MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13004	NC_007404	TCG	2	6	490041	490046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316486
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13011	NC_007404	CGG	2	6	490221	490226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316486
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13242	NC_007404	GCT	2	6	498165	498170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316493
13243	NC_007404	CGGCG	2	10	498237	498246	0 %	0 %	60 %	40 %	74316493
13244	NC_007404	AGG	2	6	498263	498268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316493
13245	NC_007404	AAGC	2	8	498270	498277	50 %	0 %	25 %	25 %	74316493
13246	NC_007404	CGC	2	6	498303	498308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316493
13247	NC_007404	CTCG	2	8	498384	498391	0 %	25 %	25 %	50 %	74316493
13248	NC_007404	CGC	2	6	498401	498406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316493
13249	NC_007404	CG	3	6	498417	498422	0 %	0 %	50 %	50 %	74316493
13250	NC_007404	GGCGC	2	10	498461	498470	0 %	0 %	60 %	40 %	74316493
13251	NC_007404	CTC	2	6	498484	498489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316493
13252	NC_007404	GAT	2	6	498579	498584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316493
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13255	NC_007404	AAT	2	6	498701	498706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74316494
13256	NC_007404	CTG	2	6	498743	498748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316494
13257	NC_007404	AGA	2	6	498834	498839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316494
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13259	NC_007404	ACG	2	6	498953	498958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316494
13260	NC_007404	TCG	2	6	498960	498965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316494
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13262	NC_007404	CG	3	6	499048	499053	0 %	0 %	50 %	50 %	74316494
13263	NC_007404	CAT	2	6	499096	499101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316494
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13265	NC_007404	CAA	2	6	499135	499140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316494
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13269	NC_007404	GCT	2	6	499276	499281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316494
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13271	NC_007404	GC	3	6	499391	499396	0 %	0 %	50 %	50 %	74316494
13272	NC_007404	CGG	2	6	499438	499443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316494
13273	NC_007404	ACG	2	6	499448	499453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316494
13274	NC_007404	GTC	2	6	499490	499495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316494
13275	NC_007404	CGA	3	9	499498	499506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316494
13276	NC_007404	GC	3	6	499513	499518	0 %	0 %	50 %	50 %	74316494
13277	NC_007404	CAG	2	6	499532	499537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316494
13278	NC_007404	GGC	2	6	499585	499590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13279	NC_007404	CGC	2	6	499593	499598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13280	NC_007404	CCGC	2	8	499650	499657	0 %	0 %	25 %	75 %	74316495
13281	NC_007404	CG	3	6	499667	499672	0 %	0 %	50 %	50 %	74316495
13282	NC_007404	TGCGC	2	10	499687	499696	0 %	20 %	40 %	40 %	74316495
13283	NC_007404	TCG	2	6	499737	499742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316495
13284	NC_007404	CGT	2	6	499777	499782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316495
13285	NC_007404	CGC	2	6	499794	499799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316495
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13289	NC_007404	GC	3	6	499886	499891	0 %	0 %	50 %	50 %	74316495
13290	NC_007404	GC	3	6	499945	499950	0 %	0 %	50 %	50 %	74316495
13291	NC_007404	GTC	2	6	499952	499957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316495
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13294	NC_007404	CGG	2	6	500017	500022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316495
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13298	NC_007404	TCG	2	6	500115	500120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316495
13299	NC_007404	CGC	2	6	500128	500133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316495
13300	NC_007404	TCGG	2	8	500138	500145	0 %	25 %	50 %	25 %	74316495
13301	NC_007404	CTCGAT	2	12	500168	500179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	74316495
13302	NC_007404	CGT	2	6	500215	500220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316495
13303	NC_007404	GCG	2	6	500232	500237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316495
13304	NC_007404	TCG	2	6	500241	500246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316495
13305	NC_007404	GGCGT	2	10	500267	500276	0 %	20 %	60 %	20 %	74316495
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13309	NC_007404	CGC	2	6	500432	500437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316496
13310	NC_007404	TCG	2	6	500504	500509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316496
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13314	NC_007404	GC	3	6	500653	500658	0 %	0 %	50 %	50 %	74316496
13315	NC_007404	AAC	2	6	500659	500664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316496
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13317	NC_007404	CGA	2	6	500745	500750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316496
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13320	NC_007404	TCG	2	6	500930	500935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316496
13321	NC_007404	CGT	2	6	500971	500976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316497
13322	NC_007404	TCGCG	2	10	500977	500986	0 %	20 %	40 %	40 %	74316497
13323	NC_007404	CGC	3	9	501006	501014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316497
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13337	NC_007404	GC	3	6	501789	501794	0 %	0 %	50 %	50 %	74316497
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13342	NC_007404	GTT	2	6	501976	501981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316497
13343	NC_007404	GCC	2	6	502016	502021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316497
13344	NC_007404	GC	4	8	502034	502041	0 %	0 %	50 %	50 %	74316497
13345	NC_007404	GCC	2	6	502068	502073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316497
13346	NC_007404	CTG	2	6	502112	502117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316497
13347	NC_007404	GCC	2	6	502151	502156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13348	NC_007404	G	6	6	502176	502181	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13349	NC_007404	GTT	2	6	502237	502242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13350	NC_007404	GCG	2	6	502253	502258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13351	NC_007404	GCC	2	6	502286	502291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13352	NC_007404	TGA	2	6	502412	502417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316498
13353	NC_007404	GAC	2	6	502435	502440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316498
13354	NC_007404	GTG	2	6	502471	502476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316498
13355	NC_007404	TGG	2	6	502483	502488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316498
13356	NC_007404	GC	3	6	502516	502521	0 %	0 %	50 %	50 %	74316498
13357	NC_007404	TCG	3	9	502550	502558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316498
13358	NC_007404	GC	3	6	502604	502609	0 %	0 %	50 %	50 %	74316498
13359	NC_007404	CG	4	8	502647	502654	0 %	0 %	50 %	50 %	74316498
13360	NC_007404	CGC	2	6	502659	502664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316498
13361	NC_007404	GC	3	6	502663	502668	0 %	0 %	50 %	50 %	74316498
13362	NC_007404	CGG	3	9	502731	502739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316498
13363	NC_007404	CGT	2	6	502740	502745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316498
13364	NC_007404	CGT	2	6	502752	502757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316498
13365	NC_007404	GC	3	6	502758	502763	0 %	0 %	50 %	50 %	74316498
13366	NC_007404	CGAC	2	8	502808	502815	25 %	0 %	25 %	50 %	74316498
13367	NC_007404	CCGAT	2	10	502871	502880	20 %	20 %	20 %	40 %	74316498
13368	NC_007404	GCC	2	6	503002	503007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316498
13369	NC_007404	CGG	2	6	503039	503044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316498
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13372	NC_007404	CG	3	6	503137	503142	0 %	0 %	50 %	50 %	74316499
13373	NC_007404	GGC	2	6	503145	503150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316499
13374	NC_007404	GC	3	6	503195	503200	0 %	0 %	50 %	50 %	74316499
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13378	NC_007404	CGA	2	6	503348	503353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316499
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13384	NC_007404	CG	3	6	503536	503541	0 %	0 %	50 %	50 %	74316499
13385	NC_007404	GAC	2	6	503558	503563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316499
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13387	NC_007404	GCAT	2	8	503586	503593	25 %	25 %	25 %	25 %	74316499
13388	NC_007404	CTG	2	6	503616	503621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316499
13389	NC_007404	CGGCG	2	10	503634	503643	0 %	0 %	60 %	40 %	74316499
13390	NC_007404	CGT	2	6	503651	503656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316499
13391	NC_007404	GCT	2	6	503674	503679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316499
13392	NC_007404	TGC	2	6	503710	503715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316499
13393	NC_007404	GC	3	6	503714	503719	0 %	0 %	50 %	50 %	74316499
13394	NC_007404	ACCG	2	8	503761	503768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13395	NC_007404	GTAT	2	8	503802	503809	25 %	50 %	25 %	0 %	74316500
13396	NC_007404	CATG	2	8	503818	503825	25 %	25 %	25 %	25 %	74316500
13397	NC_007404	GCT	2	6	503860	503865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316500
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13400	NC_007404	ATC	2	6	503961	503966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316500
13401	NC_007404	GTC	2	6	503999	504004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316500
13402	NC_007404	GAT	2	6	504034	504039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316500
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13405	NC_007404	CTTG	2	8	504088	504095	0 %	50 %	25 %	25 %	74316500
13406	NC_007404	GGC	2	6	504103	504108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316500
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13413	NC_007404	CGC	2	6	504496	504501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316501
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13424	NC_007404	CGGTG	2	10	504911	504920	0 %	20 %	60 %	20 %	74316501
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13430	NC_007404	CG	4	8	505064	505071	0 %	0 %	50 %	50 %	74316502
13431	NC_007404	GTCGGC	2	12	505087	505098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74316502
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13439	NC_007404	AGG	2	6	505430	505435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13440	NC_007404	CTG	2	6	505566	505571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316503
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13463	NC_007404	GTGG	2	8	506368	506375	0 %	25 %	75 %	0 %	74316504
13464	NC_007404	CG	3	6	506389	506394	0 %	0 %	50 %	50 %	74316504
13465	NC_007404	CTGA	2	8	506400	506407	25 %	25 %	25 %	25 %	74316504
13466	NC_007404	GCG	2	6	506472	506477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13467	NC_007404	T	7	7	506522	506528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13468	NC_007404	GCA	2	6	506585	506590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316505
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13471	NC_007404	CGA	2	6	506923	506928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13472	NC_007404	CTG	2	6	506949	506954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13473	NC_007404	GCA	2	6	506969	506974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13474	NC_007404	GC	3	6	507072	507077	0 %	0 %	50 %	50 %	74316505
13475	NC_007404	GA	3	6	507085	507090	50 %	0 %	50 %	0 %	74316505
13476	NC_007404	GGA	2	6	507092	507097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316505
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13478	NC_007404	T	7	7	507144	507150	0 %	100 %	0 %	0 %	74316505
13479	NC_007404	TTG	2	6	507273	507278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316505
13480	NC_007404	CGA	2	6	507344	507349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13481	NC_007404	TCG	2	6	507352	507357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13482	NC_007404	TGC	2	6	507358	507363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13483	NC_007404	CGCGG	2	10	507401	507410	0 %	0 %	60 %	40 %	74316505
13484	NC_007404	TTC	2	6	507412	507417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316505
13485	NC_007404	CGTCG	2	10	507422	507431	0 %	20 %	40 %	40 %	74316505
13486	NC_007404	GCG	2	6	507493	507498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316505
13487	NC_007404	CGC	3	9	507503	507511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316505
13488	NC_007404	TCGGA	2	10	507514	507523	20 %	20 %	40 %	20 %	74316505
13489	NC_007404	CGC	2	6	507557	507562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316505
13490	NC_007404	A	8	8	507564	507571	100 %	0 %	0 %	0 %	74316505
13491	NC_007404	GTC	2	6	507593	507598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13492	NC_007404	TCG	2	6	507619	507624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316505
13493	NC_007404	T	6	6	507646	507651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_007404	CG	4	8	507685	507692	0 %	0 %	50 %	50 %	74316506
13495	NC_007404	CGT	2	6	507698	507703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316506
13496	NC_007404	CG	4	8	507706	507713	0 %	0 %	50 %	50 %	74316506
13497	NC_007404	GC	3	6	507752	507757	0 %	0 %	50 %	50 %	74316506
13498	NC_007404	CGG	2	6	507806	507811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316506
13499	NC_007404	GCC	2	6	507905	507910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316506
13500	NC_007404	TGA	2	6	507934	507939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316506

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