MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 77046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007404	TCG	2	6	162828	162833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4502	NC_007404	GC	3	6	162865	162870	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4503	NC_007404	CGT	2	6	162871	162876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4504	NC_007404	CG	3	6	162878	162883	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4505	NC_007404	CGG	2	6	162976	162981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316170
4506	NC_007404	CGA	2	6	163057	163062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4507	NC_007404	GTC	2	6	163064	163069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4508	NC_007404	GTA	2	6	163091	163096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316170
4509	NC_007404	GTG	2	6	163113	163118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316170
4510	NC_007404	GAC	2	6	163169	163174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4511	NC_007404	GCTTCG	2	12	163188	163199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4512	NC_007404	TCG	2	6	163233	163238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4513	NC_007404	CCG	2	6	163239	163244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316170
4514	NC_007404	GC	3	6	163247	163252	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4515	NC_007404	CGC	2	6	163266	163271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316170
4516	NC_007404	GC	3	6	163276	163281	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4517	NC_007404	CAG	2	6	163304	163309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4518	NC_007404	TCG	2	6	163356	163361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4519	NC_007404	GAA	2	6	163367	163372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316170
4520	NC_007404	TCT	2	6	163390	163395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316170
4521	NC_007404	CGTG	2	8	163415	163422	0 %	25 %	50 %	25 %	74316170
4522	NC_007404	CTG	2	6	163430	163435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4523	NC_007404	CGG	2	6	163498	163503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316170
4524	NC_007404	CG	3	6	163513	163518	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4525	NC_007404	TGA	2	6	163591	163596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316170
4526	NC_007404	GC	3	6	163656	163661	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4527	NC_007404	CGC	2	6	163697	163702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316170
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4529	NC_007404	ATC	2	6	163758	163763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316170
4530	NC_007404	CCCG	2	8	163798	163805	0 %	0 %	25 %	75 %	74316170
4531	NC_007404	CGA	2	6	163813	163818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
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4535	NC_007404	CCGT	2	8	163912	163919	0 %	25 %	25 %	50 %	74316170
4536	NC_007404	GTC	2	6	163964	163969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4537	NC_007404	CG	3	6	163985	163990	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
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4539	NC_007404	CGT	2	6	164014	164019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
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4541	NC_007404	GCCGC	2	10	164133	164142	0 %	0 %	40 %	60 %	74316170
4542	NC_007404	GTC	2	6	164144	164149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
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4544	NC_007404	CGT	2	6	164275	164280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4545	NC_007404	GC	3	6	164306	164311	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
4546	NC_007404	CG	5	10	164320	164329	0 %	0 %	50 %	50 %	74316170
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4549	NC_007404	CGC	2	6	164482	164487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316170
4550	NC_007404	AGC	2	6	164502	164507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
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4552	NC_007404	TCG	2	6	164658	164663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4553	NC_007404	GCT	2	6	164702	164707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4554	NC_007404	GCC	2	6	164732	164737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316170
4555	NC_007404	CGA	2	6	164755	164760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4556	NC_007404	CGT	2	6	164776	164781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
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4558	NC_007404	CAG	2	6	164801	164806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4559	NC_007404	CTG	3	9	164852	164860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4560	NC_007404	TCG	2	6	164865	164870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
4561	NC_007404	GT	3	6	164874	164879	0 %	50 %	50 %	0 %	74316170
4562	NC_007404	GCG	2	6	164931	164936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316170
4563	NC_007404	GTC	2	6	164962	164967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316170
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4568	NC_007404	CTG	2	6	165079	165084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316171
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4570	NC_007404	CG	3	6	165150	165155	0 %	0 %	50 %	50 %	74316171
4571	NC_007404	CAGG	2	8	165156	165163	25 %	0 %	50 %	25 %	74316171
4572	NC_007404	GCA	3	9	165243	165251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316171
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4574	NC_007404	ACG	2	6	165479	165484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316171
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4577	NC_007404	TCGGC	2	10	165498	165507	0 %	20 %	40 %	40 %	74316171
4578	NC_007404	GCG	2	6	165519	165524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316171
4579	NC_007404	GGCG	2	8	165540	165547	0 %	0 %	75 %	25 %	74316171
4580	NC_007404	GCCAG	2	10	165549	165558	20 %	0 %	40 %	40 %	74316171
4581	NC_007404	CGC	2	6	165588	165593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316171
4582	NC_007404	CGA	2	6	165606	165611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316171
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4584	NC_007404	CG	3	6	165754	165759	0 %	0 %	50 %	50 %	74316171
4585	NC_007404	GCC	2	6	165764	165769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316171
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4587	NC_007404	GAA	2	6	165814	165819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316171
4588	NC_007404	GCGCG	2	10	165834	165843	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4589	NC_007404	GCAGC	2	10	165851	165860	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4590	NC_007404	GGCA	2	8	165871	165878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_007404	GGGCG	2	10	165879	165888	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4592	NC_007404	T	6	6	165934	165939	0 %	100 %	0 %	0 %	74316172
4593	NC_007404	GTTGTA	2	12	165961	165972	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	74316172
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4595	NC_007404	CTG	2	6	166007	166012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316172
4596	NC_007404	CGA	2	6	166014	166019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316172
4597	NC_007404	GTC	2	6	166052	166057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316172
4598	NC_007404	TCT	2	6	166095	166100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316172
4599	NC_007404	CGG	2	6	166101	166106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316172
4600	NC_007404	AGC	2	6	166112	166117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316172
4601	NC_007404	GCC	2	6	166175	166180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316172
4602	NC_007404	CGC	2	6	166204	166209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316172
4603	NC_007404	CTCGAT	2	12	166252	166263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	74316172
4604	NC_007404	CG	3	6	166275	166280	0 %	0 %	50 %	50 %	74316172
4605	NC_007404	GAT	2	6	166318	166323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316172
4606	NC_007404	GCC	2	6	166333	166338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316172
4607	NC_007404	CGT	2	6	166341	166346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316172
4608	NC_007404	GCG	2	6	166374	166379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316172
4609	NC_007404	CG	3	6	166407	166412	0 %	0 %	50 %	50 %	74316172
4610	NC_007404	GGC	2	6	166446	166451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316172
4611	NC_007404	TGA	2	6	166452	166457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316172
4612	NC_007404	GC	4	8	166461	166468	0 %	0 %	50 %	50 %	74316172
4613	NC_007404	GTA	2	6	166507	166512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316172
4614	NC_007404	GC	5	10	166530	166539	0 %	0 %	50 %	50 %	74316172
4615	NC_007404	CGGC	2	8	166547	166554	0 %	0 %	50 %	50 %	74316172
4616	NC_007404	TCA	2	6	166635	166640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316172
4617	NC_007404	CCG	2	6	166671	166676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316172
4618	NC_007404	CGGT	2	8	166719	166726	0 %	25 %	50 %	25 %	74316172
4619	NC_007404	CAG	2	6	166744	166749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316172
4620	NC_007404	GCC	2	6	166773	166778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316172
4621	NC_007404	GCA	2	6	166818	166823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316172
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4623	NC_007404	CGC	2	6	166960	166965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316172
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4862	NC_007404	ATG	2	6	176710	176715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74316181
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4865	NC_007404	GCG	2	6	176807	176812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316181
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4867	NC_007404	GACC	2	8	176919	176926	25 %	0 %	25 %	50 %	74316181
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4996	NC_007404	GTGC	2	8	181941	181948	0 %	25 %	50 %	25 %	74316185
4997	NC_007404	CG	3	6	181955	181960	0 %	0 %	50 %	50 %	74316185
4998	NC_007404	CGGG	2	8	181969	181976	0 %	0 %	75 %	25 %	74316185
4999	NC_007404	GAC	2	6	181979	181984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316185
5000	NC_007404	CAA	2	6	182015	182020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74316185

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