MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_007404	CGC	2	6	2426876	2426881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318370
64003	NC_007404	CGAT	2	8	2426971	2426978	25 %	25 %	25 %	25 %	74318370
64004	NC_007404	CCG	2	6	2427005	2427010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318370
64005	NC_007404	T	6	6	2427058	2427063	0 %	100 %	0 %	0 %	74318370
64006	NC_007404	GTC	2	6	2427077	2427082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318370
64007	NC_007404	ACAGCG	2	12	2427112	2427123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318370
64008	NC_007404	CAT	2	6	2427137	2427142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74318370
64009	NC_007404	GCA	2	6	2427285	2427290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318370
64010	NC_007404	CG	3	6	2427312	2427317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64011	NC_007404	GCA	2	6	2427360	2427365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64012	NC_007404	GCA	3	9	2427426	2427434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64013	NC_007404	GCG	2	6	2427468	2427473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64014	NC_007404	CCG	2	6	2427496	2427501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318371
64015	NC_007404	CGC	2	6	2427540	2427545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318371
64016	NC_007404	CCG	2	6	2427580	2427585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318371
64017	NC_007404	TTCGAG	2	12	2427705	2427716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	74318371
64018	NC_007404	GGC	2	6	2427788	2427793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64019	NC_007404	GTCG	2	8	2427840	2427847	0 %	25 %	50 %	25 %	74318371
64020	NC_007404	GC	3	6	2427906	2427911	0 %	0 %	50 %	50 %	74318371
64021	NC_007404	TGA	2	6	2427929	2427934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318371
64022	NC_007404	CGAT	2	8	2427967	2427974	25 %	25 %	25 %	25 %	74318371
64023	NC_007404	GCA	2	6	2427998	2428003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318371
64024	NC_007404	TGGAGC	2	12	2428012	2428023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74318371
64025	NC_007404	AGC	2	6	2428084	2428089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318371
64026	NC_007404	CG	3	6	2428123	2428128	0 %	0 %	50 %	50 %	74318371
64027	NC_007404	GGCCG	2	10	2428143	2428152	0 %	0 %	60 %	40 %	74318371
64028	NC_007404	CGC	2	6	2428206	2428211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318371
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64030	NC_007404	GCG	2	6	2428233	2428238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64031	NC_007404	AGC	3	9	2428243	2428251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318371
64032	NC_007404	CGC	2	6	2428296	2428301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318371
64033	NC_007404	GCG	2	6	2428304	2428309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64034	NC_007404	GC	3	6	2428323	2428328	0 %	0 %	50 %	50 %	74318371
64035	NC_007404	GCC	2	6	2428356	2428361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318371
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64037	NC_007404	C	6	6	2428400	2428405	0 %	0 %	0 %	100 %	74318371
64038	NC_007404	CGG	2	6	2428429	2428434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64039	NC_007404	GCG	2	6	2428472	2428477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64040	NC_007404	GCCG	2	8	2428500	2428507	0 %	0 %	50 %	50 %	74318371
64041	NC_007404	CGCGG	2	10	2428548	2428557	0 %	0 %	60 %	40 %	74318371
64042	NC_007404	GCG	2	6	2428562	2428567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318371
64043	NC_007404	GTC	2	6	2428614	2428619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318371
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64046	NC_007404	GC	3	6	2428719	2428724	0 %	0 %	50 %	50 %	74318371
64047	NC_007404	TCG	2	6	2428826	2428831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318372
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64049	NC_007404	TGC	2	6	2428877	2428882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318372
64050	NC_007404	CGC	2	6	2428985	2428990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318372
64051	NC_007404	GC	4	8	2429070	2429077	0 %	0 %	50 %	50 %	74318372
64052	NC_007404	TCGG	2	8	2429080	2429087	0 %	25 %	50 %	25 %	74318372
64053	NC_007404	CGG	3	9	2429090	2429098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318372
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64055	NC_007404	GTC	2	6	2429169	2429174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318372
64056	NC_007404	GAT	2	6	2429193	2429198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318372
64057	NC_007404	ATG	2	6	2429230	2429235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318372
64058	NC_007404	CGG	2	6	2429238	2429243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318372
64059	NC_007404	CG	4	8	2429254	2429261	0 %	0 %	50 %	50 %	74318372
64060	NC_007404	GCC	2	6	2429264	2429269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318372
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64062	NC_007404	CAT	2	6	2429298	2429303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74318372
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64065	NC_007404	CGG	2	6	2429369	2429374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318372
64066	NC_007404	CGA	2	6	2429411	2429416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318372
64067	NC_007404	GTC	2	6	2429433	2429438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318372
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64070	NC_007404	CCTG	2	8	2429536	2429543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64071	NC_007404	GC	3	6	2429593	2429598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64072	NC_007404	GAC	2	6	2429612	2429617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64079	NC_007404	CGA	2	6	2429815	2429820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318373
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64084	NC_007404	CGGCTA	3	18	2429884	2429901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74318373
64085	NC_007404	GCA	2	6	2429911	2429916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318373
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64087	NC_007404	GAG	2	6	2429979	2429984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64088	NC_007404	CCCGCG	2	12	2430083	2430094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318374
64089	NC_007404	GCCGC	2	10	2430132	2430141	0 %	0 %	40 %	60 %	74318374
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64099	NC_007404	ACG	2	6	2430413	2430418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318374
64100	NC_007404	GAAG	2	8	2430511	2430518	50 %	0 %	50 %	0 %	74318374
64101	NC_007404	CGCC	2	8	2430574	2430581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64102	NC_007404	CGC	2	6	2430626	2430631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318375
64103	NC_007404	ACG	2	6	2430667	2430672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318375
64104	NC_007404	CGT	2	6	2430686	2430691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318375
64105	NC_007404	ACG	2	6	2430736	2430741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318375
64106	NC_007404	CGG	2	6	2430764	2430769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318375
64107	NC_007404	ACC	2	6	2430796	2430801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74318375
64108	NC_007404	TGC	2	6	2430817	2430822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318375
64109	NC_007404	GCG	2	6	2430904	2430909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318375
64110	NC_007404	CCA	3	9	2430914	2430922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74318375
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64113	NC_007404	GTC	2	6	2431050	2431055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318376
64114	NC_007404	CG	3	6	2431093	2431098	0 %	0 %	50 %	50 %	74318376
64115	NC_007404	ATC	2	6	2431119	2431124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74318376
64116	NC_007404	GCG	2	6	2431147	2431152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318376
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64118	NC_007404	GTC	2	6	2431209	2431214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318376
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64350	NC_007404	GTC	2	6	2439564	2439569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318381
64351	NC_007404	GGCG	2	8	2439582	2439589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64352	NC_007404	CGA	2	6	2439649	2439654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64355	NC_007404	CAT	2	6	2439724	2439729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74318382
64356	NC_007404	CGG	2	6	2439825	2439830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318382
64357	NC_007404	GCA	2	6	2439919	2439924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318382
64358	NC_007404	GAT	2	6	2439931	2439936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318382
64359	NC_007404	GCG	4	12	2439942	2439953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318382
64360	NC_007404	GCG	2	6	2439977	2439982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318382
64361	NC_007404	GCA	2	6	2439984	2439989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318382
64362	NC_007404	CGA	2	6	2440009	2440014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318382
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64365	NC_007404	CGG	2	6	2440108	2440113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318382
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64368	NC_007404	TCG	2	6	2440224	2440229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318382
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64391	NC_007404	GC	3	6	2441447	2441452	0 %	0 %	50 %	50 %	74318385
64392	NC_007404	GCCGC	2	10	2441455	2441464	0 %	0 %	40 %	60 %	74318385
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64403	NC_007404	GCA	2	6	2441734	2441739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318385
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64451	NC_007404	GCT	2	6	2443404	2443409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318387
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64458	NC_007404	GCT	2	6	2443659	2443664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318387
64459	NC_007404	AGC	2	6	2443696	2443701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318387
64460	NC_007404	GCA	2	6	2443751	2443756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318387
64461	NC_007404	TCA	2	6	2443772	2443777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74318387
64462	NC_007404	GCC	3	9	2443830	2443838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318387
64463	NC_007404	CTT	2	6	2443854	2443859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74318387
64464	NC_007404	CGG	2	6	2443916	2443921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318387
64465	NC_007404	CTT	2	6	2443941	2443946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74318387
64466	NC_007404	GAA	2	6	2444014	2444019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64467	NC_007404	GCC	2	6	2444151	2444156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318388
64468	NC_007404	GAT	2	6	2444163	2444168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318388
64469	NC_007404	GCC	2	6	2444232	2444237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318388
64470	NC_007404	CCGG	2	8	2444255	2444262	0 %	0 %	50 %	50 %	74318388
64471	NC_007404	CGTCC	2	10	2444274	2444283	0 %	20 %	20 %	60 %	74318388
64472	NC_007404	GCG	2	6	2444305	2444310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318388
64473	NC_007404	CGG	2	6	2444333	2444338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318388
64474	NC_007404	GCT	2	6	2444339	2444344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318388
64475	NC_007404	CGA	2	6	2444394	2444399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318388
64476	NC_007404	CAG	2	6	2444430	2444435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74318388
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64478	NC_007404	ATG	2	6	2444551	2444556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74318388
64479	NC_007404	AGGA	2	8	2444575	2444582	50 %	0 %	50 %	0 %	74318388
64480	NC_007404	GCC	2	6	2444590	2444595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318388
64481	NC_007404	CAGCC	2	10	2444604	2444613	20 %	0 %	20 %	60 %	74318388
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64483	NC_007404	CGG	2	6	2444669	2444674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318388
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64487	NC_007404	ATCG	2	8	2444919	2444926	25 %	25 %	25 %	25 %	74318388
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64492	NC_007404	TCT	2	6	2445158	2445163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74318388
64493	NC_007404	CGT	2	6	2445185	2445190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318388
64494	NC_007404	CCG	2	6	2445202	2445207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74318388
64495	NC_007404	GCG	3	9	2445220	2445228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74318388
64496	NC_007404	CT	3	6	2445229	2445234	0 %	50 %	0 %	50 %	74318388
64497	NC_007404	TCG	2	6	2445235	2445240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318388
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64499	NC_007404	GCCT	2	8	2445300	2445307	0 %	25 %	25 %	50 %	74318388
64500	NC_007404	GTC	2	6	2445330	2445335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74318388

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