MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77001	NC_007404	CGC	2	6	2908561	2908566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318843
77002	NC_007404	GCG	2	6	2908567	2908572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318843
77003	NC_007404	GTA	2	6	2908595	2908600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318843
77004	NC_007404	GAC	2	6	2908634	2908639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77005	NC_007404	CG	3	6	2908669	2908674	0 %	0 %	50 %	50 %	74318843
77006	NC_007404	TCT	2	6	2908687	2908692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74318843
77007	NC_007404	CGC	2	6	2908702	2908707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318843
77008	NC_007404	GC	3	6	2908706	2908711	0 %	0 %	50 %	50 %	74318843
77009	NC_007404	CGT	2	6	2908714	2908719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77010	NC_007404	GCCGC	2	10	2908746	2908755	0 %	0 %	40 %	60 %	74318843
77011	NC_007404	TGC	2	6	2908792	2908797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77012	NC_007404	CGC	2	6	2908813	2908818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318843
77013	NC_007404	CGA	2	6	2908819	2908824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77014	NC_007404	CTG	2	6	2908854	2908859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77015	NC_007404	AGC	2	6	2908911	2908916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77016	NC_007404	CGC	2	6	2908933	2908938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318843
77017	NC_007404	TCG	2	6	2908951	2908956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77018	NC_007404	CG	3	6	2908955	2908960	0 %	0 %	50 %	50 %	74318843
77019	NC_007404	CGA	2	6	2908975	2908980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77020	NC_007404	GC	5	10	2908983	2908992	0 %	0 %	50 %	50 %	74318843
77021	NC_007404	GCCG	2	8	2909066	2909073	0 %	0 %	50 %	50 %	74318843
77022	NC_007404	CAG	4	12	2909135	2909146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318843
77023	NC_007404	GGGAC	2	10	2909192	2909201	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77024	NC_007404	G	6	6	2909233	2909238	0 %	0 %	100 %	0 %	74318844
77025	NC_007404	GCC	2	6	2909241	2909246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318844
77026	NC_007404	CG	3	6	2909267	2909272	0 %	0 %	50 %	50 %	74318844
77027	NC_007404	GC	3	6	2909280	2909285	0 %	0 %	50 %	50 %	74318844
77028	NC_007404	CG	3	6	2909305	2909310	0 %	0 %	50 %	50 %	74318844
77029	NC_007404	TCG	2	6	2909313	2909318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318844
77030	NC_007404	GAC	2	6	2909345	2909350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318844
77031	NC_007404	CGCA	2	8	2909397	2909404	25 %	0 %	25 %	50 %	74318844
77032	NC_007404	GC	4	8	2909430	2909437	0 %	0 %	50 %	50 %	74318844
77033	NC_007404	CGA	2	6	2909452	2909457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318844
77034	NC_007404	CCATCA	2	12	2909497	2909508	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	74318844
77035	NC_007404	GC	3	6	2909523	2909528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77036	NC_007404	GAC	2	6	2909564	2909569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77037	NC_007404	CG	4	8	2909594	2909601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77038	NC_007404	GCG	2	6	2909610	2909615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77039	NC_007404	GGCG	2	8	2909628	2909635	0 %	0 %	75 %	25 %	74318845
77040	NC_007404	GCG	2	6	2909647	2909652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318845
77041	NC_007404	TGA	2	6	2909658	2909663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318845
77042	NC_007404	CG	3	6	2909665	2909670	0 %	0 %	50 %	50 %	74318845
77043	NC_007404	TGCG	2	8	2909688	2909695	0 %	25 %	50 %	25 %	74318845
77044	NC_007404	GCG	2	6	2909716	2909721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318845
77045	NC_007404	GCA	2	6	2909767	2909772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77046	NC_007404	CGC	2	6	2909785	2909790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.