MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007404	CGCC	2	8	35693	35700	0 %	0 %	25 %	75 %	74316052
1002	NC_007404	TGC	2	6	35747	35752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1003	NC_007404	GCG	2	6	35840	35845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1004	NC_007404	CGT	2	6	35852	35857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1005	NC_007404	TCG	2	6	35914	35919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1006	NC_007404	TCG	2	6	35923	35928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1007	NC_007404	GAA	2	6	35958	35963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316052
1008	NC_007404	CGGG	2	8	36079	36086	0 %	0 %	75 %	25 %	74316052
1009	NC_007404	GCT	2	6	36117	36122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1010	NC_007404	CGC	2	6	36126	36131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316052
1011	NC_007404	GCG	2	6	36161	36166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1012	NC_007404	TCG	3	9	36181	36189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1013	NC_007404	GC	3	6	36196	36201	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1014	NC_007404	CGG	2	6	36257	36262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1015	NC_007404	CGT	2	6	36263	36268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1016	NC_007404	GGC	2	6	36293	36298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1017	NC_007404	CG	4	8	36389	36396	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1018	NC_007404	CGA	2	6	36440	36445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1019	NC_007404	GCC	2	6	36479	36484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316052
1020	NC_007404	GCG	2	6	36535	36540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1021	NC_007404	CGG	2	6	36563	36568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1022	NC_007404	GCG	2	6	36592	36597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1023	NC_007404	GCGT	2	8	36669	36676	0 %	25 %	50 %	25 %	74316052
1024	NC_007404	AGCGA	2	10	36682	36691	40 %	0 %	40 %	20 %	74316052
1025	NC_007404	GC	3	6	36704	36709	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1026	NC_007404	GGC	2	6	36764	36769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1027	NC_007404	GGCG	2	8	36803	36810	0 %	0 %	75 %	25 %	74316052
1028	NC_007404	AGC	2	6	36850	36855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1029	NC_007404	CGA	2	6	36899	36904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1030	NC_007404	CGG	2	6	36908	36913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1031	NC_007404	CGT	2	6	36918	36923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1032	NC_007404	TCG	2	6	36943	36948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1033	NC_007404	CGA	2	6	36950	36955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1034	NC_007404	AGC	2	6	36973	36978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1035	NC_007404	GC	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1036	NC_007404	CGG	2	6	36988	36993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1037	NC_007404	GCCT	2	8	37027	37034	0 %	25 %	25 %	50 %	74316052
1038	NC_007404	CG	3	6	37038	37043	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1039	NC_007404	GCG	2	6	37051	37056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1040	NC_007404	GC	4	8	37072	37079	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1041	NC_007404	TGCGG	2	10	37093	37102	0 %	20 %	60 %	20 %	74316052
1042	NC_007404	CCA	2	6	37121	37126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316052
1043	NC_007404	GCG	2	6	37175	37180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1044	NC_007404	GTC	2	6	37224	37229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1045	NC_007404	GCG	2	6	37253	37258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1046	NC_007404	CG	3	6	37273	37278	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1047	NC_007404	CGC	3	9	37292	37300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316052
1048	NC_007404	GC	3	6	37337	37342	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1049	NC_007404	AGCG	2	8	37356	37363	25 %	0 %	50 %	25 %	74316052
1050	NC_007404	GTC	2	6	37395	37400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1051	NC_007404	GCC	2	6	37401	37406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316052
1052	NC_007404	CGG	2	6	37467	37472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316052
1053	NC_007404	GC	5	10	37505	37514	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1054	NC_007404	TCG	2	6	37525	37530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1055	NC_007404	GCA	2	6	37538	37543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1056	NC_007404	TTCG	2	8	37545	37552	0 %	50 %	25 %	25 %	74316052
1057	NC_007404	ACCGA	2	10	37570	37579	40 %	0 %	20 %	40 %	74316052
1058	NC_007404	CG	3	6	37612	37617	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1059	NC_007404	GCA	2	6	37639	37644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1060	NC_007404	CGA	2	6	37694	37699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1061	NC_007404	GC	3	6	37705	37710	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1062	NC_007404	CG	3	6	37718	37723	0 %	0 %	50 %	50 %	74316052
1063	NC_007404	ACG	3	9	37771	37779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316052
1064	NC_007404	GA	3	6	37783	37788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007404	CAG	2	6	37815	37820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_007404	CGG	2	6	37822	37827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007404	GCG	2	6	37841	37846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_007404	G	6	6	37858	37863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_007404	CGTCCG	2	12	37918	37929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	74316053
1070	NC_007404	CGA	2	6	37948	37953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316053
1071	NC_007404	GC	3	6	37998	38003	0 %	0 %	50 %	50 %	74316053
1072	NC_007404	GTC	2	6	38006	38011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316053
1073	NC_007404	CGT	2	6	38017	38022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316053
1074	NC_007404	CTC	2	6	38081	38086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316053
1075	NC_007404	GACA	2	8	38134	38141	50 %	0 %	25 %	25 %	74316053
1076	NC_007404	CA	3	6	38168	38173	50 %	0 %	0 %	50 %	74316053
1077	NC_007404	ATT	2	6	38212	38217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_007404	TTGC	2	8	38233	38240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_007404	TCA	2	6	38343	38348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_007404	CGA	2	6	38391	38396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316054
1081	NC_007404	TGC	2	6	38414	38419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316054
1082	NC_007404	TGG	2	6	38438	38443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316054
1083	NC_007404	ACT	2	6	38444	38449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316054
1084	NC_007404	GAT	2	6	38475	38480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316054
1085	NC_007404	CGA	2	6	38493	38498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316054
1086	NC_007404	CGA	2	6	38547	38552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316054
1087	NC_007404	TGA	2	6	38600	38605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316054
1088	NC_007404	GC	3	6	38642	38647	0 %	0 %	50 %	50 %	74316054
1089	NC_007404	TCG	2	6	38672	38677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316054
1090	NC_007404	CGT	2	6	38741	38746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_007404	C	6	6	38758	38763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1092	NC_007404	CGC	3	9	38856	38864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316055
1093	NC_007404	GTG	2	6	38939	38944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316055
1094	NC_007404	TGC	2	6	38975	38980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1095	NC_007404	CGGCTT	2	12	38985	38996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1096	NC_007404	CGA	2	6	39033	39038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1097	NC_007404	CCG	2	6	39063	39068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316055
1098	NC_007404	GCC	2	6	39171	39176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316055
1099	NC_007404	GGA	2	6	39264	39269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316055
1100	NC_007404	TCG	2	6	39296	39301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1101	NC_007404	TCG	2	6	39332	39337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1102	NC_007404	CCG	2	6	39340	39345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316055
1103	NC_007404	TGC	2	6	39365	39370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1104	NC_007404	TGC	2	6	39422	39427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1105	NC_007404	CGA	2	6	39432	39437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1106	NC_007404	GCG	2	6	39476	39481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316055
1107	NC_007404	GTC	2	6	39484	39489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1108	NC_007404	CGA	2	6	39501	39506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1109	NC_007404	GCC	2	6	39515	39520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316055
1110	NC_007404	GC	3	6	39549	39554	0 %	0 %	50 %	50 %	74316055
1111	NC_007404	AAG	2	6	39574	39579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316055
1112	NC_007404	CGT	2	6	39582	39587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1113	NC_007404	TCGAT	2	10	39596	39605	20 %	40 %	20 %	20 %	74316055
1114	NC_007404	CG	4	8	39615	39622	0 %	0 %	50 %	50 %	74316055
1115	NC_007404	ACA	2	6	39626	39631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316055
1116	NC_007404	CTT	2	6	39702	39707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316055
1117	NC_007404	CG	3	6	39714	39719	0 %	0 %	50 %	50 %	74316055
1118	NC_007404	GGC	2	6	39733	39738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316055
1119	NC_007404	GAC	2	6	39787	39792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1120	NC_007404	CGC	2	6	39901	39906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316055
1121	NC_007404	CTG	2	6	39913	39918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1122	NC_007404	TGC	2	6	39950	39955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1123	NC_007404	GAC	2	6	39976	39981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316055
1124	NC_007404	TCC	2	6	39998	40003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316055
1125	NC_007404	CG	3	6	40015	40020	0 %	0 %	50 %	50 %	74316055
1126	NC_007404	GAA	2	6	40023	40028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316055
1127	NC_007404	TTC	2	6	40039	40044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316055
1128	NC_007404	GCG	2	6	40053	40058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316055
1129	NC_007404	CGC	2	6	40066	40071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1137	NC_007404	CGG	2	6	40290	40295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_007404	GTGACC	2	12	40379	40390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74316057
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1143	NC_007404	CCAGGT	2	12	40566	40577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1247	NC_007404	CGTGC	2	10	44137	44146	0 %	20 %	40 %	40 %	74316060
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1253	NC_007404	CGC	2	6	44413	44418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316061
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1382	NC_007404	GCCCG	2	10	49149	49158	0 %	0 %	40 %	60 %	74316066
1383	NC_007404	GC	4	8	49162	49169	0 %	0 %	50 %	50 %	74316066
1384	NC_007404	GGC	2	6	49180	49185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316066
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1427	NC_007404	GAA	2	6	50336	50341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316066
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1430	NC_007404	TCG	3	9	50436	50444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316066
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1433	NC_007404	GC	3	6	50501	50506	0 %	0 %	50 %	50 %	74316067
1434	NC_007404	CG	3	6	50521	50526	0 %	0 %	50 %	50 %	74316067
1435	NC_007404	GCT	2	6	50568	50573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316067
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1481	NC_007404	CTGGCC	2	12	52219	52230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	74316067
1482	NC_007404	GC	3	6	52306	52311	0 %	0 %	50 %	50 %	74316067
1483	NC_007404	CGAG	2	8	52347	52354	25 %	0 %	50 %	25 %	74316067
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1488	NC_007404	CGA	2	6	52483	52488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316067
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1491	NC_007404	CGG	2	6	52530	52535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316067
1492	NC_007404	AGC	2	6	52538	52543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316067
1493	NC_007404	TTG	2	6	52566	52571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316067
1494	NC_007404	AGC	2	6	52601	52606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316067
1495	NC_007404	CGG	2	6	52713	52718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316067
1496	NC_007404	A	6	6	52824	52829	100 %	0 %	0 %	0 %	74316068
1497	NC_007404	CG	3	6	52857	52862	0 %	0 %	50 %	50 %	74316068
1498	NC_007404	GC	3	6	52876	52881	0 %	0 %	50 %	50 %	74316068
1499	NC_007404	CGA	2	6	53150	53155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316068
1500	NC_007404	G	7	7	53180	53186	0 %	0 %	100 %	0 %	74316068

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