MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007404	GC	3	6	560294	560299	0 %	0 %	50 %	50 %	74316553
15002	NC_007404	TCG	2	6	560319	560324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316553
15003	NC_007404	GC	3	6	560418	560423	0 %	0 %	50 %	50 %	74316553
15004	NC_007404	T	6	6	560474	560479	0 %	100 %	0 %	0 %	74316553
15005	NC_007404	GTC	2	6	560483	560488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316553
15006	NC_007404	CGG	2	6	560533	560538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316553
15007	NC_007404	GCG	2	6	560580	560585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316553
15008	NC_007404	G	6	6	560590	560595	0 %	0 %	100 %	0 %	74316553
15009	NC_007404	CG	3	6	560677	560682	0 %	0 %	50 %	50 %	74316554
15010	NC_007404	GC	3	6	560701	560706	0 %	0 %	50 %	50 %	74316554
15011	NC_007404	CAG	2	6	560712	560717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15012	NC_007404	GTC	2	6	560718	560723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15013	NC_007404	AGC	2	6	560776	560781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15014	NC_007404	GTGCG	2	10	560783	560792	0 %	20 %	60 %	20 %	74316554
15015	NC_007404	GCG	2	6	560821	560826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316554
15016	NC_007404	GAC	2	6	560829	560834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15017	NC_007404	CGC	2	6	560843	560848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316554
15018	NC_007404	TCG	2	6	560860	560865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15019	NC_007404	TCG	2	6	560879	560884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15020	NC_007404	CG	3	6	560888	560893	0 %	0 %	50 %	50 %	74316554
15021	NC_007404	CGCGG	2	10	560895	560904	0 %	0 %	60 %	40 %	74316554
15022	NC_007404	GATC	2	8	560921	560928	25 %	25 %	25 %	25 %	74316554
15023	NC_007404	AGCTCG	2	12	560944	560955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15024	NC_007404	CTG	2	6	560962	560967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15025	NC_007404	ATG	2	6	561052	561057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316554
15026	NC_007404	GCG	2	6	561076	561081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316554
15027	NC_007404	GC	3	6	561109	561114	0 %	0 %	50 %	50 %	74316554
15028	NC_007404	CAG	2	6	561144	561149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316554
15029	NC_007404	GCC	2	6	561201	561206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15030	NC_007404	GC	3	6	561266	561271	0 %	0 %	50 %	50 %	74316555
15031	NC_007404	CCGCG	2	10	561297	561306	0 %	0 %	40 %	60 %	74316555
15032	NC_007404	CGC	2	6	561317	561322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316555
15033	NC_007404	CGGCG	2	10	561384	561393	0 %	0 %	60 %	40 %	74316555
15034	NC_007404	CGT	2	6	561414	561419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316555
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15036	NC_007404	GC	3	6	561495	561500	0 %	0 %	50 %	50 %	74316555
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15038	NC_007404	GC	4	8	561529	561536	0 %	0 %	50 %	50 %	74316555
15039	NC_007404	CG	3	6	561549	561554	0 %	0 %	50 %	50 %	74316555
15040	NC_007404	TGA	2	6	561567	561572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316555
15041	NC_007404	CGC	2	6	561585	561590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316555
15042	NC_007404	GGCCGT	2	12	561609	561620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74316555
15043	NC_007404	CGAG	2	8	561621	561628	25 %	0 %	50 %	25 %	74316555
15044	NC_007404	CGT	2	6	561651	561656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316555
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15049	NC_007404	CGA	3	9	561815	561823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316556
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15051	NC_007404	CG	3	6	561882	561887	0 %	0 %	50 %	50 %	74316556
15052	NC_007404	CGA	2	6	561989	561994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316556
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15054	NC_007404	CGG	2	6	562016	562021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316556
15055	NC_007404	GCGTC	2	10	562067	562076	0 %	20 %	40 %	40 %	74316556
15056	NC_007404	CGC	2	6	562100	562105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316556
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15060	NC_007404	GGGT	2	8	562159	562166	0 %	25 %	75 %	0 %	74316556
15061	NC_007404	GC	3	6	562167	562172	0 %	0 %	50 %	50 %	74316556
15062	NC_007404	TCG	2	6	562177	562182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316556
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15077	NC_007404	CGC	2	6	562756	562761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15078	NC_007404	CGC	2	6	562767	562772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_007404	C	7	7	562805	562811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15081	NC_007404	CACC	2	8	562867	562874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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15085	NC_007404	CGA	2	6	563052	563057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316557
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15087	NC_007404	TGA	2	6	563132	563137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316557
15088	NC_007404	TTCGGC	2	12	563155	563166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
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15091	NC_007404	CAT	2	6	563256	563261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316557
15092	NC_007404	GTC	2	6	563268	563273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15093	NC_007404	GCT	2	6	563349	563354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15094	NC_007404	GTG	2	6	563371	563376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316557
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15101	NC_007404	TCG	2	6	563789	563794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15102	NC_007404	TCG	2	6	563822	563827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15103	NC_007404	GGCC	2	8	563854	563861	0 %	0 %	50 %	50 %	74316557
15104	NC_007404	GGCG	2	8	563895	563902	0 %	0 %	75 %	25 %	74316557
15105	NC_007404	GGC	2	6	563928	563933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316557
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15107	NC_007404	GCT	2	6	563970	563975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15108	NC_007404	CGC	2	6	563976	563981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316557
15109	NC_007404	GCT	2	6	564009	564014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15110	NC_007404	CTT	2	6	564043	564048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316557
15111	NC_007404	GC	3	6	564069	564074	0 %	0 %	50 %	50 %	74316557
15112	NC_007404	GC	3	6	564163	564168	0 %	0 %	50 %	50 %	74316557
15113	NC_007404	CG	3	6	564226	564231	0 %	0 %	50 %	50 %	74316557
15114	NC_007404	CGC	2	6	564291	564296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316557
15115	NC_007404	CGT	2	6	564318	564323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
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15118	NC_007404	CTCGC	2	10	564493	564502	0 %	20 %	20 %	60 %	74316557
15119	NC_007404	TGC	2	6	564512	564517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15120	NC_007404	GCGA	2	8	564604	564611	25 %	0 %	50 %	25 %	74316557
15121	NC_007404	CAG	2	6	564631	564636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316557
15122	NC_007404	AGCC	2	8	564637	564644	25 %	0 %	25 %	50 %	74316557
15123	NC_007404	CGG	2	6	564683	564688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316557
15124	NC_007404	GGT	2	6	564732	564737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316557
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15139	NC_007404	CGT	2	6	565347	565352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316558
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15145	NC_007404	A	7	7	565685	565691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15151	NC_007404	GCTG	2	8	565890	565897	0 %	25 %	50 %	25 %	74316559
15152	NC_007404	CG	3	6	565907	565912	0 %	0 %	50 %	50 %	74316559
15153	NC_007404	TGC	2	6	565940	565945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316559
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15235	NC_007404	GGC	3	9	568754	568762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316562
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15237	NC_007404	CAAC	2	8	568864	568871	50 %	0 %	0 %	50 %	74316562
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15241	NC_007404	CGA	2	6	569035	569040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316562
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15243	NC_007404	GGC	2	6	569101	569106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316562
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15365	NC_007404	AGC	2	6	573258	573263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316565
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15371	NC_007404	GCA	2	6	573400	573405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316565
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15375	NC_007404	CGA	2	6	573460	573465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316565
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15424	NC_007404	CGA	3	9	574929	574937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316567
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15482	NC_007404	GC	3	6	576915	576920	0 %	0 %	50 %	50 %	74316568
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15485	NC_007404	CCG	2	6	576965	576970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316568
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15487	NC_007404	CGG	2	6	576986	576991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316568
15488	NC_007404	GC	3	6	577002	577007	0 %	0 %	50 %	50 %	74316568
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