MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

< Previous12...3031323334353637383940...8283Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_006624	GTG	2	6	858757	858762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640917
17002	NC_006624	TTA	2	6	858863	858868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640917
17003	NC_006624	GTTT	2	8	858940	858947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_006624	TCT	2	6	858948	858953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_006624	TTC	2	6	859036	859041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_006624	T	6	6	859126	859131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_006624	CAT	2	6	859138	859143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_006624	CTC	2	6	859160	859165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_006624	C	6	6	859227	859232	0 %	0 %	0 %	100 %	57640918
17010	NC_006624	CGA	2	6	859245	859250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640918
17011	NC_006624	CCT	2	6	859271	859276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640918
17012	NC_006624	GTG	2	6	859288	859293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640918
17013	NC_006624	CGA	2	6	859302	859307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640918
17014	NC_006624	GGTTT	2	10	859511	859520	0 %	60 %	40 %	0 %	57640918
17015	NC_006624	TA	3	6	859595	859600	50 %	50 %	0 %	0 %	57640918
17016	NC_006624	GAA	2	6	859659	859664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640918
17017	NC_006624	CTT	2	6	859699	859704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640918
17018	NC_006624	GAG	2	6	859722	859727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640918
17019	NC_006624	GAGC	2	8	859764	859771	25 %	0 %	50 %	25 %	57640918
17020	NC_006624	TAT	2	6	859821	859826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640918
17021	NC_006624	TA	3	6	859883	859888	50 %	50 %	0 %	0 %	57640918
17022	NC_006624	TAC	2	6	859961	859966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640918
17023	NC_006624	GGTA	2	8	860043	860050	25 %	25 %	50 %	0 %	57640918
17024	NC_006624	ACTG	2	8	860075	860082	25 %	25 %	25 %	25 %	57640918
17025	NC_006624	GGGTA	2	10	860261	860270	20 %	20 %	60 %	0 %	57640918
17026	NC_006624	A	7	7	860330	860336	100 %	0 %	0 %	0 %	57640918
17027	NC_006624	CTT	2	6	860466	860471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640919
17028	NC_006624	CGC	2	6	860510	860515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640919
17029	NC_006624	CCA	2	6	860565	860570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640919
17030	NC_006624	CGC	2	6	860582	860587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640919
17031	NC_006624	TCT	2	6	860621	860626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640919
17032	NC_006624	TCA	2	6	860771	860776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640919
17033	NC_006624	ACG	2	6	860848	860853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640919
17034	NC_006624	CTC	2	6	860868	860873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640919
17035	NC_006624	CCG	3	9	860932	860940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640919
17036	NC_006624	CTTC	2	8	861008	861015	0 %	50 %	0 %	50 %	57640919
17037	NC_006624	GTA	2	6	861030	861035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640919
17038	NC_006624	TCA	2	6	861056	861061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_006624	GAA	2	6	861106	861111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_006624	CTTC	2	8	861138	861145	0 %	50 %	0 %	50 %	57640920
17041	NC_006624	GAG	2	6	861150	861155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640920
17042	NC_006624	ACG	2	6	861163	861168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640920
17043	NC_006624	TCT	2	6	861214	861219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640920
17044	NC_006624	CT	3	6	861239	861244	0 %	50 %	0 %	50 %	57640920
17045	NC_006624	CAT	2	6	861258	861263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640920
17046	NC_006624	AGT	2	6	861269	861274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640920
17047	NC_006624	CATAC	2	10	861285	861294	40 %	20 %	0 %	40 %	57640920
17048	NC_006624	GCT	2	6	861306	861311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640920
17049	NC_006624	ATGT	2	8	861381	861388	25 %	50 %	25 %	0 %	57640920
17050	NC_006624	TG	3	6	861400	861405	0 %	50 %	50 %	0 %	57640920
17051	NC_006624	CCTT	2	8	861468	861475	0 %	50 %	0 %	50 %	57640920
17052	NC_006624	GTT	3	9	861522	861530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640920
17053	NC_006624	AGG	2	6	861649	861654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640920
17054	NC_006624	TCT	2	6	861685	861690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640920
17055	NC_006624	TCT	2	6	861730	861735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640920
17056	NC_006624	TCT	2	6	861772	861777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640920
17057	NC_006624	GAT	2	6	861858	861863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640920
17058	NC_006624	CG	3	6	861931	861936	0 %	0 %	50 %	50 %	57640920
17059	NC_006624	TCC	2	6	862036	862041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640920
17060	NC_006624	AGT	2	6	862055	862060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640920
17061	NC_006624	GAA	2	6	862124	862129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640920
17062	NC_006624	AGT	2	6	862163	862168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640920
17063	NC_006624	CTG	2	6	862403	862408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640920
17064	NC_006624	CGGCA	2	10	862473	862482	20 %	0 %	40 %	40 %	57640920
17065	NC_006624	CAAT	2	8	862502	862509	50 %	25 %	0 %	25 %	57640920
17066	NC_006624	TTC	2	6	862525	862530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640920
17067	NC_006624	ACTC	2	8	862550	862557	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17068	NC_006624	TAG	2	6	862559	862564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17069	NC_006624	CA	3	6	862662	862667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17070	NC_006624	CCAG	2	8	862789	862796	25 %	0 %	25 %	50 %	57640921
17071	NC_006624	TCC	2	6	862820	862825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640921
17072	NC_006624	GGA	2	6	862913	862918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640921
17073	NC_006624	ATT	2	6	862930	862935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640921
17074	NC_006624	CGG	2	6	862955	862960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640921
17075	NC_006624	GAC	3	9	862989	862997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640921
17076	NC_006624	GCT	2	6	863000	863005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640921
17077	NC_006624	TCG	2	6	863090	863095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640921
17078	NC_006624	AGGG	2	8	863169	863176	25 %	0 %	75 %	0 %	57640921
17079	NC_006624	TGA	2	6	863231	863236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640921
17080	NC_006624	TGA	2	6	863282	863287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640921
17081	NC_006624	GAAG	2	8	863294	863301	50 %	0 %	50 %	0 %	57640921
17082	NC_006624	TA	3	6	863309	863314	50 %	50 %	0 %	0 %	57640921
17083	NC_006624	CGA	2	6	863342	863347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640921
17084	NC_006624	CGC	2	6	863417	863422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640921
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17086	NC_006624	CTC	2	6	863496	863501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640921
17087	NC_006624	AGGT	2	8	863515	863522	25 %	25 %	50 %	0 %	57640921
17088	NC_006624	GAA	2	6	863547	863552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640921
17089	NC_006624	GCGA	2	8	863578	863585	25 %	0 %	50 %	25 %	57640921
17090	NC_006624	GAGG	3	12	863628	863639	25 %	0 %	75 %	0 %	57640921
17091	NC_006624	GAA	2	6	863721	863726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640921
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17093	NC_006624	AGG	2	6	864007	864012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640921
17094	NC_006624	TGGC	2	8	864040	864047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17095	NC_006624	A	6	6	864070	864075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_006624	TTA	2	6	864082	864087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_006624	ACT	2	6	864157	864162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640922
17098	NC_006624	CTGT	2	8	864167	864174	0 %	50 %	25 %	25 %	57640922
17099	NC_006624	CTTC	2	8	864260	864267	0 %	50 %	0 %	50 %	57640922
17100	NC_006624	CTT	2	6	864293	864298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640922
17101	NC_006624	CAA	2	6	864299	864304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640922
17102	NC_006624	AGC	2	6	864355	864360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640922
17103	NC_006624	CAT	2	6	864405	864410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640922
17104	NC_006624	CGT	2	6	864536	864541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640922
17105	NC_006624	GT	3	6	864581	864586	0 %	50 %	50 %	0 %	57640922
17106	NC_006624	GCC	2	6	864663	864668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640922
17107	NC_006624	CTTC	2	8	864693	864700	0 %	50 %	0 %	50 %	57640922
17108	NC_006624	CTT	2	6	864762	864767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640922
17109	NC_006624	TCA	2	6	864793	864798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640922
17110	NC_006624	TGA	2	6	864928	864933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640923
17111	NC_006624	GAA	2	6	864976	864981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640923
17112	NC_006624	CCG	2	6	865077	865082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640923
17113	NC_006624	ATT	2	6	865280	865285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640923
17114	NC_006624	GAC	2	6	865286	865291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640923
17115	NC_006624	TGA	2	6	865339	865344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640923
17116	NC_006624	TGG	2	6	865418	865423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640923
17117	NC_006624	TCC	2	6	865458	865463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17118	NC_006624	AGG	3	9	865518	865526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640924
17119	NC_006624	TTC	2	6	865536	865541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640924
17120	NC_006624	CCGA	2	8	865596	865603	25 %	0 %	25 %	50 %	57640924
17121	NC_006624	ATC	2	6	865638	865643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640924
17122	NC_006624	GTC	2	6	865653	865658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640924
17123	NC_006624	ATG	2	6	865680	865685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640924
17124	NC_006624	CGA	2	6	865712	865717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640924
17125	NC_006624	AGG	2	6	865777	865782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640924
17126	NC_006624	AGC	2	6	865783	865788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640924
17127	NC_006624	CAC	2	6	865870	865875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640924
17128	NC_006624	ATG	2	6	865887	865892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640924
17129	NC_006624	TGT	2	6	865940	865945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640924
17130	NC_006624	CG	3	6	865960	865965	0 %	0 %	50 %	50 %	57640924
17131	NC_006624	AAG	2	6	865992	865997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640924
17132	NC_006624	CGT	2	6	866009	866014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640924
17133	NC_006624	CGC	3	9	866108	866116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640924
17134	NC_006624	CGT	2	6	866216	866221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640924
17135	NC_006624	GAA	2	6	866224	866229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640924
17136	NC_006624	GAT	2	6	866258	866263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640924
17137	NC_006624	TTTCG	2	10	866350	866359	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17138	NC_006624	GAG	2	6	866520	866525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17139	NC_006624	ATA	2	6	866542	866547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640925
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17141	NC_006624	TCA	2	6	866568	866573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640925
17142	NC_006624	GA	3	6	866700	866705	50 %	0 %	50 %	0 %	57640925
17143	NC_006624	GA	3	6	866716	866721	50 %	0 %	50 %	0 %	57640925
17144	NC_006624	AGA	2	6	866747	866752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640925
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17147	NC_006624	GAT	2	6	866809	866814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640925
17148	NC_006624	GTC	2	6	866815	866820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640925
17149	NC_006624	TCG	2	6	866828	866833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640925
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17151	NC_006624	AAG	2	6	866924	866929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640925
17152	NC_006624	TAC	2	6	866989	866994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640925
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17154	NC_006624	TAA	2	6	867035	867040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640925
17155	NC_006624	CTG	2	6	867061	867066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640925
17156	NC_006624	CCACT	2	10	867138	867147	20 %	20 %	0 %	60 %	57640925
17157	NC_006624	AAG	2	6	867334	867339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640925
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17164	NC_006624	GCC	2	6	867528	867533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640925
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17182	NC_006624	TCTT	2	8	868373	868380	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17183	NC_006624	CTG	2	6	868491	868496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640926
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17203	NC_006624	ACT	2	6	869166	869171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640926
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17207	NC_006624	TG	3	6	869218	869223	0 %	50 %	50 %	0 %	57640926
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17212	NC_006624	TGG	2	6	869509	869514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640926
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17214	NC_006624	AGCA	2	8	869947	869954	50 %	0 %	25 %	25 %	57640926
17215	NC_006624	ATG	2	6	869960	869965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640926
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17223	NC_006624	T	7	7	870245	870251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17224	NC_006624	CGCTT	2	10	870304	870313	0 %	40 %	20 %	40 %	57640927
17225	NC_006624	TATAT	2	10	870343	870352	40 %	60 %	0 %	0 %	57640927
17226	NC_006624	GAAGAG	2	12	870369	870380	50 %	0 %	50 %	0 %	57640927
17227	NC_006624	TCC	2	6	870434	870439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640927
17228	NC_006624	TACA	2	8	870449	870456	50 %	25 %	0 %	25 %	57640927
17229	NC_006624	AGA	2	6	870499	870504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640927
17230	NC_006624	AAGA	2	8	870507	870514	75 %	0 %	25 %	0 %	57640927
17231	NC_006624	GGAT	2	8	870531	870538	25 %	25 %	50 %	0 %	57640927
17232	NC_006624	CTC	2	6	870740	870745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640928
17233	NC_006624	CA	3	6	870747	870752	50 %	0 %	0 %	50 %	57640928
17234	NC_006624	GAC	2	6	870797	870802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640928
17235	NC_006624	GGT	2	6	870842	870847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17236	NC_006624	TTC	2	6	870861	870866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640929
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17238	NC_006624	GTT	2	6	870888	870893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640929
17239	NC_006624	TTC	2	6	870894	870899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640929
17240	NC_006624	GAC	2	6	870923	870928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640929
17241	NC_006624	A	6	6	871046	871051	100 %	0 %	0 %	0 %	57640929
17242	NC_006624	CGAG	2	8	871072	871079	25 %	0 %	50 %	25 %	57640929
17243	NC_006624	TGA	2	6	871246	871251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640929
17244	NC_006624	CGA	2	6	871256	871261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640929
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17247	NC_006624	GA	3	6	871380	871385	50 %	0 %	50 %	0 %	57640929
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17303	NC_006624	CTA	2	6	874609	874614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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