MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007520	TA	3	6	589029	589034	50 %	50 %	0 %	0 %	78484871
11502	NC_007520	A	6	6	589093	589098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_007520	CTT	2	6	589105	589110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_007520	CGC	3	9	589172	589180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484872
11505	NC_007520	TCAGC	2	10	589208	589217	20 %	20 %	20 %	40 %	78484872
11506	NC_007520	GC	3	6	589230	589235	0 %	0 %	50 %	50 %	78484872
11507	NC_007520	GC	3	6	589261	589266	0 %	0 %	50 %	50 %	78484872
11508	NC_007520	CGAA	2	8	589374	589381	50 %	0 %	25 %	25 %	78484872
11509	NC_007520	TTC	2	6	589482	589487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484872
11510	NC_007520	TCA	2	6	589495	589500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484872
11511	NC_007520	TGC	2	6	589613	589618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484872
11512	NC_007520	GAT	2	6	589637	589642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484872
11513	NC_007520	TGG	2	6	589649	589654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484872
11514	NC_007520	GCT	2	6	589732	589737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484872
11515	NC_007520	TCA	2	6	589768	589773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484872
11516	NC_007520	TCT	2	6	589891	589896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484872
11517	NC_007520	GCC	2	6	589950	589955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484872
11518	NC_007520	T	6	6	589980	589985	0 %	100 %	0 %	0 %	78484872
11519	NC_007520	CTT	2	6	589994	589999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484872
11520	NC_007520	CCCTGT	2	12	590035	590046	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78484872
11521	NC_007520	AAT	2	6	590099	590104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484872
11522	NC_007520	GTT	2	6	590138	590143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484872
11523	NC_007520	TGA	2	6	590248	590253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_007520	GAA	2	6	590271	590276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_007520	GCCAA	2	10	590280	590289	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11526	NC_007520	AAC	2	6	590290	590295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_007520	AATG	2	8	590303	590310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_007520	A	6	6	590325	590330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_007520	T	6	6	590364	590369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_007520	GGA	2	6	590457	590462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_007520	T	7	7	590472	590478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_007520	A	6	6	590480	590485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_007520	A	6	6	590500	590505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_007520	TCA	2	6	590522	590527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_007520	T	6	6	590674	590679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_007520	A	7	7	590800	590806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_007520	ACTT	2	8	590848	590855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11538	NC_007520	TAG	2	6	590886	590891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11540	NC_007520	AT	3	6	590946	590951	50 %	50 %	0 %	0 %	78484873
11541	NC_007520	TTC	2	6	590975	590980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484873
11542	NC_007520	TCT	2	6	591060	591065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484873
11543	NC_007520	T	6	6	591076	591081	0 %	100 %	0 %	0 %	78484873
11544	NC_007520	TTC	2	6	591104	591109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484873
11545	NC_007520	ATC	2	6	591215	591220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484873
11546	NC_007520	TCT	3	9	591363	591371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484873
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11548	NC_007520	TGTGCT	2	12	591438	591449	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78484873
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11550	NC_007520	T	7	7	591517	591523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_007520	ATA	2	6	591539	591544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_007520	TAA	2	6	591556	591561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_007520	TTTA	2	8	591607	591614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_007520	GT	3	6	591659	591664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_007520	T	7	7	591722	591728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_007520	TCAT	2	8	591773	591780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11557	NC_007520	CGA	2	6	591805	591810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11559	NC_007520	ATTT	2	8	591928	591935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_007520	TTG	2	6	591946	591951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_007520	CGA	2	6	592021	592026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_007520	GGAA	2	8	592051	592058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_007520	CAT	2	6	592331	592336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484874
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11566	NC_007520	TGA	2	6	592465	592470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484874
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11568	NC_007520	TGT	2	6	592608	592613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484874
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11578	NC_007520	TTGA	2	8	593135	593142	25 %	50 %	25 %	0 %	78484874
11579	NC_007520	TGC	2	6	593151	593156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484874
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11585	NC_007520	GCT	2	6	593423	593428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484874
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11589	NC_007520	GAT	2	6	593720	593725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484874
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11591	NC_007520	TGGAA	2	10	593824	593833	40 %	20 %	40 %	0 %	78484874
11592	NC_007520	AATG	2	8	593911	593918	50 %	25 %	25 %	0 %	78484874
11593	NC_007520	GGC	2	6	593980	593985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484874
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11595	NC_007520	TTCGA	2	10	594283	594292	20 %	40 %	20 %	20 %	78484874
11596	NC_007520	GGT	2	6	594336	594341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484875
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11598	NC_007520	A	7	7	594376	594382	100 %	0 %	0 %	0 %	78484875
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11602	NC_007520	TTTG	2	8	594533	594540	0 %	75 %	25 %	0 %	78484875
11603	NC_007520	CGG	2	6	594541	594546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484875
11604	NC_007520	GCGCG	2	10	594556	594565	0 %	0 %	60 %	40 %	78484875
11605	NC_007520	GAA	2	6	594573	594578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484875
11606	NC_007520	A	6	6	594589	594594	100 %	0 %	0 %	0 %	78484875
11607	NC_007520	TGCA	2	8	594669	594676	25 %	25 %	25 %	25 %	78484876
11608	NC_007520	TTA	2	6	594685	594690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484876
11609	NC_007520	GTT	2	6	594713	594718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484876
11610	NC_007520	ATC	2	6	594772	594777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484876
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11616	NC_007520	AT	3	6	595211	595216	50 %	50 %	0 %	0 %	78484876
11617	NC_007520	CAG	2	6	595439	595444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484877
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11620	NC_007520	T	6	6	595554	595559	0 %	100 %	0 %	0 %	78484877
11621	NC_007520	CTT	3	9	595565	595573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484877
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11623	NC_007520	GCA	2	6	595738	595743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484877
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12000	NC_007520	AGA	2	6	613625	613630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484893

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