MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_006624	GCC	2	6	781954	781959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640830
15502	NC_006624	GTC	2	6	781960	781965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15503	NC_006624	ACC	2	6	781975	781980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640830
15504	NC_006624	CGA	3	9	781995	782003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15505	NC_006624	ATC	2	6	782005	782010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640830
15506	NC_006624	TCG	2	6	782048	782053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15507	NC_006624	CAA	2	6	782067	782072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640830
15508	NC_006624	CCG	2	6	782078	782083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640830
15509	NC_006624	ACC	2	6	782110	782115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640830
15510	NC_006624	GAG	2	6	782119	782124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640830
15511	NC_006624	GCT	2	6	782128	782133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15512	NC_006624	GTC	2	6	782155	782160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15513	NC_006624	CGG	2	6	782187	782192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640830
15514	NC_006624	CGT	2	6	782199	782204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15515	NC_006624	TCG	2	6	782207	782212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640830
15516	NC_006624	GCC	2	6	782242	782247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640830
15517	NC_006624	TCT	3	9	782291	782299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_006624	TTAG	2	8	782307	782314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_006624	AGG	2	6	782322	782327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_006624	TTG	2	6	782328	782333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_006624	AGA	2	6	782342	782347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640831
15522	NC_006624	TGC	2	6	782353	782358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640831
15523	NC_006624	TGC	2	6	782380	782385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640831
15524	NC_006624	GGATAT	2	12	782402	782413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640831
15525	NC_006624	TC	3	6	782497	782502	0 %	50 %	0 %	50 %	57640831
15526	NC_006624	ACGTAA	2	12	782616	782627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57640831
15527	NC_006624	ATC	2	6	782660	782665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640831
15528	NC_006624	GAA	2	6	782702	782707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640831
15529	NC_006624	GA	3	6	782726	782731	50 %	0 %	50 %	0 %	57640831
15530	NC_006624	TAC	3	9	782783	782791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640831
15531	NC_006624	AGG	2	6	782805	782810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640831
15532	NC_006624	TTC	2	6	782885	782890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640831
15533	NC_006624	GA	3	6	782995	783000	50 %	0 %	50 %	0 %	57640831
15534	NC_006624	GAA	2	6	783159	783164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640832
15535	NC_006624	TCT	2	6	783212	783217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640832
15536	NC_006624	CT	3	6	783253	783258	0 %	50 %	0 %	50 %	57640832
15537	NC_006624	CGT	2	6	783323	783328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15538	NC_006624	TTG	2	6	783334	783339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640832
15539	NC_006624	ACA	2	6	783457	783462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640832
15540	NC_006624	TAGG	2	8	783473	783480	25 %	25 %	50 %	0 %	57640832
15541	NC_006624	CTT	2	6	783522	783527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640832
15542	NC_006624	ACT	2	6	783583	783588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640832
15543	NC_006624	CAT	2	6	783623	783628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640832
15544	NC_006624	TC	3	6	783677	783682	0 %	50 %	0 %	50 %	57640832
15545	NC_006624	GAA	2	6	783713	783718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640832
15546	NC_006624	CTT	2	6	783742	783747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640832
15547	NC_006624	GTT	2	6	783807	783812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640832
15548	NC_006624	CAG	2	6	783932	783937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15549	NC_006624	CTGC	2	8	784074	784081	0 %	25 %	25 %	50 %	57640832
15550	NC_006624	ACG	2	6	784132	784137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15551	NC_006624	TTTCAA	2	12	784235	784246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57640832
15552	NC_006624	GAC	2	6	784281	784286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15553	NC_006624	GAAGC	2	10	784332	784341	40 %	0 %	40 %	20 %	57640832
15554	NC_006624	AGT	2	6	784367	784372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640832
15555	NC_006624	CTG	2	6	784441	784446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15556	NC_006624	C	6	6	784459	784464	0 %	0 %	0 %	100 %	57640832
15557	NC_006624	CCG	2	6	784492	784497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640832
15558	NC_006624	TC	3	6	784505	784510	0 %	50 %	0 %	50 %	57640832
15559	NC_006624	TGAG	2	8	784519	784526	25 %	25 %	50 %	0 %	57640832
15560	NC_006624	CCT	2	6	784538	784543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640832
15561	NC_006624	CCG	2	6	784591	784596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640832
15562	NC_006624	ATG	2	6	784606	784611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640832
15563	NC_006624	C	7	7	784674	784680	0 %	0 %	0 %	100 %	57640832
15564	NC_006624	GTC	2	6	784704	784709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15565	NC_006624	CTT	2	6	784746	784751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640832
15566	NC_006624	TA	3	6	784777	784782	50 %	50 %	0 %	0 %	57640832
15567	NC_006624	AGG	2	6	784791	784796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640832
15568	NC_006624	TCG	2	6	784816	784821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640832
15569	NC_006624	GA	3	6	784863	784868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_006624	A	6	6	784875	784880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_006624	GCGA	2	8	784915	784922	25 %	0 %	50 %	25 %	57640833
15572	NC_006624	GAA	2	6	784937	784942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640833
15573	NC_006624	TC	4	8	785031	785038	0 %	50 %	0 %	50 %	57640833
15574	NC_006624	AAG	2	6	785050	785055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640833
15575	NC_006624	ATG	2	6	785068	785073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640833
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15578	NC_006624	CTT	2	6	785265	785270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640833
15579	NC_006624	AGG	2	6	785373	785378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640833
15580	NC_006624	CTTC	2	8	785421	785428	0 %	50 %	0 %	50 %	57640834
15581	NC_006624	CTC	2	6	785437	785442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640834
15582	NC_006624	TC	3	6	785482	785487	0 %	50 %	0 %	50 %	57640834
15583	NC_006624	CTT	2	6	785588	785593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640834
15584	NC_006624	AG	3	6	785604	785609	50 %	0 %	50 %	0 %	57640834
15585	NC_006624	TCCTC	2	10	785637	785646	0 %	40 %	0 %	60 %	57640834
15586	NC_006624	CAG	2	6	785673	785678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640834
15587	NC_006624	TC	3	6	785803	785808	0 %	50 %	0 %	50 %	57640834
15588	NC_006624	GGA	2	6	785878	785883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640834
15589	NC_006624	TTG	2	6	785912	785917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640834
15590	NC_006624	TAT	2	6	785953	785958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640834
15591	NC_006624	TC	3	6	786102	786107	0 %	50 %	0 %	50 %	57640834
15592	NC_006624	TAT	2	6	786136	786141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640834
15593	NC_006624	AAT	2	6	786202	786207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640834
15594	NC_006624	TC	3	6	786221	786226	0 %	50 %	0 %	50 %	57640834
15595	NC_006624	CCT	2	6	786240	786245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640835
15596	NC_006624	TCA	2	6	786286	786291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640835
15597	NC_006624	CT	4	8	786372	786379	0 %	50 %	0 %	50 %	57640835
15598	NC_006624	CCTCT	2	10	786381	786390	0 %	40 %	0 %	60 %	57640835
15599	NC_006624	CAGG	2	8	786422	786429	25 %	0 %	50 %	25 %	57640835
15600	NC_006624	CGG	2	6	786459	786464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640835
15601	NC_006624	CT	3	6	786490	786495	0 %	50 %	0 %	50 %	57640835
15602	NC_006624	GTT	2	6	786498	786503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640835
15603	NC_006624	CAA	2	6	786518	786523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640835
15604	NC_006624	CAATGT	2	12	786728	786739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57640835
15605	NC_006624	TC	3	6	786848	786853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15606	NC_006624	GAAAA	2	10	786898	786907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_006624	CCT	2	6	786960	786965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640836
15608	NC_006624	CTC	2	6	786982	786987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640836
15609	NC_006624	CTC	2	6	787177	787182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640836
15610	NC_006624	TC	3	6	787213	787218	0 %	50 %	0 %	50 %	57640836
15611	NC_006624	GAG	2	6	787219	787224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640836
15612	NC_006624	CTC	2	6	787255	787260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640836
15613	NC_006624	CTT	2	6	787264	787269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640836
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15616	NC_006624	CGA	2	6	787382	787387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640837
15617	NC_006624	TCGGG	2	10	787412	787421	0 %	20 %	60 %	20 %	57640837
15618	NC_006624	GCTCG	2	10	787437	787446	0 %	20 %	40 %	40 %	57640837
15619	NC_006624	GGA	2	6	787484	787489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640837
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15621	NC_006624	TCC	2	6	787550	787555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640837
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15623	NC_006624	AACCC	2	10	787693	787702	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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15982	NC_006624	TCAT	2	8	805174	805181	25 %	50 %	0 %	25 %	57640861
15983	NC_006624	ACG	2	6	805291	805296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640862
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15985	NC_006624	GA	3	6	805348	805353	50 %	0 %	50 %	0 %	57640862
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15987	NC_006624	A	7	7	805396	805402	100 %	0 %	0 %	0 %	57640862
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15989	NC_006624	CGCC	2	8	805490	805497	0 %	0 %	25 %	75 %	57640862
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