MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007404	CGC	2	6	144400	144405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316153
4002	NC_007404	CG	3	6	144414	144419	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4003	NC_007404	GGC	2	6	144424	144429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316153
4004	NC_007404	CGT	2	6	144457	144462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4005	NC_007404	GC	3	6	144517	144522	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4006	NC_007404	CGA	2	6	144550	144555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4007	NC_007404	TGCGC	2	10	144637	144646	0 %	20 %	40 %	40 %	74316153
4008	NC_007404	GC	3	6	144648	144653	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4009	NC_007404	CGC	2	6	144686	144691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316153
4010	NC_007404	GCG	2	6	144709	144714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316153
4011	NC_007404	GGCG	2	8	144721	144728	0 %	0 %	75 %	25 %	74316153
4012	NC_007404	CGA	2	6	144790	144795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4013	NC_007404	GC	3	6	144815	144820	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4014	NC_007404	GC	4	8	144832	144839	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4015	NC_007404	GCC	2	6	144867	144872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316153
4016	NC_007404	GCG	2	6	144874	144879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316153
4017	NC_007404	CGG	2	6	144901	144906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316153
4018	NC_007404	GC	3	6	144966	144971	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4019	NC_007404	GCG	2	6	144973	144978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316153
4020	NC_007404	CG	4	8	145048	145055	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4021	NC_007404	CGA	2	6	145084	145089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4022	NC_007404	GAC	2	6	145097	145102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4023	NC_007404	AGCGCG	2	12	145119	145130	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316153
4024	NC_007404	GCAG	2	8	145131	145138	25 %	0 %	50 %	25 %	74316153
4025	NC_007404	CAG	3	9	145136	145144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4026	NC_007404	CG	4	8	145159	145166	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4027	NC_007404	CGA	3	9	145195	145203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4028	NC_007404	CGC	2	6	145211	145216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316153
4029	NC_007404	CGT	2	6	145342	145347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4030	NC_007404	CGA	2	6	145411	145416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4031	NC_007404	GCCG	2	8	145430	145437	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4032	NC_007404	CGA	2	6	145438	145443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4033	NC_007404	AGC	2	6	145449	145454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4034	NC_007404	GCTG	2	8	145474	145481	0 %	25 %	50 %	25 %	74316153
4035	NC_007404	TCG	2	6	145491	145496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4036	NC_007404	GTG	2	6	145502	145507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316153
4037	NC_007404	GC	4	8	145509	145516	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4038	NC_007404	CAG	2	6	145535	145540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4039	NC_007404	CAG	2	6	145565	145570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316153
4040	NC_007404	GCC	3	9	145579	145587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316153
4041	NC_007404	GC	4	8	145599	145606	0 %	0 %	50 %	50 %	74316153
4042	NC_007404	GCC	2	6	145625	145630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316154
4043	NC_007404	CGC	2	6	145641	145646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316154
4044	NC_007404	CGT	2	6	145662	145667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4045	NC_007404	TGC	2	6	145713	145718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4046	NC_007404	TTC	2	6	145747	145752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316154
4047	NC_007404	GCT	2	6	145780	145785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4048	NC_007404	GCA	2	6	145788	145793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4049	NC_007404	GCA	2	6	145800	145805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4050	NC_007404	GC	3	6	145858	145863	0 %	0 %	50 %	50 %	74316154
4051	NC_007404	CGC	2	6	145922	145927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316154
4052	NC_007404	GC	3	6	145942	145947	0 %	0 %	50 %	50 %	74316154
4053	NC_007404	TCG	2	6	145955	145960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4054	NC_007404	TCG	2	6	145985	145990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4055	NC_007404	CG	4	8	146031	146038	0 %	0 %	50 %	50 %	74316154
4056	NC_007404	CGC	2	6	146064	146069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316154
4057	NC_007404	CGC	2	6	146105	146110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316154
4058	NC_007404	GGT	2	6	146149	146154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316154
4059	NC_007404	CCG	2	6	146166	146171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316154
4060	NC_007404	CGT	2	6	146247	146252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316154
4061	NC_007404	GGC	2	6	146356	146361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316155
4062	NC_007404	GCC	2	6	146462	146467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316155
4063	NC_007404	CGC	2	6	146468	146473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316155
4064	NC_007404	GCA	2	6	146625	146630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316155
4065	NC_007404	CGG	2	6	146635	146640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316155
4066	NC_007404	GTTT	2	8	146683	146690	0 %	75 %	25 %	0 %	74316155
4067	NC_007404	CGC	2	6	146712	146717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316155
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4069	NC_007404	GC	3	6	146725	146730	0 %	0 %	50 %	50 %	74316155
4070	NC_007404	CCG	2	6	146735	146740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316155
4071	NC_007404	CCA	2	6	146784	146789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316155
4072	NC_007404	AGT	2	6	146808	146813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316155
4073	NC_007404	GTC	2	6	146818	146823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_007404	CTC	2	6	146824	146829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316156
4075	NC_007404	CTGA	2	8	146837	146844	25 %	25 %	25 %	25 %	74316156
4076	NC_007404	CGA	2	6	146851	146856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316156
4077	NC_007404	GC	3	6	146872	146877	0 %	0 %	50 %	50 %	74316156
4078	NC_007404	GCA	2	6	146890	146895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316156
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4080	NC_007404	GC	4	8	146948	146955	0 %	0 %	50 %	50 %	74316156
4081	NC_007404	GAC	2	6	146960	146965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316156
4082	NC_007404	GC	3	6	147067	147072	0 %	0 %	50 %	50 %	74316156
4083	NC_007404	CGC	2	6	147094	147099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316156
4084	NC_007404	GC	3	6	147098	147103	0 %	0 %	50 %	50 %	74316156
4085	NC_007404	CGCC	2	8	147127	147134	0 %	0 %	25 %	75 %	74316156
4086	NC_007404	GC	3	6	147178	147183	0 %	0 %	50 %	50 %	74316156
4087	NC_007404	CAG	3	9	147191	147199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316156
4088	NC_007404	TTGC	2	8	147258	147265	0 %	50 %	25 %	25 %	74316157
4089	NC_007404	CGC	2	6	147293	147298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316157
4090	NC_007404	TGG	2	6	147304	147309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316157
4091	NC_007404	GAG	2	6	147345	147350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316157
4092	NC_007404	CGA	2	6	147380	147385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316157
4093	NC_007404	CGCGAG	2	12	147450	147461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316157
4094	NC_007404	GAC	2	6	147468	147473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316157
4095	NC_007404	CGT	2	6	147524	147529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316157
4096	NC_007404	GGTG	2	8	147539	147546	0 %	25 %	75 %	0 %	74316157
4097	NC_007404	CGGAGC	2	12	147556	147567	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316157
4098	NC_007404	CG	3	6	147584	147589	0 %	0 %	50 %	50 %	74316157
4099	NC_007404	GCGT	2	8	147609	147616	0 %	25 %	50 %	25 %	74316157
4100	NC_007404	GCC	2	6	147649	147654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316157
4101	NC_007404	GCG	2	6	147658	147663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316157
4102	NC_007404	GCTG	2	8	147740	147747	0 %	25 %	50 %	25 %	74316157
4103	NC_007404	GCA	2	6	147788	147793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316157
4104	NC_007404	GCA	2	6	147797	147802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316157
4105	NC_007404	CGG	2	6	147817	147822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316157
4106	NC_007404	G	6	6	147827	147832	0 %	0 %	100 %	0 %	74316157
4107	NC_007404	GCA	2	6	147839	147844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316157
4108	NC_007404	CGG	2	6	147911	147916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316158
4109	NC_007404	GCA	2	6	147932	147937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316158
4110	NC_007404	CG	5	10	147944	147953	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4111	NC_007404	CGC	2	6	147972	147977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316158
4112	NC_007404	CG	3	6	147981	147986	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4113	NC_007404	GC	3	6	148008	148013	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4114	NC_007404	TCT	2	6	148025	148030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316158
4115	NC_007404	GTC	2	6	148035	148040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316158
4116	NC_007404	GAC	2	6	148077	148082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316158
4117	NC_007404	CG	3	6	148152	148157	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4118	NC_007404	GT	3	6	148255	148260	0 %	50 %	50 %	0 %	74316158
4119	NC_007404	GAT	2	6	148284	148289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316158
4120	NC_007404	GGC	2	6	148312	148317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316158
4121	NC_007404	CGA	2	6	148355	148360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316158
4122	NC_007404	CG	3	6	148394	148399	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4123	NC_007404	CG	3	6	148449	148454	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4124	NC_007404	CG	3	6	148457	148462	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4125	NC_007404	CGT	2	6	148509	148514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316158
4126	NC_007404	CG	4	8	148541	148548	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4127	NC_007404	GCGT	2	8	148701	148708	0 %	25 %	50 %	25 %	74316158
4128	NC_007404	GCC	2	6	148710	148715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316158
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4131	NC_007404	CG	3	6	148869	148874	0 %	0 %	50 %	50 %	74316158
4132	NC_007404	GTCG	2	8	148907	148914	0 %	25 %	50 %	25 %	74316158
4133	NC_007404	CGT	2	6	148943	148948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316158
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4181	NC_007404	GCT	2	6	150347	150352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4233	NC_007404	GTC	2	6	152209	152214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4234	NC_007404	CGGG	2	8	152280	152287	0 %	0 %	75 %	25 %	74316161
4235	NC_007404	GCT	2	6	152337	152342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
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4237	NC_007404	TCG	2	6	152432	152437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4238	NC_007404	CG	3	6	152440	152445	0 %	0 %	50 %	50 %	74316161
4239	NC_007404	GCT	2	6	152466	152471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4240	NC_007404	TCG	3	9	152486	152494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4241	NC_007404	CTG	4	12	152497	152508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4242	NC_007404	TCC	2	6	152549	152554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316161
4243	NC_007404	TGA	2	6	152612	152617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316161
4244	NC_007404	CGG	2	6	152622	152627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316161
4245	NC_007404	TCGCGA	2	12	152630	152641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4246	NC_007404	CGC	2	6	152658	152663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316161
4247	NC_007404	CGT	4	12	152664	152675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4248	NC_007404	CGT	2	6	152682	152687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4249	NC_007404	ACG	2	6	152702	152707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4250	NC_007404	CGGG	2	8	152717	152724	0 %	0 %	75 %	25 %	74316161
4251	NC_007404	GCA	2	6	152730	152735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4252	NC_007404	ATC	2	6	152791	152796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316161
4253	NC_007404	GCT	2	6	152814	152819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4254	NC_007404	GCT	3	9	152892	152900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4255	NC_007404	TGC	2	6	152933	152938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4256	NC_007404	GC	3	6	152943	152948	0 %	0 %	50 %	50 %	74316161
4257	NC_007404	CG	6	12	152977	152988	0 %	0 %	50 %	50 %	74316161
4258	NC_007404	GCT	2	6	153000	153005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
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4264	NC_007404	TTCC	2	8	153297	153304	0 %	50 %	0 %	50 %	74316161
4265	NC_007404	CGA	2	6	153357	153362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316161
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4272	NC_007404	CGC	2	6	153615	153620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316161
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4274	NC_007404	GGTC	2	8	153648	153655	0 %	25 %	50 %	25 %	74316161
4275	NC_007404	TGC	3	9	153656	153664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
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4278	NC_007404	TCG	2	6	153929	153934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316161
4279	NC_007404	CG	4	8	153954	153961	0 %	0 %	50 %	50 %	74316161
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4288	NC_007404	TGA	3	9	154121	154129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316161
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4305	NC_007404	GC	3	6	154897	154902	0 %	0 %	50 %	50 %	74316162
4306	NC_007404	CTG	2	6	154908	154913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316162
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4317	NC_007404	CGT	2	6	155309	155314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316162
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4323	NC_007404	GCT	2	6	155468	155473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316162
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4327	NC_007404	GAG	2	6	155571	155576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316162
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4329	NC_007404	CGCGG	2	10	155588	155597	0 %	0 %	60 %	40 %	74316162
4330	NC_007404	TGC	2	6	155632	155637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316162
4331	NC_007404	GACGC	2	10	155639	155648	20 %	0 %	40 %	40 %	74316162
4332	NC_007404	GGCGG	2	10	155657	155666	0 %	0 %	80 %	20 %	74316162
4333	NC_007404	CAG	2	6	155676	155681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316162
4334	NC_007404	CG	3	6	155708	155713	0 %	0 %	50 %	50 %	74316162
4335	NC_007404	CGC	2	6	155765	155770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316162
4336	NC_007404	GCG	3	9	155849	155857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4337	NC_007404	CTG	2	6	155887	155892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316163
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4341	NC_007404	TGC	2	6	156137	156142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316163
4342	NC_007404	ACG	2	6	156185	156190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316163
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4357	NC_007404	GTGC	2	8	156632	156639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4358	NC_007404	GGCGCG	2	12	156650	156661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4359	NC_007404	GGC	3	9	156677	156685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4360	NC_007404	GCC	2	6	156714	156719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4361	NC_007404	GCC	2	6	156726	156731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4362	NC_007404	GCC	2	6	156741	156746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316164
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4364	NC_007404	CGT	2	6	156956	156961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316164
4365	NC_007404	GCCTT	2	10	156967	156976	0 %	40 %	20 %	40 %	74316164
4366	NC_007404	CGC	3	9	157002	157010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316164
4367	NC_007404	GCA	2	6	157012	157017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316164
4368	NC_007404	GC	3	6	157019	157024	0 %	0 %	50 %	50 %	74316164
4369	NC_007404	TGC	2	6	157032	157037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316164
4370	NC_007404	CGG	2	6	157061	157066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316164
4371	NC_007404	CG	5	10	157086	157095	0 %	0 %	50 %	50 %	74316164
4372	NC_007404	GCCGC	2	10	157117	157126	0 %	0 %	40 %	60 %	74316164
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4374	NC_007404	CG	3	6	157140	157145	0 %	0 %	50 %	50 %	74316164
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4496	NC_007404	AGCG	2	8	162663	162670	25 %	0 %	50 %	25 %	74316170
4497	NC_007404	GGC	2	6	162710	162715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316170
4498	NC_007404	GAC	2	6	162737	162742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4499	NC_007404	GC	3	6	162780	162785	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4500	NC_007404	ATG	2	6	162804	162809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316170

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