MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11503	NC_007404	CGA	2	6	428226	428231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316416
11504	NC_007404	CG	3	6	428241	428246	0 %	0 %	50 %	50 %	74316416
11505	NC_007404	CTCG	2	8	428262	428269	0 %	25 %	25 %	50 %	74316416
11506	NC_007404	CAG	2	6	428275	428280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316416
11507	NC_007404	GGC	2	6	428287	428292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316416
11508	NC_007404	CGG	2	6	428304	428309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316416
11509	NC_007404	CCT	2	6	428357	428362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316416
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11511	NC_007404	CGA	2	6	428394	428399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316416
11512	NC_007404	CATCGA	2	12	428511	428522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	74316416
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11515	NC_007404	GAA	2	6	428602	428607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316417
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11517	NC_007404	CGGTC	2	10	428745	428754	0 %	20 %	40 %	40 %	74316417
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11523	NC_007404	GAG	2	6	429067	429072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316417
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11552	NC_007404	CG	3	6	430285	430290	0 %	0 %	50 %	50 %	74316417
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11864	NC_007404	TGG	2	6	442915	442920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316434
11865	NC_007404	AAG	2	6	442941	442946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316434
11866	NC_007404	GGC	2	6	442980	442985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316434
11867	NC_007404	GGA	2	6	443078	443083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316434
11868	NC_007404	GGT	2	6	443176	443181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316435
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11870	NC_007404	AAG	2	6	443282	443287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316435
11871	NC_007404	AGA	2	6	443316	443321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316435
11872	NC_007404	GAA	2	6	443353	443358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316435
11873	NC_007404	GTG	2	6	443487	443492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316435
11874	NC_007404	ACA	2	6	443526	443531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316435
11875	NC_007404	ATC	2	6	443549	443554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316435
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11882	NC_007404	GC	5	10	443726	443735	0 %	0 %	50 %	50 %	74316436
11883	NC_007404	GAA	2	6	443741	443746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316436
11884	NC_007404	CGA	2	6	443801	443806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316436
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11888	NC_007404	GCA	2	6	444059	444064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316437
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11890	NC_007404	CGT	2	6	444091	444096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316437
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11892	NC_007404	GCCG	2	8	444210	444217	0 %	0 %	50 %	50 %	74316437
11893	NC_007404	GAA	2	6	444296	444301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316437
11894	NC_007404	GCG	2	6	444334	444339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316437
11895	NC_007404	TGA	2	6	444340	444345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316437
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11897	NC_007404	AAT	2	6	444432	444437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74316438
11898	NC_007404	GCTCG	2	10	444500	444509	0 %	20 %	40 %	40 %	74316438
11899	NC_007404	AGCC	2	8	444513	444520	25 %	0 %	25 %	50 %	74316438
11900	NC_007404	GTC	2	6	444524	444529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316438
11901	NC_007404	GC	3	6	444617	444622	0 %	0 %	50 %	50 %	74316438
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11906	NC_007404	GCCG	2	8	444764	444771	0 %	0 %	50 %	50 %	74316438
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11909	NC_007404	CGC	2	6	444845	444850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316438
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11912	NC_007404	CGA	2	6	444908	444913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316438
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11934	NC_007404	CGT	2	6	445753	445758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316440
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11936	NC_007404	CGAT	2	8	445767	445774	25 %	25 %	25 %	25 %	74316440
11937	NC_007404	TGA	2	6	445779	445784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316440
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11940	NC_007404	GAGC	2	8	445855	445862	25 %	0 %	50 %	25 %	74316441
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11945	NC_007404	GCGTC	2	10	446086	446095	0 %	20 %	40 %	40 %	74316442
11946	NC_007404	GC	3	6	446261	446266	0 %	0 %	50 %	50 %	74316442
11947	NC_007404	CGGCGT	2	12	446287	446298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74316442
11948	NC_007404	GCG	2	6	446343	446348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316442
11949	NC_007404	CGGC	2	8	446448	446455	0 %	0 %	50 %	50 %	74316442
11950	NC_007404	AGCG	2	8	446473	446480	25 %	0 %	50 %	25 %	74316442
11951	NC_007404	CG	3	6	446486	446491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11952	NC_007404	CTG	2	6	446543	446548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316443
11953	NC_007404	GCA	2	6	446641	446646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316443
11954	NC_007404	GGC	2	6	446648	446653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316443
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11956	NC_007404	ATC	2	6	446744	446749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316443
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11960	NC_007404	GCG	2	6	446812	446817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316443
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11962	NC_007404	ATC	3	9	447032	447040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316443
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11965	NC_007404	TCG	2	6	447138	447143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316443
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11968	NC_007404	TCG	2	6	447174	447179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316443
11969	NC_007404	GGGC	2	8	447241	447248	0 %	0 %	75 %	25 %	74316443
11970	NC_007404	GCTGAA	2	12	447265	447276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	74316443
11971	NC_007404	CCG	2	6	447293	447298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316443
11972	NC_007404	CAT	2	6	447313	447318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316443
11973	NC_007404	GGT	2	6	447342	447347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316443
11974	NC_007404	GCG	2	6	447354	447359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316443
11975	NC_007404	TGT	2	6	447423	447428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316443
11976	NC_007404	ATC	2	6	447440	447445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316443
11977	NC_007404	TTC	2	6	447446	447451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316443
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11980	NC_007404	GCG	2	6	447513	447518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316443
11981	NC_007404	CG	3	6	447553	447558	0 %	0 %	50 %	50 %	74316443
11982	NC_007404	CTGC	2	8	447619	447626	0 %	25 %	25 %	50 %	74316443
11983	NC_007404	CGG	2	6	447670	447675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316443
11984	NC_007404	CTG	2	6	447683	447688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316443
11985	NC_007404	ATC	2	6	447689	447694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316443
11986	NC_007404	GTG	3	9	447695	447703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316443
11987	NC_007404	AAG	2	6	447767	447772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316443
11988	NC_007404	TGG	2	6	447792	447797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316443
11989	NC_007404	GAAG	2	8	447810	447817	50 %	0 %	50 %	0 %	74316444
11990	NC_007404	TCC	2	6	447944	447949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316444
11991	NC_007404	GTGA	2	8	448048	448055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_007404	A	7	7	448089	448095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_007404	GAC	2	6	448149	448154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_007404	AGC	2	6	448165	448170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11995	NC_007404	T	6	6	448243	448248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_007404	GAC	2	6	448352	448357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316445
11997	NC_007404	GGC	2	6	448376	448381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316445
11998	NC_007404	GCT	2	6	448522	448527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316445
11999	NC_007404	CG	3	6	448586	448591	0 %	0 %	50 %	50 %	74316445
12000	NC_007404	CAG	2	6	448651	448656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316446

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