MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_007404	ATG	2	6	541902	541907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316530
14503	NC_007404	CG	3	6	541910	541915	0 %	0 %	50 %	50 %	74316530
14504	NC_007404	CG	3	6	541943	541948	0 %	0 %	50 %	50 %	74316530
14505	NC_007404	CGG	2	6	542003	542008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316530
14506	NC_007404	ATC	2	6	542028	542033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316530
14507	NC_007404	CGG	3	9	542069	542077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316530
14508	NC_007404	TCT	2	6	542107	542112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316530
14509	NC_007404	CCG	3	9	542113	542121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316530
14510	NC_007404	CG	3	6	542203	542208	0 %	0 %	50 %	50 %	74316530
14511	NC_007404	GAT	2	6	542213	542218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316530
14512	NC_007404	AGG	2	6	542263	542268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316530
14513	NC_007404	AGC	2	6	542361	542366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_007404	GCG	2	6	542367	542372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_007404	AAC	2	6	542411	542416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_007404	GAG	3	9	542419	542427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_007404	TG	3	6	542556	542561	0 %	50 %	50 %	0 %	74316531
14518	NC_007404	AGCG	2	8	542594	542601	25 %	0 %	50 %	25 %	74316531
14519	NC_007404	GGA	2	6	542688	542693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316531
14520	NC_007404	GAC	2	6	542849	542854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316531
14521	NC_007404	TTG	2	6	542862	542867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316531
14522	NC_007404	GGC	2	6	542871	542876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316531
14523	NC_007404	TTCGG	2	10	542916	542925	0 %	40 %	40 %	20 %	74316531
14524	NC_007404	CGA	2	6	543025	543030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316531
14525	NC_007404	TGA	2	6	543034	543039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316531
14526	NC_007404	ACC	2	6	543107	543112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316531
14527	NC_007404	CGC	2	6	543140	543145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316531
14528	NC_007404	GCC	2	6	543266	543271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14529	NC_007404	T	6	6	543315	543320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_007404	CGC	2	6	543337	543342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_007404	T	7	7	543406	543412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_007404	GCC	2	6	543422	543427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14533	NC_007404	AACG	2	8	543440	543447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14534	NC_007404	CGA	2	6	543475	543480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316532
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14536	NC_007404	GC	3	6	543538	543543	0 %	0 %	50 %	50 %	74316532
14537	NC_007404	CG	7	14	543568	543581	0 %	0 %	50 %	50 %	74316532
14538	NC_007404	ACG	2	6	543591	543596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316532
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14540	NC_007404	TCG	4	12	543624	543635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316532
14541	NC_007404	CG	3	6	543676	543681	0 %	0 %	50 %	50 %	74316532
14542	NC_007404	TCG	2	6	543723	543728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316532
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14544	NC_007404	CGA	2	6	543799	543804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316532
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14546	NC_007404	TTG	2	6	543845	543850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316532
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14551	NC_007404	CCA	2	6	544078	544083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316532
14552	NC_007404	GCG	2	6	544161	544166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316532
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14554	NC_007404	GCG	2	6	544209	544214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316532
14555	NC_007404	GGC	3	9	544219	544227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316532
14556	NC_007404	TGA	2	6	544245	544250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316532
14557	NC_007404	AGCA	2	8	544274	544281	50 %	0 %	25 %	25 %	74316532
14558	NC_007404	CGC	2	6	544303	544308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316532
14559	NC_007404	CGC	2	6	544315	544320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316532
14560	NC_007404	GCG	2	6	544332	544337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316532
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14565	NC_007404	CGG	2	6	544518	544523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316532
14566	NC_007404	GC	3	6	544535	544540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14567	NC_007404	GGAA	2	8	544605	544612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_007404	GCG	2	6	544720	544725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_007404	CGC	2	6	544726	544731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14570	NC_007404	TGAC	2	8	544785	544792	25 %	25 %	25 %	25 %	74316533
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14574	NC_007404	CG	3	6	544947	544952	0 %	0 %	50 %	50 %	74316533
14575	NC_007404	GCG	2	6	545007	545012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316533
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14582	NC_007404	CCGC	2	8	545246	545253	0 %	0 %	25 %	75 %	74316533
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14594	NC_007404	CGACG	2	10	545644	545653	20 %	0 %	40 %	40 %	74316533
14595	NC_007404	CTG	2	6	545672	545677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316533
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14605	NC_007404	GCCG	2	8	545953	545960	0 %	0 %	50 %	50 %	74316533
14606	NC_007404	C	6	6	545964	545969	0 %	0 %	0 %	100 %	74316533
14607	NC_007404	CGC	2	6	545971	545976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316533
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14609	NC_007404	GCA	2	6	546019	546024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316533
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14621	NC_007404	CGG	2	6	546484	546489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316533
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14863	NC_007404	CGC	2	6	555090	555095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316547
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14867	NC_007404	AGC	2	6	555226	555231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316547
14868	NC_007404	CTC	2	6	555300	555305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316547
14869	NC_007404	GCAG	2	8	555323	555330	25 %	0 %	50 %	25 %	74316547
14870	NC_007404	CAG	2	6	555393	555398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316547
14871	NC_007404	GCGA	2	8	555407	555414	25 %	0 %	50 %	25 %	74316547
14872	NC_007404	GCG	2	6	555491	555496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316547
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14875	NC_007404	CGC	2	6	555695	555700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316547
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14975	NC_007404	TGA	2	6	559508	559513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316552
14976	NC_007404	TCG	2	6	559597	559602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316552
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14981	NC_007404	GC	5	10	559851	559860	0 %	0 %	50 %	50 %	74316552
14982	NC_007404	TGG	2	6	559861	559866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316552
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14987	NC_007404	CGA	2	6	559985	559990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316552
14988	NC_007404	CGC	2	6	559994	559999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316552
14989	NC_007404	CGT	2	6	560018	560023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316552
14990	NC_007404	ACG	2	6	560026	560031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316552
14991	NC_007404	GCT	2	6	560095	560100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316553
14992	NC_007404	CGC	2	6	560101	560106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316553
14993	NC_007404	CG	3	6	560126	560131	0 %	0 %	50 %	50 %	74316553
14994	NC_007404	CGCC	2	8	560136	560143	0 %	0 %	25 %	75 %	74316553
14995	NC_007404	CGA	2	6	560167	560172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316553
14996	NC_007404	CGCTGT	2	12	560185	560196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316553
14997	NC_007404	CG	3	6	560208	560213	0 %	0 %	50 %	50 %	74316553
14998	NC_007404	CCTCG	2	10	560227	560236	0 %	20 %	20 %	60 %	74316553
14999	NC_007404	TCG	2	6	560272	560277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316553
15000	NC_007404	TGT	2	6	560278	560283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316553

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