MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_006624	GTC	3	9	806151	806159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640863
16003	NC_006624	CTT	2	6	806190	806195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16004	NC_006624	CCG	3	9	806245	806253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640863
16005	NC_006624	TAT	2	6	806259	806264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640863
16006	NC_006624	CCTT	2	8	806290	806297	0 %	50 %	0 %	50 %	57640863
16007	NC_006624	AGG	2	6	806299	806304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640863
16008	NC_006624	CGC	2	6	806327	806332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640863
16009	NC_006624	CTT	2	6	806399	806404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16010	NC_006624	CTT	2	6	806493	806498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16011	NC_006624	TCG	2	6	806518	806523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640863
16012	NC_006624	AGG	2	6	806570	806575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640863
16013	NC_006624	TTA	2	6	806594	806599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640863
16014	NC_006624	CCCT	2	8	806626	806633	0 %	25 %	0 %	75 %	57640863
16015	NC_006624	TCC	2	6	806695	806700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640863
16016	NC_006624	C	6	6	806699	806704	0 %	0 %	0 %	100 %	57640863
16017	NC_006624	GA	3	6	806728	806733	50 %	0 %	50 %	0 %	57640863
16018	NC_006624	GCT	2	6	806785	806790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640863
16019	NC_006624	TC	3	6	806830	806835	0 %	50 %	0 %	50 %	57640863
16020	NC_006624	AGG	2	6	806860	806865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640863
16021	NC_006624	TTG	2	6	806905	806910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640863
16022	NC_006624	GAC	2	6	806988	806993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640863
16023	NC_006624	CTT	2	6	807096	807101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16024	NC_006624	TTC	2	6	807223	807228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16025	NC_006624	TCT	2	6	807257	807262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16026	NC_006624	CTT	2	6	807309	807314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640863
16027	NC_006624	AAAG	2	8	807537	807544	75 %	0 %	25 %	0 %	57640864
16028	NC_006624	CCT	2	6	807564	807569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640864
16029	NC_006624	CGA	2	6	807764	807769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640864
16030	NC_006624	AAG	2	6	807784	807789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640864
16031	NC_006624	TAC	2	6	807805	807810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640864
16032	NC_006624	CGG	2	6	807819	807824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640864
16033	NC_006624	GAT	2	6	807894	807899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640864
16034	NC_006624	CCG	2	6	807917	807922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640864
16035	NC_006624	CTT	2	6	808024	808029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640864
16036	NC_006624	TGAG	2	8	808088	808095	25 %	25 %	50 %	0 %	57640864
16037	NC_006624	TCG	2	6	808193	808198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640864
16038	NC_006624	AGG	2	6	808243	808248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640864
16039	NC_006624	GAT	2	6	808285	808290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640864
16040	NC_006624	CGG	2	6	808314	808319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640864
16041	NC_006624	CGT	2	6	808443	808448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640864
16042	NC_006624	ACG	2	6	808466	808471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640864
16043	NC_006624	ACG	2	6	808559	808564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640864
16044	NC_006624	CGA	2	6	808697	808702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640864
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16047	NC_006624	GAG	2	6	808813	808818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640865
16048	NC_006624	TCT	2	6	808829	808834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640865
16049	NC_006624	CCT	2	6	808839	808844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640865
16050	NC_006624	AGT	2	6	808848	808853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640865
16051	NC_006624	TGA	2	6	808914	808919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640865
16052	NC_006624	TTC	2	6	808963	808968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640865
16053	NC_006624	TCC	2	6	809018	809023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640865
16054	NC_006624	TTG	2	6	809054	809059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640865
16055	NC_006624	AGG	2	6	809105	809110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640865
16056	NC_006624	CTTT	2	8	809360	809367	0 %	75 %	0 %	25 %	57640865
16057	NC_006624	CT	3	6	809383	809388	0 %	50 %	0 %	50 %	57640865
16058	NC_006624	CGT	2	6	809475	809480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640865
16059	NC_006624	AGCCG	2	10	809481	809490	20 %	0 %	40 %	40 %	57640865
16060	NC_006624	CTTC	2	8	809514	809521	0 %	50 %	0 %	50 %	57640865
16061	NC_006624	CGG	2	6	809529	809534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640865
16062	NC_006624	ACC	2	6	809581	809586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16063	NC_006624	CGGG	2	8	809655	809662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16064	NC_006624	TGA	2	6	809694	809699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640866
16065	NC_006624	GTC	2	6	809753	809758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640866
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16090	NC_006624	TGGTCT	2	12	811071	811082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	57640867
16091	NC_006624	TAT	2	6	811151	811156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640867
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16093	NC_006624	CCCT	2	8	811315	811322	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16094	NC_006624	TGAG	2	8	811393	811400	25 %	25 %	50 %	0 %	57640868
16095	NC_006624	CTTG	2	8	811409	811416	0 %	50 %	25 %	25 %	57640868
16096	NC_006624	CGA	2	6	811502	811507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640868
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16100	NC_006624	TAGCGA	2	12	811712	811723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57640869
16101	NC_006624	GCAT	2	8	811727	811734	25 %	25 %	25 %	25 %	57640869
16102	NC_006624	AG	3	6	811747	811752	50 %	0 %	50 %	0 %	57640869
16103	NC_006624	GGA	2	6	811806	811811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640869
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16108	NC_006624	CCA	2	6	812042	812047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640869
16109	NC_006624	ATTG	2	8	812104	812111	25 %	50 %	25 %	0 %	57640869
16110	NC_006624	GAT	2	6	812148	812153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640869
16111	NC_006624	GTT	2	6	812185	812190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640869
16112	NC_006624	GTC	2	6	812209	812214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640869
16113	NC_006624	CT	3	6	812290	812295	0 %	50 %	0 %	50 %	57640869
16114	NC_006624	AGA	2	6	812321	812326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640869
16115	NC_006624	ATA	2	6	812332	812337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640869
16116	NC_006624	TGAT	2	8	812346	812353	25 %	50 %	25 %	0 %	57640869
16117	NC_006624	CCCTA	2	10	812360	812369	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16118	NC_006624	CTT	2	6	812414	812419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_006624	CTC	2	6	812439	812444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_006624	T	6	6	812453	812458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_006624	A	6	6	812507	812512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_006624	GAA	2	6	812515	812520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_006624	TA	3	6	812571	812576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_006624	GAA	2	6	812650	812655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640870
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16245	NC_006624	GAT	2	6	819076	819081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640876
16246	NC_006624	GAT	2	6	819115	819120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640876
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16251	NC_006624	TGA	2	6	819477	819482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640877
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16260	NC_006624	TCA	2	6	820125	820130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640877
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16262	NC_006624	GGA	2	6	820144	820149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640877
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16264	NC_006624	GA	4	8	820277	820284	50 %	0 %	50 %	0 %	57640877
16265	NC_006624	AGA	2	6	820291	820296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640877
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16273	NC_006624	CG	3	6	820596	820601	0 %	0 %	50 %	50 %	57640878
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16353	NC_006624	TA	3	6	824949	824954	50 %	50 %	0 %	0 %	57640882
16354	NC_006624	CGC	2	6	824961	824966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640882
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16359	NC_006624	CT	3	6	825064	825069	0 %	50 %	0 %	50 %	57640882
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16362	NC_006624	GCCG	2	8	825288	825295	0 %	0 %	50 %	50 %	57640883
16363	NC_006624	CCT	2	6	825335	825340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640883
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16366	NC_006624	CT	3	6	825384	825389	0 %	50 %	0 %	50 %	57640883
16367	NC_006624	CTT	2	6	825416	825421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640883
16368	NC_006624	CCA	2	6	825512	825517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640883
16369	NC_006624	TCT	2	6	825531	825536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640883
16370	NC_006624	CAA	2	6	825557	825562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640883
16371	NC_006624	TCT	2	6	825626	825631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640883
16372	NC_006624	CTC	2	6	825681	825686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640883
16373	NC_006624	CGC	2	6	825770	825775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640883
16374	NC_006624	TAT	2	6	825780	825785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640883
16375	NC_006624	GTC	2	6	825807	825812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640883
16376	NC_006624	GGGCT	2	10	825835	825844	0 %	20 %	60 %	20 %	57640883
16377	NC_006624	TGGG	2	8	825909	825916	0 %	25 %	75 %	0 %	57640883
16378	NC_006624	GCC	2	6	825945	825950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640883
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16380	NC_006624	GAG	2	6	826023	826028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640883
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16382	NC_006624	TCC	2	6	826133	826138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640883
16383	NC_006624	TCGG	2	8	826186	826193	0 %	25 %	50 %	25 %	57640883
16384	NC_006624	TCT	3	9	826241	826249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640883
16385	NC_006624	TCC	2	6	826414	826419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640884
16386	NC_006624	TCA	2	6	826525	826530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640884
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16392	NC_006624	TCC	2	6	826884	826889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640884
16393	NC_006624	GGT	2	6	826970	826975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640884
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16395	NC_006624	TCT	2	6	827099	827104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640884
16396	NC_006624	GC	3	6	827114	827119	0 %	0 %	50 %	50 %	57640884
16397	NC_006624	AGG	2	6	827126	827131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640884
16398	NC_006624	CT	3	6	827172	827177	0 %	50 %	0 %	50 %	57640884
16399	NC_006624	CGAAGG	2	12	827207	827218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	57640884
16400	NC_006624	CGG	2	6	827241	827246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640884
16401	NC_006624	GGA	2	6	827415	827420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16402	NC_006624	CT	3	6	827481	827486	0 %	50 %	0 %	50 %	57640885
16403	NC_006624	TCT	2	6	827513	827518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640885
16404	NC_006624	CTG	2	6	827536	827541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640885
16405	NC_006624	TCCA	2	8	827631	827638	25 %	25 %	0 %	50 %	57640885
16406	NC_006624	CAC	2	6	827676	827681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640885
16407	NC_006624	CTTC	2	8	827704	827711	0 %	50 %	0 %	50 %	57640885
16408	NC_006624	GTC	2	6	827736	827741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640885
16409	NC_006624	TC	3	6	827796	827801	0 %	50 %	0 %	50 %	57640885
16410	NC_006624	GAG	2	6	827850	827855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640885
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16412	NC_006624	GAA	2	6	827872	827877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640885
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16423	NC_006624	TTC	2	6	828519	828524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640885
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16425	NC_006624	TC	3	6	828604	828609	0 %	50 %	0 %	50 %	57640885
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16428	NC_006624	TGA	2	6	828836	828841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640885
16429	NC_006624	C	7	7	828858	828864	0 %	0 %	0 %	100 %	57640885
16430	NC_006624	AGA	2	6	828915	828920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16431	NC_006624	CTGG	2	8	828956	828963	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16432	NC_006624	TTC	2	6	828965	828970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16433	NC_006624	AAC	2	6	828977	828982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16434	NC_006624	CGC	2	6	828997	829002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640886
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16443	NC_006624	GTC	2	6	829686	829691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640886
16444	NC_006624	ATC	2	6	829725	829730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640886
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16452	NC_006624	CGT	2	6	830301	830306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640887
16453	NC_006624	GGT	3	9	830404	830412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640887
16454	NC_006624	TGTTTT	2	12	830478	830489	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16455	NC_006624	AAGGTC	2	12	830636	830647	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57640888
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16470	NC_006624	TCG	2	6	831123	831128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640888
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16477	NC_006624	CGA	2	6	831553	831558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640888
16478	NC_006624	AT	3	6	831584	831589	50 %	50 %	0 %	0 %	57640888
16479	NC_006624	CCACG	2	10	831631	831640	20 %	0 %	20 %	60 %	57640888
16480	NC_006624	TCA	2	6	831720	831725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640888
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16482	NC_006624	GCCAG	2	10	831803	831812	20 %	0 %	40 %	40 %	57640888
16483	NC_006624	GAG	2	6	831872	831877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640888
16484	NC_006624	CGT	2	6	831883	831888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640888
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16486	NC_006624	GAG	2	6	831902	831907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640888
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16488	NC_006624	AAG	2	6	831956	831961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640888
16489	NC_006624	CGA	2	6	832024	832029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640888
16490	NC_006624	AAG	2	6	832055	832060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640888
16491	NC_006624	GAA	2	6	832130	832135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640888
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16499	NC_006624	GAG	3	9	832496	832504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640889
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