NC_007520	CG	3	6	1847315	1847320	0 %	0 %	50 %	50 %	78486033
36355	NC_007520	CTT	2	6	1847382	1847387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486033
36356	NC_007520	A	7	7	1847390	1847396	100 %	0 %	0 %	0 %	78486033
36357	NC_007520	AAC	2	6	1847417	1847422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78486033
36358	NC_007520	TGC	2	6	1847603	1847608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486033
36359	NC_007520	GCT	2	6	1847679	1847684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78486033
36360	NC_007520	AAT	2	6	1847704	1847709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486033
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36362	NC_007520	ATT	2	6	1847734	1847739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78486033
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36483	NC_007520	CTT	2	6	1853944	1853949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78486038
36484	NC_007520	TCAA	2	8	1853991	1853998	50 %	25 %	0 %	25 %	78486038
36485	NC_007520	GAA	2	6	1854057	1854062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78486038
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36487	NC_007520	AAAC	2	8	1854191	1854198	75 %	0 %	0 %	25 %	78486038
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36491	NC_007520	TAA	2	6	1854506	1854511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78486038
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