MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_006624	CT	3	6	933284	933289	0 %	50 %	0 %	50 %	57640995
18503	NC_006624	GAG	2	6	933301	933306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640995
18504	NC_006624	GAG	3	9	933343	933351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640995
18505	NC_006624	T	6	6	933395	933400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_006624	AAG	2	6	933444	933449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_006624	GAG	2	6	933516	933521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_006624	CAT	2	6	933548	933553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640996
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18512	NC_006624	T	6	6	933954	933959	0 %	100 %	0 %	0 %	57640997
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18519	NC_006624	GTTT	2	8	934396	934403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18522	NC_006624	ATT	2	6	934492	934497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_006624	TCG	2	6	934612	934617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640998
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18539	NC_006624	GAA	2	6	935441	935446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18622	NC_006624	GGGT	2	8	939953	939960	0 %	25 %	75 %	0 %	57641002
18623	NC_006624	CTC	2	6	940033	940038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57641002
18624	NC_006624	GAT	2	6	940149	940154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18625	NC_006624	CGAT	2	8	940171	940178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18626	NC_006624	GAG	2	6	940179	940184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18627	NC_006624	GGT	2	6	940201	940206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18628	NC_006624	TGG	2	6	940236	940241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57641003
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18632	NC_006624	CAT	2	6	940321	940326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57641003
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18651	NC_006624	GGA	2	6	941306	941311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641006
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18666	NC_006624	TA	3	6	942129	942134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18667	NC_006624	GGA	2	6	942158	942163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18741	NC_006624	CCTGTT	2	12	945275	945286	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	57641014
18742	NC_006624	TGATC	2	10	945349	945358	20 %	40 %	20 %	20 %	57641014
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18744	NC_006624	GAG	2	6	945463	945468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57641015
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18749	NC_006624	CTT	2	6	945619	945624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57641015
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