MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

< Previous12...3435363738394041424344...8283Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_006624	CCG	2	6	958295	958300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57641026
19003	NC_006624	TCT	2	6	958328	958333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641026
19004	NC_006624	CCT	2	6	958373	958378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641026
19005	NC_006624	GGA	2	6	958388	958393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641026
19006	NC_006624	TCG	2	6	958399	958404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641026
19007	NC_006624	CAGC	2	8	958431	958438	25 %	0 %	25 %	50 %	57641026
19008	NC_006624	GGT	2	6	958475	958480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57641026
19009	NC_006624	ACC	2	6	958495	958500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57641026
19010	NC_006624	GGCT	2	8	958518	958525	0 %	25 %	50 %	25 %	57641026
19011	NC_006624	AT	3	6	958620	958625	50 %	50 %	0 %	0 %	57641026
19012	NC_006624	GTC	2	6	958641	958646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641026
19013	NC_006624	CTT	2	6	958647	958652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641026
19014	NC_006624	ATCG	2	8	958738	958745	25 %	25 %	25 %	25 %	57641026
19015	NC_006624	GGA	2	6	958773	958778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641026
19016	NC_006624	TTCC	2	8	959054	959061	0 %	50 %	0 %	50 %	57641026
19017	NC_006624	GTG	2	6	959088	959093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57641026
19018	NC_006624	CTTTT	2	10	959102	959111	0 %	80 %	0 %	20 %	57641026
19019	NC_006624	CTTT	2	8	959145	959152	0 %	75 %	0 %	25 %	57641026
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19021	NC_006624	TCTT	2	8	959245	959252	0 %	75 %	0 %	25 %	57641026
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19045	NC_006624	CTG	2	6	960450	960455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641026
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19054	NC_006624	CG	3	6	960708	960713	0 %	0 %	50 %	50 %	57641026
19055	NC_006624	TCG	2	6	960809	960814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641026
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19122	NC_006624	GCT	2	6	964232	964237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641031
19123	NC_006624	TTC	2	6	964248	964253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641031
19124	NC_006624	CTC	2	6	964302	964307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641031
19125	NC_006624	A	6	6	964350	964355	100 %	0 %	0 %	0 %	57641031
19126	NC_006624	AAG	2	6	964362	964367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57641031
19127	NC_006624	CTC	2	6	964371	964376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641031
19128	NC_006624	TCT	2	6	964403	964408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641031
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19130	NC_006624	GGT	2	6	964480	964485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57641031
19131	NC_006624	TGT	2	6	964589	964594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57641031
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19143	NC_006624	CTT	2	6	965328	965333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641032
19144	NC_006624	CTTC	2	8	965339	965346	0 %	50 %	0 %	50 %	57641032
19145	NC_006624	CCT	2	6	965383	965388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19146	NC_006624	AGA	2	6	965399	965404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19147	NC_006624	TAA	2	6	965408	965413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19148	NC_006624	T	6	6	965448	965453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19149	NC_006624	CT	3	6	965537	965542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19156	NC_006624	GAA	2	6	965857	965862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57641034
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19163	NC_006624	TCT	2	6	966087	966092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19164	NC_006624	GA	3	6	966095	966100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19165	NC_006624	AAGG	2	8	966125	966132	50 %	0 %	50 %	0 %	57641035
19166	NC_006624	AGGA	2	8	966148	966155	50 %	0 %	50 %	0 %	57641035
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19233	NC_006624	GA	3	6	969179	969184	50 %	0 %	50 %	0 %	57641040
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19242	NC_006624	CGC	2	6	969584	969589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57641040
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19244	NC_006624	GA	3	6	969643	969648	50 %	0 %	50 %	0 %	57641041
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19489	NC_006624	CTG	2	6	981935	981940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641053
19490	NC_006624	TAC	2	6	981974	981979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57641053
19491	NC_006624	CGT	2	6	982092	982097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57641054
19492	NC_006624	TCA	2	6	982130	982135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57641054
19493	NC_006624	ATA	2	6	982255	982260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57641054
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