MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007520	TTA	2	6	154920	154925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484467
3002	NC_007520	GA	3	6	155023	155028	50 %	0 %	50 %	0 %	78484467
3003	NC_007520	T	7	7	155077	155083	0 %	100 %	0 %	0 %	78484467
3004	NC_007520	CAT	2	6	155134	155139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484467
3005	NC_007520	GTT	2	6	155143	155148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484467
3006	NC_007520	ATT	2	6	155227	155232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484467
3007	NC_007520	ATG	2	6	155280	155285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484467
3008	NC_007520	GAT	2	6	155351	155356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484467
3009	NC_007520	GTT	2	6	155368	155373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484467
3010	NC_007520	GTTT	2	8	155460	155467	0 %	75 %	25 %	0 %	78484467
3011	NC_007520	GAATT	2	10	155516	155525	40 %	40 %	20 %	0 %	78484467
3012	NC_007520	TGA	2	6	155527	155532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484467
3013	NC_007520	GCC	2	6	155588	155593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484467
3014	NC_007520	TGA	2	6	155720	155725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_007520	ATG	2	6	155727	155732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_007520	A	7	7	155737	155743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_007520	T	6	6	155761	155766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_007520	CTT	2	6	155945	155950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484468
3019	NC_007520	TCTG	2	8	155958	155965	0 %	50 %	25 %	25 %	78484468
3020	NC_007520	AC	3	6	155978	155983	50 %	0 %	0 %	50 %	78484468
3021	NC_007520	TCA	2	6	156037	156042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484468
3022	NC_007520	TCCAA	2	10	156053	156062	40 %	20 %	0 %	40 %	78484468
3023	NC_007520	CCG	2	6	156109	156114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484468
3024	NC_007520	CGA	2	6	156173	156178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484468
3025	NC_007520	CGC	2	6	156230	156235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484468
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3027	NC_007520	CAT	2	6	156354	156359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484468
3028	NC_007520	GCC	2	6	156390	156395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484468
3029	NC_007520	GAAC	2	8	156524	156531	50 %	0 %	25 %	25 %	78484468
3030	NC_007520	T	7	7	156534	156540	0 %	100 %	0 %	0 %	78484468
3031	NC_007520	TTA	2	6	156709	156714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484468
3032	NC_007520	CAT	2	6	156789	156794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484468
3033	NC_007520	GCA	2	6	156924	156929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_007520	A	6	6	156939	156944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_007520	CAGTT	2	10	157007	157016	20 %	40 %	20 %	20 %	78484469
3036	NC_007520	A	6	6	157088	157093	100 %	0 %	0 %	0 %	78484469
3037	NC_007520	TTCC	2	8	157119	157126	0 %	50 %	0 %	50 %	78484469
3038	NC_007520	CGT	2	6	157186	157191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484469
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3041	NC_007520	ATTC	2	8	157398	157405	25 %	50 %	0 %	25 %	78484469
3042	NC_007520	GGT	2	6	157406	157411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484469
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3044	NC_007520	TCA	2	6	157514	157519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484469
3045	NC_007520	AGTTA	2	10	157549	157558	40 %	40 %	20 %	0 %	78484469
3046	NC_007520	G	6	6	157647	157652	0 %	0 %	100 %	0 %	78484469
3047	NC_007520	TTGT	2	8	157675	157682	0 %	75 %	25 %	0 %	78484469
3048	NC_007520	AAT	2	6	157687	157692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484469
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3051	NC_007520	GCGT	2	8	157763	157770	0 %	25 %	50 %	25 %	78484469
3052	NC_007520	A	6	6	157801	157806	100 %	0 %	0 %	0 %	78484469
3053	NC_007520	AGA	2	6	157944	157949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_007520	A	6	6	157953	157958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_007520	A	6	6	157979	157984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_007520	T	6	6	158001	158006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_007520	TACT	2	8	158044	158051	25 %	50 %	0 %	25 %	78484470
3058	NC_007520	CAA	2	6	158100	158105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484470
3059	NC_007520	GAA	2	6	158122	158127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484470
3060	NC_007520	AAC	2	6	158260	158265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484470
3061	NC_007520	ATG	2	6	158297	158302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484470
3062	NC_007520	TAT	2	6	158314	158319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_007520	A	6	6	158424	158429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_007520	A	6	6	158450	158455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_007520	ATC	2	6	158472	158477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_007520	AATT	2	8	158478	158485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_007520	TCA	2	6	158578	158583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484471
3068	NC_007520	TTGGTT	2	12	158584	158595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484471
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3070	NC_007520	TCA	2	6	158686	158691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484471
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3072	NC_007520	TAC	2	6	158768	158773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484471
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3074	NC_007520	C	8	8	158948	158955	0 %	0 %	0 %	100 %	78484471
3075	NC_007520	TAT	2	6	158987	158992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484471
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3083	NC_007520	TGC	2	6	159353	159358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484471
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3089	NC_007520	TCT	2	6	159670	159675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484471
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3093	NC_007520	T	7	7	159788	159794	0 %	100 %	0 %	0 %	78484471
3094	NC_007520	AATTG	2	10	159836	159845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_007520	GAT	2	6	159876	159881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_007520	GGA	2	6	159929	159934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_007520	TGG	2	6	160055	160060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484472
3098	NC_007520	TCA	2	6	160074	160079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484472
3099	NC_007520	TTAGC	2	10	160084	160093	20 %	40 %	20 %	20 %	78484472
3100	NC_007520	CAC	2	6	160164	160169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484472
3101	NC_007520	CTA	2	6	160183	160188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484472
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3103	NC_007520	TGT	2	6	160249	160254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484472
3104	NC_007520	GTA	2	6	160265	160270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_007520	TC	3	6	160288	160293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_007520	GAA	2	6	160344	160349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_007520	ATT	2	6	160454	160459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_007520	T	6	6	160501	160506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_007520	TCGG	2	8	160549	160556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_007520	TCTG	2	8	160564	160571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_007520	GT	3	6	160587	160592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_007520	TAA	2	6	160645	160650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_007520	AT	3	6	160691	160696	50 %	50 %	0 %	0 %	78484473
3114	NC_007520	ATG	2	6	160709	160714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484473
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3116	NC_007520	GGC	2	6	160872	160877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484473
3117	NC_007520	TGCG	2	8	160886	160893	0 %	25 %	50 %	25 %	78484473
3118	NC_007520	CA	3	6	160974	160979	50 %	0 %	0 %	50 %	78484473
3119	NC_007520	GCTGGA	2	12	161064	161075	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78484473
3120	NC_007520	AGA	2	6	161127	161132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484473
3121	NC_007520	CGT	2	6	161137	161142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484473
3122	NC_007520	CAT	2	6	161146	161151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484473
3123	NC_007520	GAA	2	6	161209	161214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484473
3124	NC_007520	TGG	2	6	161234	161239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484473
3125	NC_007520	TGG	2	6	161330	161335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484473
3126	NC_007520	GCGG	2	8	161396	161403	0 %	0 %	75 %	25 %	78484473
3127	NC_007520	TTG	2	6	161411	161416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484473
3128	NC_007520	ATGG	2	8	161438	161445	25 %	25 %	50 %	0 %	78484473
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3158	NC_007520	A	6	6	163111	163116	100 %	0 %	0 %	0 %	78484474
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3161	NC_007520	TGG	2	6	163204	163209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484474
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3164	NC_007520	GTT	2	6	163332	163337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484474
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3215	NC_007520	T	7	7	166557	166563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3216	NC_007520	T	6	6	166574	166579	0 %	100 %	0 %	0 %	78484478
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