MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007404	ATG	2	6	182114	182119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_007404	CCTA	2	8	182157	182164	25 %	25 %	0 %	50 %	74316186
5003	NC_007404	TGC	2	6	182200	182205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5004	NC_007404	CGT	2	6	182216	182221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5005	NC_007404	TCG	2	6	182254	182259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5006	NC_007404	CGC	2	6	182324	182329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316186
5007	NC_007404	GTGC	2	8	182333	182340	0 %	25 %	50 %	25 %	74316186
5008	NC_007404	GCC	2	6	182373	182378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316186
5009	NC_007404	GGC	2	6	182423	182428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316186
5010	NC_007404	GCT	2	6	182444	182449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5011	NC_007404	GGCT	2	8	182451	182458	0 %	25 %	50 %	25 %	74316186
5012	NC_007404	GCG	2	6	182459	182464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316186
5013	NC_007404	TGGCG	2	10	182473	182482	0 %	20 %	60 %	20 %	74316186
5014	NC_007404	TGC	2	6	182515	182520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5015	NC_007404	CGG	2	6	182530	182535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316186
5016	NC_007404	CGG	2	6	182554	182559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316186
5017	NC_007404	AGGCCG	2	12	182560	182571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316186
5018	NC_007404	GAC	2	6	182637	182642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5019	NC_007404	CGG	2	6	182707	182712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316186
5020	NC_007404	CCA	2	6	182729	182734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74316186
5021	NC_007404	GC	3	6	182740	182745	0 %	0 %	50 %	50 %	74316186
5022	NC_007404	GCTG	2	8	182764	182771	0 %	25 %	50 %	25 %	74316186
5023	NC_007404	GC	3	6	182790	182795	0 %	0 %	50 %	50 %	74316186
5024	NC_007404	CGT	2	6	182813	182818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5025	NC_007404	CGA	2	6	182855	182860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316186
5026	NC_007404	CTGT	2	8	182882	182889	0 %	50 %	25 %	25 %	74316186
5027	NC_007404	GGGGC	2	10	182890	182899	0 %	0 %	80 %	20 %	74316186
5028	NC_007404	GC	3	6	182996	183001	0 %	0 %	50 %	50 %	74316187
5029	NC_007404	GCG	2	6	183011	183016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316187
5030	NC_007404	CGA	2	6	183069	183074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316187
5031	NC_007404	GGC	2	6	183178	183183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316187
5032	NC_007404	CCG	2	6	183210	183215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316187
5033	NC_007404	GCA	2	6	183219	183224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316187
5034	NC_007404	CGC	2	6	183239	183244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316187
5035	NC_007404	TCA	2	6	183303	183308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316187
5036	NC_007404	GC	4	8	183309	183316	0 %	0 %	50 %	50 %	74316187
5037	NC_007404	CG	3	6	183330	183335	0 %	0 %	50 %	50 %	74316187
5038	NC_007404	CGG	2	6	183347	183352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316187
5039	NC_007404	AGCC	2	8	183389	183396	25 %	0 %	25 %	50 %	74316187
5040	NC_007404	CGCGC	2	10	183441	183450	0 %	0 %	40 %	60 %	74316187
5041	NC_007404	AGC	2	6	183497	183502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316187
5042	NC_007404	GC	3	6	183501	183506	0 %	0 %	50 %	50 %	74316187
5043	NC_007404	GC	3	6	183533	183538	0 %	0 %	50 %	50 %	74316187
5044	NC_007404	GGC	2	6	183564	183569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316187
5045	NC_007404	CGA	2	6	183579	183584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316187
5046	NC_007404	AGC	2	6	183611	183616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316187
5047	NC_007404	GCA	2	6	183657	183662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316187
5048	NC_007404	GCG	2	6	183685	183690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316187
5049	NC_007404	GCGCG	2	10	183738	183747	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5050	NC_007404	AGC	2	6	183806	183811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_007404	T	6	6	183816	183821	0 %	100 %	0 %	0 %	74316188
5052	NC_007404	CGC	2	6	183844	183849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5053	NC_007404	TCG	2	6	183888	183893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316188
5054	NC_007404	GTC	2	6	183916	183921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316188
5055	NC_007404	CCT	2	6	183970	183975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74316188
5056	NC_007404	GCC	2	6	183978	183983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5057	NC_007404	GCC	2	6	183986	183991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5058	NC_007404	GCC	2	6	183995	184000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5059	NC_007404	ACCA	2	8	184022	184029	50 %	0 %	0 %	50 %	74316188
5060	NC_007404	CGCC	2	8	184038	184045	0 %	0 %	25 %	75 %	74316188
5061	NC_007404	CCGA	2	8	184047	184054	25 %	0 %	25 %	50 %	74316188
5062	NC_007404	CGC	2	6	184066	184071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5063	NC_007404	CGA	2	6	184072	184077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316188
5064	NC_007404	TCGA	2	8	184116	184123	25 %	25 %	25 %	25 %	74316188
5065	NC_007404	CGA	2	6	184141	184146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316188
5066	NC_007404	GCC	2	6	184199	184204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5067	NC_007404	CCG	2	6	184210	184215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5068	NC_007404	CCG	2	6	184221	184226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316188
5069	NC_007404	GAC	2	6	184272	184277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316188
5070	NC_007404	CTC	2	6	184292	184297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_007404	GCC	2	6	184468	184473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316189
5072	NC_007404	CGG	2	6	184539	184544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316189
5073	NC_007404	CGC	2	6	184578	184583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316189
5074	NC_007404	CG	3	6	184633	184638	0 %	0 %	50 %	50 %	74316189
5075	NC_007404	GC	3	6	184699	184704	0 %	0 %	50 %	50 %	74316189
5076	NC_007404	GCA	2	6	184737	184742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316189
5077	NC_007404	GCAC	2	8	184785	184792	25 %	0 %	25 %	50 %	74316189
5078	NC_007404	TGC	2	6	184880	184885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316189
5079	NC_007404	GC	3	6	184940	184945	0 %	0 %	50 %	50 %	74316189
5080	NC_007404	CGT	2	6	184947	184952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316189
5081	NC_007404	GTC	2	6	185002	185007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316189
5082	NC_007404	GGT	2	6	185014	185019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316189
5083	NC_007404	CG	3	6	185067	185072	0 %	0 %	50 %	50 %	74316189
5084	NC_007404	TCG	2	6	185114	185119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316189
5085	NC_007404	CGC	2	6	185145	185150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316189
5086	NC_007404	AGC	2	6	185153	185158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316189
5087	NC_007404	GCC	2	6	185188	185193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316189
5088	NC_007404	GGCG	2	8	185340	185347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_007404	GGC	2	6	185395	185400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_007404	CGGC	3	12	185397	185408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_007404	CCGG	2	8	185421	185428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_007404	CGG	2	6	185465	185470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316190
5093	NC_007404	CCG	2	6	185492	185497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316190
5094	NC_007404	CG	3	6	185514	185519	0 %	0 %	50 %	50 %	74316190
5095	NC_007404	TGA	2	6	185522	185527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316190
5096	NC_007404	CGGT	2	8	185551	185558	0 %	25 %	50 %	25 %	74316190
5097	NC_007404	GCC	2	6	185560	185565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316190
5098	NC_007404	CAG	2	6	185580	185585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316190
5099	NC_007404	CGA	2	6	185588	185593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316190
5100	NC_007404	CAG	2	6	185601	185606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316190
5101	NC_007404	CACCG	2	10	185607	185616	20 %	0 %	20 %	60 %	74316190
5102	NC_007404	GC	4	8	185624	185631	0 %	0 %	50 %	50 %	74316190
5103	NC_007404	CGAGCG	2	12	185654	185665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316190
5104	NC_007404	AGC	2	6	185671	185676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316190
5105	NC_007404	GGC	2	6	185721	185726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316190
5106	NC_007404	GGCC	2	8	185732	185739	0 %	0 %	50 %	50 %	74316190
5107	NC_007404	CGG	2	6	185799	185804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316190
5108	NC_007404	CGC	2	6	185813	185818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316190
5109	NC_007404	CG	4	8	185842	185849	0 %	0 %	50 %	50 %	74316191
5110	NC_007404	CGT	2	6	185857	185862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5111	NC_007404	GC	3	6	185890	185895	0 %	0 %	50 %	50 %	74316191
5112	NC_007404	CGA	2	6	185950	185955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5113	NC_007404	CTCGGT	2	12	185978	185989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5114	NC_007404	CAG	2	6	185999	186004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5115	NC_007404	CAG	2	6	186017	186022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5116	NC_007404	CGT	2	6	186032	186037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5117	NC_007404	CTT	2	6	186110	186115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316191
5118	NC_007404	CG	3	6	186140	186145	0 %	0 %	50 %	50 %	74316191
5119	NC_007404	GC	3	6	186257	186262	0 %	0 %	50 %	50 %	74316191
5120	NC_007404	GC	3	6	186273	186278	0 %	0 %	50 %	50 %	74316191
5121	NC_007404	CCG	3	9	186444	186452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316191
5122	NC_007404	CGT	2	6	186550	186555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316191
5123	NC_007404	CCGC	2	8	186567	186574	0 %	0 %	25 %	75 %	74316191
5124	NC_007404	TCT	2	6	186586	186591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316191
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5243	NC_007404	GGC	2	6	191210	191215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316196
5244	NC_007404	GCAC	2	8	191224	191231	25 %	0 %	25 %	50 %	74316196
5245	NC_007404	GCA	2	6	191255	191260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316196
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5369	NC_007404	G	7	7	196247	196253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5371	NC_007404	TGC	2	6	196341	196346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316202
5372	NC_007404	GCGCC	2	10	196429	196438	0 %	0 %	40 %	60 %	74316202
5373	NC_007404	CGA	2	6	196444	196449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316202
5374	NC_007404	CTGG	2	8	196465	196472	0 %	25 %	50 %	25 %	74316202
5375	NC_007404	CG	3	6	196473	196478	0 %	0 %	50 %	50 %	74316202
5376	NC_007404	GC	3	6	196484	196489	0 %	0 %	50 %	50 %	74316202
5377	NC_007404	GCC	2	6	196494	196499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316202
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5380	NC_007404	AGCACC	2	12	196617	196628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	74316202
5381	NC_007404	CTG	2	6	196682	196687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316202
5382	NC_007404	GCGCG	2	10	196718	196727	0 %	0 %	60 %	40 %	74316202
5383	NC_007404	CGA	2	6	196799	196804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5384	NC_007404	CG	3	6	196809	196814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5385	NC_007404	GCGG	2	8	196818	196825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5386	NC_007404	GTC	2	6	196888	196893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316203
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5406	NC_007404	AACC	2	8	197782	197789	50 %	0 %	0 %	50 %	74316203
5407	NC_007404	CAG	2	6	197817	197822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316203
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5411	NC_007404	GCGGG	2	10	197936	197945	0 %	0 %	80 %	20 %	74316203
5412	NC_007404	TGG	2	6	197966	197971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316203
5413	NC_007404	ATG	2	6	197981	197986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5457	NC_007404	CGA	2	6	200127	200132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5482	NC_007404	CGG	2	6	201046	201051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316206
5483	NC_007404	CGGCTA	2	12	201074	201085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74316206
5484	NC_007404	TCCC	2	8	201094	201101	0 %	25 %	0 %	75 %	74316206
5485	NC_007404	CTG	2	6	201126	201131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316206
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5487	NC_007404	GGCT	2	8	201414	201421	0 %	25 %	50 %	25 %	74316206
5488	NC_007404	GCC	2	6	201432	201437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316206
5489	NC_007404	CAA	2	6	201460	201465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5490	NC_007404	AGGG	2	8	201479	201486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_007404	A	6	6	201495	201500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_007404	GAG	2	6	201533	201538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_007404	TGC	2	6	201633	201638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5494	NC_007404	GCG	2	6	201658	201663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316207
5495	NC_007404	CGA	2	6	201691	201696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316207
5496	NC_007404	GTTC	2	8	201757	201764	0 %	50 %	25 %	25 %	74316207
5497	NC_007404	GAG	2	6	201848	201853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316207
5498	NC_007404	CGCCCT	2	12	201874	201885	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	74316207
5499	NC_007404	GTGCCG	2	12	201915	201926	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74316207
5500	NC_007404	GCC	2	6	201932	201937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316207

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