MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007404	CGC	2	6	201967	201972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316207
5502	NC_007404	GGAC	2	8	202045	202052	25 %	0 %	50 %	25 %	74316207
5503	NC_007404	TCG	2	6	202053	202058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5504	NC_007404	TGA	2	6	202074	202079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316207
5505	NC_007404	ACG	2	6	202080	202085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5506	NC_007404	ATG	2	6	202160	202165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316207
5507	NC_007404	CGC	2	6	202177	202182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316207
5508	NC_007404	TGC	2	6	202237	202242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5509	NC_007404	TCGGC	2	10	202284	202293	0 %	20 %	40 %	40 %	74316207
5510	NC_007404	CGA	2	6	202348	202353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5511	NC_007404	GGAT	2	8	202371	202378	25 %	25 %	50 %	0 %	74316207
5512	NC_007404	AGG	2	6	202383	202388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316207
5513	NC_007404	CGG	2	6	202439	202444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316207
5514	NC_007404	GC	3	6	202461	202466	0 %	0 %	50 %	50 %	74316207
5515	NC_007404	GCG	2	6	202488	202493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316207
5516	NC_007404	GGCT	2	8	202526	202533	0 %	25 %	50 %	25 %	74316207
5517	NC_007404	CGA	2	6	202534	202539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5518	NC_007404	GC	3	6	202576	202581	0 %	0 %	50 %	50 %	74316207
5519	NC_007404	CG	4	8	202609	202616	0 %	0 %	50 %	50 %	74316207
5520	NC_007404	CGC	2	6	202618	202623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316207
5521	NC_007404	G	6	6	202655	202660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_007404	TCGA	2	8	202770	202777	25 %	25 %	25 %	25 %	74316208
5523	NC_007404	CAT	2	6	202780	202785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316208
5524	NC_007404	GAA	2	6	202853	202858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316208
5525	NC_007404	ACG	2	6	202899	202904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316208
5526	NC_007404	CAA	2	6	202912	202917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316208
5527	NC_007404	AAG	2	6	202976	202981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316208
5528	NC_007404	TCG	2	6	203025	203030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316208
5529	NC_007404	CACGGT	2	12	203032	203043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74316208
5530	NC_007404	CGA	2	6	203074	203079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316208
5531	NC_007404	GC	4	8	203107	203114	0 %	0 %	50 %	50 %	74316208
5532	NC_007404	CGA	2	6	203152	203157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316208
5533	NC_007404	ATC	2	6	203240	203245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316208
5534	NC_007404	AAC	2	6	203318	203323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316208
5535	NC_007404	CTG	2	6	203342	203347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316208
5536	NC_007404	CGG	2	6	203392	203397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316208
5537	NC_007404	CTT	2	6	203437	203442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316208
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5539	NC_007404	GCT	2	6	203476	203481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316208
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5541	NC_007404	ACG	2	6	203516	203521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316209
5542	NC_007404	GGCT	2	8	203542	203549	0 %	25 %	50 %	25 %	74316209
5543	NC_007404	AAG	2	6	203581	203586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316209
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5547	NC_007404	CG	3	6	203637	203642	0 %	0 %	50 %	50 %	74316209
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5554	NC_007404	CGA	2	6	204006	204011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316209
5555	NC_007404	GAA	2	6	204040	204045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316209
5556	NC_007404	TCG	2	6	204116	204121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316209
5557	NC_007404	CGG	2	6	204291	204296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316209
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5559	NC_007404	GC	5	10	204395	204404	0 %	0 %	50 %	50 %	74316210
5560	NC_007404	ACA	2	6	204421	204426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316210
5561	NC_007404	CGA	2	6	204458	204463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316210
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5565	NC_007404	GCG	2	6	204567	204572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316210
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5567	NC_007404	GCAG	2	8	204648	204655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5569	NC_007404	CGC	2	6	204664	204669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_007404	TTC	2	6	204679	204684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316211
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5572	NC_007404	CGCAG	2	10	204697	204706	20 %	0 %	40 %	40 %	74316211
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5574	NC_007404	GC	3	6	204903	204908	0 %	0 %	50 %	50 %	74316211
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5582	NC_007404	GC	3	6	205363	205368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_007404	CGCT	2	8	205380	205387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_007404	A	6	6	205426	205431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_007404	GCG	2	6	205651	205656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316212
5592	NC_007404	CGT	2	6	205671	205676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316212
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5595	NC_007404	GGCGCC	2	12	205713	205724	0 %	0 %	50 %	50 %	74316212
5596	NC_007404	CGA	2	6	205772	205777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316212
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5610	NC_007404	CTG	2	6	206487	206492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_007404	AAAG	2	8	206511	206518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_007404	CG	3	6	206540	206545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_007404	CG	3	6	206562	206567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_007404	AGC	2	6	206575	206580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316213
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5622	NC_007404	GGCCT	2	10	206776	206785	0 %	20 %	40 %	40 %	74316213
5623	NC_007404	CCCAG	2	10	206799	206808	20 %	0 %	20 %	60 %	74316213
5624	NC_007404	GC	4	8	206868	206875	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5625	NC_007404	GCT	2	6	206883	206888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5626	NC_007404	GC	5	10	206969	206978	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5627	NC_007404	GTA	2	6	206995	207000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316213
5628	NC_007404	GCG	2	6	207014	207019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316213
5629	NC_007404	CGC	2	6	207021	207026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316213
5630	NC_007404	TGC	2	6	207038	207043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5631	NC_007404	CGG	2	6	207062	207067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316213
5632	NC_007404	GCC	2	6	207071	207076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316213
5633	NC_007404	CCGGC	2	10	207129	207138	0 %	0 %	40 %	60 %	74316213
5634	NC_007404	GC	3	6	207150	207155	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5635	NC_007404	CGG	2	6	207228	207233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316213
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5641	NC_007404	TCG	2	6	207380	207385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5642	NC_007404	GTC	2	6	207490	207495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5643	NC_007404	GGT	2	6	207537	207542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316213
5644	NC_007404	GCGG	2	8	207655	207662	0 %	0 %	75 %	25 %	74316213
5645	NC_007404	TCGA	2	8	207677	207684	25 %	25 %	25 %	25 %	74316213
5646	NC_007404	GC	4	8	207762	207769	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
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5652	NC_007404	GCG	2	6	207980	207985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316213
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5655	NC_007404	TCG	2	6	208079	208084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5656	NC_007404	CGG	2	6	208104	208109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316213
5657	NC_007404	CGTA	2	8	208132	208139	25 %	25 %	25 %	25 %	74316213
5658	NC_007404	CGAGCG	2	12	208158	208169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316213
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5660	NC_007404	CGC	2	6	208183	208188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316213
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5666	NC_007404	CG	5	10	208593	208602	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5667	NC_007404	GTTCG	2	10	208660	208669	0 %	40 %	40 %	20 %	74316213
5668	NC_007404	AGCG	2	8	208693	208700	25 %	0 %	50 %	25 %	74316213
5669	NC_007404	GC	3	6	208757	208762	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
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5671	NC_007404	CG	3	6	208797	208802	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5672	NC_007404	CGC	2	6	208807	208812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316213
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5678	NC_007404	CG	4	8	209010	209017	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5679	NC_007404	CAG	3	9	209029	209037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5680	NC_007404	CAG	2	6	209149	209154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5681	NC_007404	TTC	2	6	209180	209185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316213
5682	NC_007404	TTC	2	6	209195	209200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316213
5683	NC_007404	GC	3	6	209249	209254	0 %	0 %	50 %	50 %	74316213
5684	NC_007404	GCG	2	6	209304	209309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316213
5685	NC_007404	CAG	2	6	209326	209331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316213
5686	NC_007404	GGC	2	6	209388	209393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5687	NC_007404	TTG	2	6	209407	209412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316214
5688	NC_007404	TTCCTG	2	12	209439	209450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	74316214
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5690	NC_007404	GC	4	8	209493	209500	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5691	NC_007404	GCG	2	6	209530	209535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5692	NC_007404	CGG	2	6	209552	209557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5693	NC_007404	TTG	2	6	209616	209621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316214
5694	NC_007404	GC	4	8	209678	209685	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5695	NC_007404	CG	3	6	209704	209709	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
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5702	NC_007404	GC	3	6	209921	209926	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5703	NC_007404	GGCG	2	8	209942	209949	0 %	0 %	75 %	25 %	74316214
5704	NC_007404	CGC	2	6	210054	210059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316214
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5706	NC_007404	TTCGAT	2	12	210123	210134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	74316214
5707	NC_007404	CAG	3	9	210141	210149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5708	NC_007404	GC	4	8	210201	210208	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5709	NC_007404	GCG	2	6	210211	210216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5710	NC_007404	CCAC	2	8	210224	210231	25 %	0 %	0 %	75 %	74316214
5711	NC_007404	GCG	2	6	210254	210259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5712	NC_007404	GCG	2	6	210415	210420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5713	NC_007404	GCA	2	6	210431	210436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5714	NC_007404	CCAG	2	8	210497	210504	25 %	0 %	25 %	50 %	74316214
5715	NC_007404	TCG	2	6	210520	210525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5716	NC_007404	GC	3	6	210609	210614	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
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5720	NC_007404	CG	6	12	210708	210719	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
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5722	NC_007404	GCG	2	6	210799	210804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
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5730	NC_007404	GTC	2	6	211077	211082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5731	NC_007404	GC	3	6	211113	211118	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5732	NC_007404	CGT	2	6	211121	211126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5733	NC_007404	GGC	2	6	211152	211157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5734	NC_007404	CAG	2	6	211158	211163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5735	NC_007404	TTG	2	6	211204	211209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316214
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5737	NC_007404	C	7	7	211257	211263	0 %	0 %	0 %	100 %	74316214
5738	NC_007404	CCG	2	6	211304	211309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316214
5739	NC_007404	CG	5	10	211319	211328	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5740	NC_007404	CCTT	2	8	211339	211346	0 %	50 %	0 %	50 %	74316214
5741	NC_007404	GC	3	6	211358	211363	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5742	NC_007404	GCT	2	6	211383	211388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5743	NC_007404	GC	3	6	211403	211408	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5744	NC_007404	GC	3	6	211422	211427	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
5745	NC_007404	G	6	6	211490	211495	0 %	0 %	100 %	0 %	74316214
5746	NC_007404	CGG	2	6	211532	211537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316214
5747	NC_007404	CAG	3	9	211569	211577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316214
5748	NC_007404	TCG	2	6	211612	211617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316214
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5750	NC_007404	GC	3	6	211728	211733	0 %	0 %	50 %	50 %	74316214
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5857	NC_007404	TGC	2	6	215181	215186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316216
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5861	NC_007404	GCA	2	6	215289	215294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316216
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5864	NC_007404	GCG	2	6	215463	215468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316216
5865	NC_007404	GGC	2	6	215476	215481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316216
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5867	NC_007404	CGG	2	6	215549	215554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316216
5868	NC_007404	CGA	2	6	215565	215570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316216
5869	NC_007404	AGG	2	6	215627	215632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316216
5870	NC_007404	AGC	2	6	215633	215638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316216
5871	NC_007404	GC	3	6	215660	215665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5872	NC_007404	GTA	2	6	215750	215755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316217
5873	NC_007404	TCG	2	6	215787	215792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316217
5874	NC_007404	TCA	2	6	215967	215972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316217
5875	NC_007404	TCG	2	6	216015	216020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316217
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5981	NC_007404	CCG	2	6	220237	220242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5982	NC_007404	GC	3	6	220244	220249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5983	NC_007404	CCG	2	6	220322	220327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5984	NC_007404	TTG	2	6	220414	220419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5985	NC_007404	A	7	7	220429	220435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5986	NC_007404	AAG	2	6	220441	220446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5987	NC_007404	ACG	2	6	220550	220555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316220
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5989	NC_007404	GCTCG	2	10	220708	220717	0 %	20 %	40 %	40 %	74316220
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5991	NC_007404	CGAGGC	2	12	220819	220830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316220
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5993	NC_007404	GAC	2	6	220907	220912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316220
5994	NC_007404	CG	3	6	220933	220938	0 %	0 %	50 %	50 %	74316220
5995	NC_007404	CGC	2	6	220963	220968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316220
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5997	NC_007404	GCC	2	6	221027	221032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316220
5998	NC_007404	CTG	2	6	221051	221056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316220
5999	NC_007404	GGC	2	6	221063	221068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316220
6000	NC_007404	ATC	2	6	221087	221092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316220

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