MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_006624	TTC	2	6	702819	702824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640739
14003	NC_006624	CTG	2	6	702828	702833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640739
14004	NC_006624	CTC	2	6	702834	702839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640739
14005	NC_006624	AGT	2	6	702986	702991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640739
14006	NC_006624	TCCT	2	8	702997	703004	0 %	50 %	0 %	50 %	57640739
14007	NC_006624	AGG	2	6	703176	703181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640739
14008	NC_006624	GCG	2	6	703249	703254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640740
14009	NC_006624	TGG	2	6	703259	703264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640740
14010	NC_006624	GAA	2	6	703288	703293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640740
14011	NC_006624	A	6	6	703312	703317	100 %	0 %	0 %	0 %	57640740
14012	NC_006624	GAT	2	6	703369	703374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640740
14013	NC_006624	AGGG	2	8	703414	703421	25 %	0 %	75 %	0 %	57640740
14014	NC_006624	GA	3	6	703533	703538	50 %	0 %	50 %	0 %	57640740
14015	NC_006624	CGA	2	6	703590	703595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640740
14016	NC_006624	CGT	2	6	703605	703610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640740
14017	NC_006624	GCT	2	6	703615	703620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640740
14018	NC_006624	AGA	2	6	703668	703673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640740
14019	NC_006624	TAT	2	6	703735	703740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640740
14020	NC_006624	CCG	2	6	703759	703764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640740
14021	NC_006624	GAA	2	6	703791	703796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640740
14022	NC_006624	GAA	2	6	703831	703836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640740
14023	NC_006624	AGGC	2	8	703837	703844	25 %	0 %	50 %	25 %	57640740
14024	NC_006624	TTA	2	6	703954	703959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640741
14025	NC_006624	GCC	2	6	703989	703994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640741
14026	NC_006624	AAG	2	6	704088	704093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640741
14027	NC_006624	GGAACG	2	12	704206	704217	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	57640741
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14030	NC_006624	GAA	2	6	704552	704557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640741
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14032	NC_006624	CGA	2	6	704617	704622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640741
14033	NC_006624	AAC	2	6	704678	704683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640741
14034	NC_006624	TAT	2	6	704708	704713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640741
14035	NC_006624	GAG	2	6	704747	704752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640741
14036	NC_006624	ATG	2	6	704769	704774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640741
14037	NC_006624	ATA	2	6	704927	704932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640741
14038	NC_006624	T	6	6	705009	705014	0 %	100 %	0 %	0 %	57640741
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14041	NC_006624	CAA	2	6	705211	705216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_006624	CAA	2	6	705220	705225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_006624	ATT	2	6	705237	705242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_006624	T	6	6	705241	705246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_006624	CT	4	8	705296	705303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14046	NC_006624	GAG	2	6	705334	705339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640742
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14050	NC_006624	CCAC	2	8	705512	705519	25 %	0 %	0 %	75 %	57640742
14051	NC_006624	GTC	2	6	705523	705528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640742
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14054	NC_006624	GA	3	6	705754	705759	50 %	0 %	50 %	0 %	57640742
14055	NC_006624	GTA	2	6	705772	705777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640742
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14057	NC_006624	GA	4	8	705811	705818	50 %	0 %	50 %	0 %	57640742
14058	NC_006624	AGA	2	6	705869	705874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640742
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14062	NC_006624	CCCTT	2	10	706056	706065	0 %	40 %	0 %	60 %	57640742
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14070	NC_006624	GAG	2	6	706390	706395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640742
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14077	NC_006624	TCG	2	6	706637	706642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640743
14078	NC_006624	T	6	6	706694	706699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_006624	CTCTC	2	10	706715	706724	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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14092	NC_006624	CGT	2	6	707417	707422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640744
14093	NC_006624	GTC	2	6	707445	707450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640744
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14095	NC_006624	ATC	2	6	707580	707585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640744
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14103	NC_006624	CT	3	6	707902	707907	0 %	50 %	0 %	50 %	57640744
14104	NC_006624	ACGC	2	8	707910	707917	25 %	0 %	25 %	50 %	57640744
14105	NC_006624	GCGA	2	8	708015	708022	25 %	0 %	50 %	25 %	57640744
14106	NC_006624	ACG	2	6	708091	708096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640744
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14109	NC_006624	GAG	2	6	708342	708347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640744
14110	NC_006624	G	6	6	708358	708363	0 %	0 %	100 %	0 %	57640744
14111	NC_006624	TGA	2	6	708437	708442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640744
14112	NC_006624	GTT	2	6	708465	708470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640744
14113	NC_006624	GGT	2	6	708564	708569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_006624	A	6	6	708601	708606	100 %	0 %	0 %	0 %	57640745
14115	NC_006624	GGGA	2	8	708617	708624	25 %	0 %	75 %	0 %	57640745
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14123	NC_006624	CAA	2	6	709077	709082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640745
14124	NC_006624	TTC	2	6	709108	709113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640745
14125	NC_006624	CTC	2	6	709135	709140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640745
14126	NC_006624	CGA	2	6	709146	709151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640745
14127	NC_006624	CTGGAA	2	12	709158	709169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57640745
14128	NC_006624	TTC	2	6	709288	709293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640745
14129	NC_006624	ATA	2	6	709663	709668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640745
14130	NC_006624	G	6	6	709766	709771	0 %	0 %	100 %	0 %	57640745
14131	NC_006624	GCAG	2	8	709848	709855	25 %	0 %	50 %	25 %	57640745
14132	NC_006624	GGC	2	6	709896	709901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640745
14133	NC_006624	TA	3	6	709967	709972	50 %	50 %	0 %	0 %	57640745
14134	NC_006624	GCTA	2	8	710017	710024	25 %	25 %	25 %	25 %	57640745
14135	NC_006624	ATG	2	6	710030	710035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640745
14136	NC_006624	TAAC	2	8	710066	710073	50 %	25 %	0 %	25 %	57640745
14137	NC_006624	ACA	2	6	710132	710137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640745
14138	NC_006624	TGG	2	6	710164	710169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640745
14139	NC_006624	GAG	2	6	710185	710190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640745
14140	NC_006624	CTG	2	6	710197	710202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640745
14141	NC_006624	TGG	2	6	710226	710231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640745
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14147	NC_006624	ACCC	2	8	710563	710570	25 %	0 %	0 %	75 %	57640745
14148	NC_006624	AT	3	6	710584	710589	50 %	50 %	0 %	0 %	57640745
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14154	NC_006624	CAGG	2	8	711030	711037	25 %	0 %	50 %	25 %	57640745
14155	NC_006624	GAA	2	6	711045	711050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640745
14156	NC_006624	ACC	2	6	711062	711067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640745
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14162	NC_006624	AT	3	6	711465	711470	50 %	50 %	0 %	0 %	57640745
14163	NC_006624	GTG	2	6	711505	711510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640745
14164	NC_006624	T	6	6	711610	711615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14165	NC_006624	GA	3	6	712207	712212	50 %	0 %	50 %	0 %	57640746
14166	NC_006624	GGGAA	2	10	712219	712228	40 %	0 %	60 %	0 %	57640746
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14196	NC_006624	T	6	6	713643	713648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14197	NC_006624	A	6	6	713684	713689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14232	NC_006624	AAGAAA	2	12	715518	715529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_006624	A	9	9	715527	715535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_006624	CTT	2	6	715556	715561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640751
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14246	NC_006624	CGA	2	6	715909	715914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640751
14247	NC_006624	CTC	2	6	715958	715963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640751
14248	NC_006624	TGGG	2	8	715980	715987	0 %	25 %	75 %	0 %	57640751
14249	NC_006624	AGTC	2	8	716030	716037	25 %	25 %	25 %	25 %	57640751
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14252	NC_006624	CGTTGA	2	12	716224	716235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57640751
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14257	NC_006624	CGT	2	6	716487	716492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640752
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14370	NC_006624	GAA	2	6	721969	721974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640759
14371	NC_006624	GAGG	2	8	721993	722000	25 %	0 %	75 %	0 %	57640759
14372	NC_006624	AGG	2	6	722013	722018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640759
14373	NC_006624	GCT	2	6	722119	722124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640759
14374	NC_006624	GCGA	2	8	722180	722187	25 %	0 %	50 %	25 %	57640759
14375	NC_006624	AAG	2	6	722233	722238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640759
14376	NC_006624	ACT	2	6	722274	722279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640759
14377	NC_006624	TGA	2	6	722286	722291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640759
14378	NC_006624	GTA	2	6	722328	722333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14379	NC_006624	CTT	3	9	722360	722368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640760
14380	NC_006624	CTT	2	6	722372	722377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640760
14381	NC_006624	CCT	2	6	722392	722397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640760
14382	NC_006624	CAG	2	6	722428	722433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640760
14383	NC_006624	CTT	2	6	722452	722457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640760
14384	NC_006624	TCT	2	6	722488	722493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640760
14385	NC_006624	CCT	2	6	722497	722502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14386	NC_006624	AGG	2	6	722657	722662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640761
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14388	NC_006624	ATA	2	6	722752	722757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640761
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14393	NC_006624	CTC	2	6	722980	722985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640761
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14396	NC_006624	AACTTC	2	12	723109	723120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640761
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14398	NC_006624	AAG	2	6	723171	723176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640762
14399	NC_006624	CCA	2	6	723196	723201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640762
14400	NC_006624	CCG	2	6	723258	723263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640762
14401	NC_006624	CCT	2	6	723302	723307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640762
14402	NC_006624	CGG	3	9	723313	723321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640762
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14406	NC_006624	GCC	2	6	723417	723422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640762
14407	NC_006624	GAAG	2	8	723424	723431	50 %	0 %	50 %	0 %	57640762
14408	NC_006624	CGA	2	6	723469	723474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640762
14409	NC_006624	TCT	2	6	723508	723513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640762
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14422	NC_006624	T	6	6	724444	724449	0 %	100 %	0 %	0 %	57640763
14423	NC_006624	GAA	2	6	724522	724527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640763
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14459	NC_006624	ATA	2	6	726390	726395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14460	NC_006624	TATG	2	8	726442	726449	25 %	50 %	25 %	0 %	57640765
14461	NC_006624	ATA	2	6	726460	726465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640765
14462	NC_006624	AGGA	2	8	726649	726656	50 %	0 %	50 %	0 %	57640765
14463	NC_006624	GAAG	2	8	726745	726752	50 %	0 %	50 %	0 %	57640766
14464	NC_006624	TGG	2	6	726774	726779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640766
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14466	NC_006624	A	7	7	726848	726854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14475	NC_006624	CCTC	2	8	727249	727256	0 %	25 %	0 %	75 %	57640767
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14483	NC_006624	ATT	2	6	727634	727639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640767
14484	NC_006624	GT	3	6	727821	727826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14485	NC_006624	ATA	2	6	727829	727834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14486	NC_006624	CTA	2	6	727840	727845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14487	NC_006624	CAT	2	6	727977	727982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640768
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14489	NC_006624	TGC	2	6	728040	728045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640768
14490	NC_006624	AG	3	6	728059	728064	50 %	0 %	50 %	0 %	57640768
14491	NC_006624	AGC	2	6	728094	728099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640768
14492	NC_006624	ATC	2	6	728155	728160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640768
14493	NC_006624	A	6	6	728193	728198	100 %	0 %	0 %	0 %	57640768
14494	NC_006624	AGAGG	2	10	728325	728334	40 %	0 %	60 %	0 %	57640768
14495	NC_006624	AGG	2	6	728360	728365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640768
14496	NC_006624	GCG	2	6	728371	728376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640768
14497	NC_006624	GCCAC	2	10	728411	728420	20 %	0 %	20 %	60 %	57640768
14498	NC_006624	CGAA	2	8	728434	728441	50 %	0 %	25 %	25 %	57640768
14499	NC_006624	TTG	2	6	728504	728509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640768
14500	NC_006624	CAG	2	6	728526	728531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640768

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