MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_007404	GCCGAC	2	12	633346	633357	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	74316622
17003	NC_007404	TCG	2	6	633374	633379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316622
17004	NC_007404	CGC	2	6	633444	633449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316622
17005	NC_007404	GCA	2	6	633488	633493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316622
17006	NC_007404	CTT	2	6	633558	633563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316622
17007	NC_007404	GAA	2	6	633573	633578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316622
17008	NC_007404	GC	3	6	633593	633598	0 %	0 %	50 %	50 %	74316622
17009	NC_007404	CTGG	2	8	633614	633621	0 %	25 %	50 %	25 %	74316623
17010	NC_007404	CGC	2	6	633665	633670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316623
17011	NC_007404	CAG	2	6	633695	633700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316623
17012	NC_007404	T	7	7	633763	633769	0 %	100 %	0 %	0 %	74316623
17013	NC_007404	TGT	2	6	633775	633780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316623
17014	NC_007404	TGC	2	6	633803	633808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316624
17015	NC_007404	TGC	2	6	633827	633832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316624
17016	NC_007404	GCG	2	6	633861	633866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316624
17017	NC_007404	CG	3	6	633865	633870	0 %	0 %	50 %	50 %	74316624
17018	NC_007404	CGC	2	6	633914	633919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316624
17019	NC_007404	GCT	2	6	633939	633944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316624
17020	NC_007404	GTGC	2	8	634018	634025	0 %	25 %	50 %	25 %	74316624
17021	NC_007404	CG	3	6	634044	634049	0 %	0 %	50 %	50 %	74316624
17022	NC_007404	CG	3	6	634142	634147	0 %	0 %	50 %	50 %	74316624
17023	NC_007404	TGC	2	6	634220	634225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316624
17024	NC_007404	GGC	2	6	634233	634238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316624
17025	NC_007404	CG	3	6	634288	634293	0 %	0 %	50 %	50 %	74316624
17026	NC_007404	GC	3	6	634343	634348	0 %	0 %	50 %	50 %	74316624
17027	NC_007404	GGC	2	6	634441	634446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316624
17028	NC_007404	CGC	2	6	634497	634502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316624
17029	NC_007404	CGG	2	6	634539	634544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316624
17030	NC_007404	CGGCTA	2	12	634578	634589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74316624
17031	NC_007404	GCG	2	6	634595	634600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316624
17032	NC_007404	GCCAT	2	10	634631	634640	20 %	20 %	20 %	40 %	74316624
17033	NC_007404	ACG	2	6	634658	634663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316624
17034	NC_007404	CGGCT	2	10	634737	634746	0 %	20 %	40 %	40 %	74316624
17035	NC_007404	GCA	2	6	634773	634778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316625
17036	NC_007404	A	6	6	634778	634783	100 %	0 %	0 %	0 %	74316625
17037	NC_007404	CGT	3	9	634784	634792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316625
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17039	NC_007404	TCG	2	6	634831	634836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316625
17040	NC_007404	GACC	2	8	634844	634851	25 %	0 %	25 %	50 %	74316625
17041	NC_007404	GC	3	6	634852	634857	0 %	0 %	50 %	50 %	74316625
17042	NC_007404	CGT	2	6	634862	634867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316625
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17044	NC_007404	TGG	3	9	634903	634911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316625
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17051	NC_007404	GGCC	2	8	635176	635183	0 %	0 %	50 %	50 %	74316625
17052	NC_007404	CGC	2	6	635202	635207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316625
17053	NC_007404	GC	3	6	635206	635211	0 %	0 %	50 %	50 %	74316625
17054	NC_007404	CGC	2	6	635246	635251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316625
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17057	NC_007404	CTA	2	6	635297	635302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316625
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17061	NC_007404	GC	3	6	635440	635445	0 %	0 %	50 %	50 %	74316625
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17065	NC_007404	CCGA	2	8	635610	635617	25 %	0 %	25 %	50 %	74316625
17066	NC_007404	CGA	2	6	635624	635629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316625
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17076	NC_007404	AG	3	6	636237	636242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_007404	GAA	2	6	636262	636267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17089	NC_007404	TCG	2	6	636741	636746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316626
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17098	NC_007404	CCGC	2	8	637143	637150	0 %	0 %	25 %	75 %	74316626
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17106	NC_007404	CG	3	6	637453	637458	0 %	0 %	50 %	50 %	74316626
17107	NC_007404	CGC	2	6	637519	637524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316626
17108	NC_007404	GCT	2	6	637567	637572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316626
17109	NC_007404	GC	4	8	637577	637584	0 %	0 %	50 %	50 %	74316626
17110	NC_007404	GCGCG	2	10	637588	637597	0 %	0 %	60 %	40 %	74316626
17111	NC_007404	CGA	2	6	637633	637638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316626
17112	NC_007404	CAT	2	6	637690	637695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316626
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17115	NC_007404	CTGCG	2	10	637803	637812	0 %	20 %	40 %	40 %	74316626
17116	NC_007404	CGG	3	9	637843	637851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316626
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17121	NC_007404	TGC	2	6	637935	637940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316626
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17232	NC_007404	GC	3	6	641770	641775	0 %	0 %	50 %	50 %	74316630
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17241	NC_007404	GCCG	2	8	642041	642048	0 %	0 %	50 %	50 %	74316630
17242	NC_007404	GCG	2	6	642183	642188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316630
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17246	NC_007404	GAA	2	6	642368	642373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316630
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17253	NC_007404	GCG	2	6	642654	642659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17254	NC_007404	GCC	2	6	642743	642748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316631
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17261	NC_007404	GC	3	6	642896	642901	0 %	0 %	50 %	50 %	74316631
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17354	NC_007404	CGT	2	6	646072	646077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316634
17355	NC_007404	TGC	3	9	646099	646107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316634
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17358	NC_007404	GCG	2	6	646143	646148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316634
17359	NC_007404	CG	3	6	646154	646159	0 %	0 %	50 %	50 %	74316634
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17483	NC_007404	GCT	2	6	650345	650350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316636
17484	NC_007404	ACC	2	6	650419	650424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316636
17485	NC_007404	TCG	2	6	650443	650448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316636
17486	NC_007404	GTC	2	6	650487	650492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316636
17487	NC_007404	GGC	2	6	650529	650534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17488	NC_007404	CCCGCC	2	12	650604	650615	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
17489	NC_007404	GGTGG	2	10	650646	650655	0 %	20 %	80 %	0 %	74316637
17490	NC_007404	TTC	2	6	650657	650662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316637
17491	NC_007404	CGCTG	2	10	650693	650702	0 %	20 %	40 %	40 %	74316637
17492	NC_007404	CG	3	6	650710	650715	0 %	0 %	50 %	50 %	74316637
17493	NC_007404	CGA	2	6	650807	650812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316637
17494	NC_007404	GACC	2	8	650822	650829	25 %	0 %	25 %	50 %	74316637
17495	NC_007404	GC	4	8	650860	650867	0 %	0 %	50 %	50 %	74316637
17496	NC_007404	CAA	2	6	650879	650884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316637
17497	NC_007404	CGG	2	6	650945	650950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316637
17498	NC_007404	CGA	2	6	650978	650983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316637
17499	NC_007404	CGG	2	6	651041	651046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316637
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