MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006624	CTC	2	6	77268	77273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640025
1502	NC_006624	AAAACC	2	12	77279	77290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640025
1503	NC_006624	TCC	2	6	77305	77310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640025
1504	NC_006624	CAAC	2	8	77380	77387	50 %	0 %	0 %	50 %	57640025
1505	NC_006624	CCG	2	6	77407	77412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640025
1506	NC_006624	GAA	2	6	77431	77436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640025
1507	NC_006624	TAG	2	6	77449	77454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640025
1508	NC_006624	CTTTT	2	10	77460	77469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1509	NC_006624	TTA	2	6	77650	77655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_006624	CTT	2	6	77657	77662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_006624	T	6	6	77666	77671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_006624	GGTC	2	8	77717	77724	0 %	25 %	50 %	25 %	57640026
1513	NC_006624	A	6	6	77726	77731	100 %	0 %	0 %	0 %	57640026
1514	NC_006624	TAG	2	6	77761	77766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640026
1515	NC_006624	CAA	2	6	77800	77805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640026
1516	NC_006624	AC	3	6	77818	77823	50 %	0 %	0 %	50 %	57640026
1517	NC_006624	ACG	2	6	77992	77997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640026
1518	NC_006624	AGA	2	6	78023	78028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640026
1519	NC_006624	ATT	2	6	78141	78146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640026
1520	NC_006624	TTC	2	6	78204	78209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640026
1521	NC_006624	GAC	2	6	78219	78224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640026
1522	NC_006624	GA	3	6	78323	78328	50 %	0 %	50 %	0 %	57640026
1523	NC_006624	CAA	2	6	78329	78334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640026
1524	NC_006624	AAC	2	6	78369	78374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640026
1525	NC_006624	TCA	2	6	78403	78408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640026
1526	NC_006624	TATGA	2	10	78423	78432	40 %	40 %	20 %	0 %	57640026
1527	NC_006624	AAC	2	6	78444	78449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640026
1528	NC_006624	CT	3	6	78464	78469	0 %	50 %	0 %	50 %	57640026
1529	NC_006624	AGA	2	6	78476	78481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640026
1530	NC_006624	GAGAT	2	10	78499	78508	40 %	20 %	40 %	0 %	57640026
1531	NC_006624	CTC	2	6	78525	78530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640026
1532	NC_006624	CAC	2	6	78549	78554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640026
1533	NC_006624	TAT	2	6	78561	78566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640026
1534	NC_006624	TAC	2	6	78624	78629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640026
1535	NC_006624	CAG	2	6	78694	78699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640026
1536	NC_006624	GGT	2	6	78827	78832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640026
1537	NC_006624	ATC	2	6	78867	78872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640026
1538	NC_006624	CTG	2	6	78877	78882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640026
1539	NC_006624	TAG	2	6	78983	78988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640026
1540	NC_006624	CTT	2	6	78989	78994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640026
1541	NC_006624	GAA	2	6	79038	79043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640026
1542	NC_006624	CTT	2	6	79139	79144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640027
1543	NC_006624	AT	3	6	79175	79180	50 %	50 %	0 %	0 %	57640027
1544	NC_006624	GAA	2	6	79186	79191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640027
1545	NC_006624	CAT	2	6	79210	79215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640027
1546	NC_006624	TAC	2	6	79217	79222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640027
1547	NC_006624	CTC	2	6	79291	79296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640028
1548	NC_006624	ATA	2	6	79312	79317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640028
1549	NC_006624	CAC	2	6	79352	79357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640028
1550	NC_006624	CAAGG	2	10	79365	79374	40 %	0 %	40 %	20 %	57640028
1551	NC_006624	TC	4	8	79433	79440	0 %	50 %	0 %	50 %	57640028
1552	NC_006624	TTG	2	6	79448	79453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640028
1553	NC_006624	TTC	2	6	79462	79467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640028
1554	NC_006624	GTGA	2	8	79494	79501	25 %	25 %	50 %	0 %	57640028
1555	NC_006624	G	6	6	79511	79516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_006624	CTTC	2	8	79530	79537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_006624	T	6	6	79546	79551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_006624	G	6	6	79573	79578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_006624	CCTT	2	8	79609	79616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_006624	T	6	6	79684	79689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_006624	TA	3	6	79719	79724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_006624	ATA	2	6	79726	79731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_006624	CACGT	2	10	79844	79853	20 %	20 %	20 %	40 %	57640029
1564	NC_006624	CAA	2	6	79872	79877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640029
1565	NC_006624	GAT	2	6	79879	79884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640029
1566	NC_006624	GAG	2	6	80017	80022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640029
1567	NC_006624	ATT	2	6	80056	80061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640029
1568	NC_006624	GA	3	6	80112	80117	50 %	0 %	50 %	0 %	57640029
1569	NC_006624	CTT	2	6	80134	80139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_006624	ATG	2	6	80144	80149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_006624	TAAG	2	8	80152	80159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_006624	TA	3	6	80183	80188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_006624	TTG	2	6	80189	80194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_006624	GGT	2	6	80246	80251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_006624	A	6	6	80289	80294	100 %	0 %	0 %	0 %	57640030
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1579	NC_006624	GAT	2	6	80565	80570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640031
1580	NC_006624	AT	3	6	80623	80628	50 %	50 %	0 %	0 %	57640031
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1582	NC_006624	AAG	2	6	80701	80706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640031
1583	NC_006624	TGA	2	6	80717	80722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640031
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1591	NC_006624	CTT	2	6	81152	81157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640031
1592	NC_006624	GGA	2	6	81170	81175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640031
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1594	NC_006624	TGT	2	6	81308	81313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640031
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1596	NC_006624	GAG	2	6	81440	81445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640031
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1600	NC_006624	TC	3	6	81576	81581	0 %	50 %	0 %	50 %	57640031
1601	NC_006624	TGT	2	6	81605	81610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640031
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1603	NC_006624	CGA	2	6	81767	81772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640031
1604	NC_006624	CGA	2	6	81800	81805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640031
1605	NC_006624	TCA	2	6	81811	81816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640031
1606	NC_006624	CAT	2	6	81833	81838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640031
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1608	NC_006624	TGGG	2	8	81866	81873	0 %	25 %	75 %	0 %	57640031
1609	NC_006624	CT	3	6	81887	81892	0 %	50 %	0 %	50 %	57640031
1610	NC_006624	CTG	2	6	82047	82052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640031
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1614	NC_006624	TCCAC	2	10	82189	82198	20 %	20 %	0 %	60 %	57640031
1615	NC_006624	GCT	2	6	82230	82235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640031
1616	NC_006624	GATG	2	8	82244	82251	25 %	25 %	50 %	0 %	57640031
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1618	NC_006624	TGT	2	6	82424	82429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640031
1619	NC_006624	GCG	2	6	82434	82439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640031
1620	NC_006624	G	6	6	82451	82456	0 %	0 %	100 %	0 %	57640031
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1623	NC_006624	GGA	2	6	82577	82582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640031
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1625	NC_006624	GAG	2	6	82711	82716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640031
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1628	NC_006624	TGA	2	6	82871	82876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640031
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1630	NC_006624	GAA	2	6	82911	82916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640031
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1998	NC_006624	TTCTT	2	10	99591	99600	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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