MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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20120	NC_006624	AGGA	2	8	1013565	1013572	50 %	0 %	50 %	0 %	57641090
20121	NC_006624	AGG	2	6	1013647	1013652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641090
20122	NC_006624	CTA	2	6	1013672	1013677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57641090
20123	NC_006624	AGG	2	6	1013688	1013693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641090
20124	NC_006624	TCA	2	6	1013695	1013700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57641090
20125	NC_006624	AGG	2	6	1013710	1013715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641090
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20128	NC_006624	GAA	3	9	1013774	1013782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57641090
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20132	NC_006624	CTG	2	6	1013944	1013949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641091
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20139	NC_006624	TGG	2	6	1014483	1014488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20140	NC_006624	TGG	2	6	1014492	1014497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20141	NC_006624	GTTG	2	8	1014500	1014507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20142	NC_006624	GTTTGG	2	12	1014512	1014523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20143	NC_006624	GTA	2	6	1014525	1014530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20144	NC_006624	GTG	2	6	1014531	1014536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20145	NC_006624	CATA	2	8	1014541	1014548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20146	NC_006624	TCT	2	6	1014632	1014637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20147	NC_006624	ACGC	2	8	1014655	1014662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20148	NC_006624	TGAG	2	8	1014784	1014791	25 %	25 %	50 %	0 %	57641092
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20169	NC_006624	CAGC	2	8	1015691	1015698	25 %	0 %	25 %	50 %	57641092
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20225	NC_006624	TGA	2	6	1018009	1018014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57641093
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20230	NC_006624	AGTA	2	8	1018709	1018716	50 %	25 %	25 %	0 %	57641093
20231	NC_006624	AGG	2	6	1018786	1018791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641093
20232	NC_006624	GAA	2	6	1018856	1018861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57641093
20233	NC_006624	CGG	2	6	1018895	1018900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57641093
20234	NC_006624	CGA	2	6	1018913	1018918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57641093
20235	NC_006624	AGG	2	6	1018969	1018974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641093
20236	NC_006624	AGGAT	2	10	1018978	1018987	40 %	20 %	40 %	0 %	57641093
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20238	NC_006624	CCG	2	6	1019058	1019063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57641093
20239	NC_006624	TAC	2	6	1019124	1019129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57641093
20240	NC_006624	TCG	2	6	1019191	1019196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641093
20241	NC_006624	CGG	2	6	1019225	1019230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57641093
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20246	NC_006624	GAA	2	6	1019502	1019507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57641093
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20267	NC_006624	GAG	2	6	1020758	1020763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20273	NC_006624	GTA	2	6	1021042	1021047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20358	NC_006624	G	6	6	1024629	1024634	0 %	0 %	100 %	0 %	57641099
20359	NC_006624	GTA	2	6	1024644	1024649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57641099
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20462	NC_006624	ATCA	2	8	1029972	1029979	50 %	25 %	0 %	25 %	57641106
20463	NC_006624	T	7	7	1029993	1029999	0 %	100 %	0 %	0 %	57641106
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20466	NC_006624	CTG	2	6	1030060	1030065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641106
20467	NC_006624	GA	3	6	1030098	1030103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20468	NC_006624	GGA	2	6	1030138	1030143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20469	NC_006624	TCC	2	6	1030224	1030229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641107
20470	NC_006624	TCC	2	6	1030236	1030241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641107
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20473	NC_006624	CCCT	2	8	1030327	1030334	0 %	25 %	0 %	75 %	57641107
20474	NC_006624	CTC	2	6	1030443	1030448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641107
20475	NC_006624	AGA	2	6	1030466	1030471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57641107
20476	NC_006624	GTT	2	6	1030494	1030499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57641107
20477	NC_006624	GCG	2	6	1030519	1030524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57641107
20478	NC_006624	TCC	2	6	1030543	1030548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641107
20479	NC_006624	GAGT	2	8	1030728	1030735	25 %	25 %	50 %	0 %	57641107
20480	NC_006624	CCT	2	6	1030739	1030744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641107
20481	NC_006624	CTT	2	6	1030785	1030790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641107
20482	NC_006624	GTC	2	6	1030833	1030838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641107
20483	NC_006624	CTT	2	6	1030863	1030868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641107
20484	NC_006624	CTCAG	2	10	1030879	1030888	20 %	20 %	20 %	40 %	57641107
20485	NC_006624	TC	3	6	1030896	1030901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20486	NC_006624	ACC	2	6	1030902	1030907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20487	NC_006624	TAA	2	6	1030929	1030934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20488	NC_006624	TCT	2	6	1030981	1030986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641108
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20491	NC_006624	CGC	2	6	1031104	1031109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57641108
20492	NC_006624	TGA	2	6	1031116	1031121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57641108
20493	NC_006624	TAG	2	6	1031148	1031153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57641108
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20495	NC_006624	TCC	2	6	1031184	1031189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641108
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20497	NC_006624	CT	3	6	1031308	1031313	0 %	50 %	0 %	50 %	57641108
20498	NC_006624	TCCT	2	8	1031355	1031362	0 %	50 %	0 %	50 %	57641108
20499	NC_006624	TCC	2	6	1031460	1031465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641108
20500	NC_006624	CAC	2	6	1031532	1031537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57641108

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