MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007404	TTA	2	6	468238	468243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_007404	A	6	6	468258	468263	100 %	0 %	0 %	0 %	74316466
12503	NC_007404	CCA	2	6	468316	468321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316466
12504	NC_007404	GCTT	2	8	468404	468411	0 %	50 %	25 %	25 %	74316466
12505	NC_007404	CGG	3	9	468452	468460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316466
12506	NC_007404	GCG	2	6	468508	468513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316466
12507	NC_007404	TCG	2	6	468538	468543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12508	NC_007404	TGC	2	6	468601	468606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12509	NC_007404	CTG	2	6	468654	468659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12510	NC_007404	TCC	2	6	468684	468689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316466
12511	NC_007404	CAA	2	6	468704	468709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316466
12512	NC_007404	CCG	2	6	468856	468861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316466
12513	NC_007404	ACG	2	6	468931	468936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12514	NC_007404	GCA	2	6	468946	468951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12515	NC_007404	GC	3	6	468956	468961	0 %	0 %	50 %	50 %	74316466
12516	NC_007404	GC	3	6	469010	469015	0 %	0 %	50 %	50 %	74316466
12517	NC_007404	CGC	2	6	469025	469030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316466
12518	NC_007404	CGA	2	6	469040	469045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12519	NC_007404	CGT	2	6	469088	469093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316466
12520	NC_007404	GCG	2	6	469144	469149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316466
12521	NC_007404	TCGGCC	2	12	469315	469326	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	74316466
12522	NC_007404	TGCC	2	8	469414	469421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_007404	CGG	2	6	469507	469512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316467
12524	NC_007404	GTC	2	6	469558	469563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316467
12525	NC_007404	CTT	2	6	469580	469585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316467
12526	NC_007404	TGTT	2	8	469586	469593	0 %	75 %	25 %	0 %	74316467
12527	NC_007404	CA	3	6	469613	469618	50 %	0 %	0 %	50 %	74316467
12528	NC_007404	GATC	2	8	469685	469692	25 %	25 %	25 %	25 %	74316467
12529	NC_007404	TTC	2	6	469780	469785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316467
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12531	NC_007404	TG	4	8	469957	469964	0 %	50 %	50 %	0 %	74316468
12532	NC_007404	GC	3	6	469982	469987	0 %	0 %	50 %	50 %	74316468
12533	NC_007404	TTTC	2	8	470010	470017	0 %	75 %	0 %	25 %	74316468
12534	NC_007404	TGC	2	6	470040	470045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12537	NC_007404	CTGC	2	8	470178	470185	0 %	25 %	25 %	50 %	74316469
12538	NC_007404	CGGTGA	2	12	470214	470225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74316469
12539	NC_007404	TCGG	2	8	470258	470265	0 %	25 %	50 %	25 %	74316469
12540	NC_007404	CG	3	6	470266	470271	0 %	0 %	50 %	50 %	74316469
12541	NC_007404	GAC	2	6	470332	470337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316469
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12551	NC_007404	GCA	2	6	470647	470652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316470
12552	NC_007404	CGG	2	6	470695	470700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316470
12553	NC_007404	AGC	2	6	470799	470804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316470
12554	NC_007404	GC	3	6	470816	470821	0 %	0 %	50 %	50 %	74316470
12555	NC_007404	GCG	2	6	470841	470846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316470
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12559	NC_007404	AGC	2	6	470949	470954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316470
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12563	NC_007404	GCC	2	6	471056	471061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316470
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12573	NC_007404	GTC	2	6	471598	471603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316471
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12585	NC_007404	CAT	2	6	472061	472066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316472
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12589	NC_007404	CGC	2	6	472242	472247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316472
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12591	NC_007404	GCC	2	6	472290	472295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12592	NC_007404	T	7	7	472310	472316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_007404	CATC	2	8	472349	472356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12594	NC_007404	GGC	2	6	472394	472399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316473
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12599	NC_007404	CGT	2	6	472579	472584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316473
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12601	NC_007404	GCT	2	6	472630	472635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316473
12602	NC_007404	GATC	2	8	472654	472661	25 %	25 %	25 %	25 %	74316473
12603	NC_007404	GCC	2	6	472664	472669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316473
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12606	NC_007404	GGGC	2	8	472917	472924	0 %	0 %	75 %	25 %	74316473
12607	NC_007404	GGC	2	6	472957	472962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316473
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12610	NC_007404	CCACG	2	10	473095	473104	20 %	0 %	20 %	60 %	74316473
12611	NC_007404	TCG	2	6	473175	473180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316473
12612	NC_007404	GCCG	2	8	473188	473195	0 %	0 %	50 %	50 %	74316473
12613	NC_007404	TGCC	2	8	473197	473204	0 %	25 %	25 %	50 %	74316473
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12615	NC_007404	CTGT	2	8	473285	473292	0 %	50 %	25 %	25 %	74316473
12616	NC_007404	GAACAT	2	12	473335	473346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	74316473
12617	NC_007404	ACC	2	6	473502	473507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316474
12618	NC_007404	GCAA	2	8	473544	473551	50 %	0 %	25 %	25 %	74316474
12619	NC_007404	CGA	2	6	473567	473572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316474
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12874	NC_007404	GCC	2	6	486110	486115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316481
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12907	NC_007404	GC	3	6	487299	487304	0 %	0 %	50 %	50 %	74316482
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12912	NC_007404	CAGC	2	8	487450	487457	25 %	0 %	25 %	50 %	74316482
12913	NC_007404	CGT	2	6	487485	487490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316482
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12915	NC_007404	GAC	2	6	487541	487546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12994	NC_007404	CGC	2	6	489788	489793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316485
12995	NC_007404	GTC	2	6	489795	489800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316485
12996	NC_007404	CG	3	6	489812	489817	0 %	0 %	50 %	50 %	74316485
12997	NC_007404	CGA	2	6	489839	489844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316485
12998	NC_007404	GGC	2	6	489847	489852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316485
12999	NC_007404	CTGG	2	8	489869	489876	0 %	25 %	50 %	25 %	74316485
13000	NC_007404	GCT	2	6	489911	489916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316485

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