MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007404	GCT	3	9	18058	18066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
502	NC_007404	GTC	2	6	18077	18082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
503	NC_007404	GTC	2	6	18101	18106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
504	NC_007404	TTCT	2	8	18122	18129	0 %	75 %	0 %	25 %	74316036
505	NC_007404	TCGA	2	8	18137	18144	25 %	25 %	25 %	25 %	74316036
506	NC_007404	CGA	2	6	18211	18216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
507	NC_007404	CTG	2	6	18218	18223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
508	NC_007404	ATC	2	6	18287	18292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316036
509	NC_007404	CGA	2	6	18346	18351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
510	NC_007404	CGG	2	6	18355	18360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316036
511	NC_007404	GCG	2	6	18378	18383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316036
512	NC_007404	GCG	2	6	18414	18419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316036
513	NC_007404	GAG	2	6	18461	18466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316036
514	NC_007404	GC	3	6	18516	18521	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
515	NC_007404	CG	3	6	18534	18539	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
516	NC_007404	CG	4	8	18574	18581	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
517	NC_007404	ACGCTC	2	12	18671	18682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	74316036
518	NC_007404	CTG	3	9	18692	18700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
519	NC_007404	CTG	2	6	18719	18724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
520	NC_007404	CGC	2	6	18741	18746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316036
521	NC_007404	CG	4	8	18757	18764	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
522	NC_007404	CGA	2	6	18820	18825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
523	NC_007404	GC	3	6	18878	18883	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
524	NC_007404	GTC	2	6	18955	18960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
525	NC_007404	CGT	3	9	18964	18972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
526	NC_007404	CGA	2	6	18976	18981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
527	NC_007404	GCC	2	6	19010	19015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316036
528	NC_007404	CA	3	6	19017	19022	50 %	0 %	0 %	50 %	74316036
529	NC_007404	GCG	2	6	19040	19045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316036
530	NC_007404	GCC	3	9	19106	19114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316036
531	NC_007404	CAG	2	6	19177	19182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
532	NC_007404	TGC	3	9	19191	19199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316036
533	NC_007404	CGA	2	6	19249	19254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
534	NC_007404	AACGC	2	10	19278	19287	40 %	0 %	20 %	40 %	74316036
535	NC_007404	CG	3	6	19369	19374	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
536	NC_007404	CGG	2	6	19381	19386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316036
537	NC_007404	CG	5	10	19417	19426	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
538	NC_007404	GAA	2	6	19459	19464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316036
539	NC_007404	CG	5	10	19500	19509	0 %	0 %	50 %	50 %	74316036
540	NC_007404	ACG	2	6	19560	19565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
541	NC_007404	CGA	2	6	19597	19602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316036
542	NC_007404	GCGAC	2	10	19620	19629	20 %	0 %	40 %	40 %	74316036
543	NC_007404	CGC	2	6	19695	19700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316036
544	NC_007404	AC	3	6	19715	19720	50 %	0 %	0 %	50 %	74316036
545	NC_007404	AAG	2	6	19724	19729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316036
546	NC_007404	TGACAG	2	12	19746	19757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	74316036
547	NC_007404	TGA	2	6	19785	19790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316036
548	NC_007404	CAC	2	6	19874	19879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316036
549	NC_007404	CGGG	2	8	19908	19915	0 %	0 %	75 %	25 %	74316036
550	NC_007404	GCG	2	6	19916	19921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316036
551	NC_007404	GA	3	6	19956	19961	50 %	0 %	50 %	0 %	74316036
552	NC_007404	TCG	3	9	19982	19990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316037
553	NC_007404	ACG	2	6	19991	19996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316037
554	NC_007404	GTT	2	6	20013	20018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316037
555	NC_007404	CGA	2	6	20034	20039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316037
556	NC_007404	ACG	2	6	20045	20050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316037
557	NC_007404	CG	3	6	20080	20085	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
558	NC_007404	CG	3	6	20089	20094	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
559	NC_007404	GCC	2	6	20099	20104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316037
560	NC_007404	TGC	2	6	20114	20119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316037
561	NC_007404	CGG	3	9	20172	20180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316037
562	NC_007404	CGT	2	6	20196	20201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316037
563	NC_007404	ATG	2	6	20203	20208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316037
564	NC_007404	CAA	2	6	20310	20315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316037
565	NC_007404	GC	4	8	20346	20353	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
566	NC_007404	GCA	2	6	20381	20386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316037
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568	NC_007404	GC	3	6	20483	20488	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
569	NC_007404	GC	3	6	20536	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
570	NC_007404	TCG	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316037
571	NC_007404	GCC	2	6	20618	20623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316037
572	NC_007404	GCT	3	9	20643	20651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316037
573	NC_007404	GCG	2	6	20669	20674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316037
574	NC_007404	AGC	2	6	20692	20697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316037
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580	NC_007404	GCGA	2	8	20971	20978	25 %	0 %	50 %	25 %	74316037
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582	NC_007404	GCCG	2	8	21030	21037	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
583	NC_007404	GC	3	6	21076	21081	0 %	0 %	50 %	50 %	74316037
584	NC_007404	GAAG	2	8	21120	21127	50 %	0 %	50 %	0 %	74316037
585	NC_007404	GCA	2	6	21131	21136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316037
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594	NC_007404	GCT	2	6	21367	21372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
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597	NC_007404	GAC	2	6	21446	21451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316038
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599	NC_007404	TCG	2	6	21495	21500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
600	NC_007404	CG	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	74316038
601	NC_007404	CGA	2	6	21610	21615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316038
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608	NC_007404	GCG	2	6	21928	21933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316038
609	NC_007404	GCG	2	6	21969	21974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316038
610	NC_007404	CGC	2	6	21986	21991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316038
611	NC_007404	GGC	2	6	21994	21999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316038
612	NC_007404	CAA	2	6	22039	22044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316038
613	NC_007404	GTC	2	6	22046	22051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
614	NC_007404	CAC	2	6	22076	22081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316038
615	NC_007404	TGC	2	6	22089	22094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
616	NC_007404	CGAC	2	8	22104	22111	25 %	0 %	25 %	50 %	74316038
617	NC_007404	GAG	2	6	22112	22117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316038
618	NC_007404	TCGA	2	8	22142	22149	25 %	25 %	25 %	25 %	74316038
619	NC_007404	GC	3	6	22158	22163	0 %	0 %	50 %	50 %	74316038
620	NC_007404	ACG	3	9	22170	22178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316038
621	NC_007404	ACA	2	6	22182	22187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316038
622	NC_007404	GCT	2	6	22198	22203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
623	NC_007404	GC	3	6	22218	22223	0 %	0 %	50 %	50 %	74316038
624	NC_007404	GCG	2	6	22250	22255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316038
625	NC_007404	GCG	2	6	22275	22280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316038
626	NC_007404	TGT	2	6	22326	22331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316038
627	NC_007404	CCG	2	6	22339	22344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316038
628	NC_007404	CGCGG	2	10	22376	22385	0 %	0 %	60 %	40 %	74316038
629	NC_007404	TCG	2	6	22401	22406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
630	NC_007404	GTC	2	6	22433	22438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316038
631	NC_007404	CGC	2	6	22483	22488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316038
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681	NC_007404	CCGC	2	8	24134	24141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
682	NC_007404	GGA	2	6	24243	24248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316040
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737	NC_007404	GGC	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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752	NC_007404	CG	3	6	26939	26944	0 %	0 %	50 %	50 %	74316043
753	NC_007404	TTGT	2	8	26969	26976	0 %	75 %	25 %	0 %	74316043
754	NC_007404	CA	3	6	27143	27148	50 %	0 %	0 %	50 %	74316044
755	NC_007404	CGG	2	6	27184	27189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316044
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