MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006624	CG	3	6	652540	652545	0 %	0 %	50 %	50 %	57640693
13002	NC_006624	GAG	2	6	652605	652610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640693
13003	NC_006624	GA	3	6	652618	652623	50 %	0 %	50 %	0 %	57640693
13004	NC_006624	GAA	2	6	652709	652714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640693
13005	NC_006624	TCG	2	6	652730	652735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640693
13006	NC_006624	TTC	2	6	652806	652811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640693
13007	NC_006624	GCTT	2	8	652864	652871	0 %	50 %	25 %	25 %	57640693
13008	NC_006624	T	6	6	652902	652907	0 %	100 %	0 %	0 %	57640693
13009	NC_006624	CTTC	2	8	652910	652917	0 %	50 %	0 %	50 %	57640693
13010	NC_006624	TCC	2	6	652966	652971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640693
13011	NC_006624	GACT	2	8	653003	653010	25 %	25 %	25 %	25 %	57640693
13012	NC_006624	GAA	2	6	653073	653078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640693
13013	NC_006624	CTC	2	6	653088	653093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640693
13014	NC_006624	TCT	2	6	653159	653164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640693
13015	NC_006624	TCG	2	6	653182	653187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640693
13016	NC_006624	GAA	2	6	653190	653195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640693
13017	NC_006624	TCA	2	6	653225	653230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640693
13018	NC_006624	TCGCCA	2	12	653357	653368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	57640693
13019	NC_006624	GT	3	6	653374	653379	0 %	50 %	50 %	0 %	57640693
13020	NC_006624	GAA	2	6	653403	653408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640693
13021	NC_006624	CCG	2	6	653416	653421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640693
13022	NC_006624	CGG	2	6	653456	653461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640693
13023	NC_006624	GAA	2	6	653510	653515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640693
13024	NC_006624	GA	3	6	653641	653646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_006624	TTAG	2	8	653742	653749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_006624	GGT	2	6	653780	653785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_006624	GGAAG	2	10	653832	653841	40 %	0 %	60 %	0 %	57640694
13028	NC_006624	GAAA	2	8	653885	653892	75 %	0 %	25 %	0 %	57640694
13029	NC_006624	TCC	2	6	653903	653908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640694
13030	NC_006624	GTC	2	6	653932	653937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640694
13031	NC_006624	AG	3	6	653968	653973	50 %	0 %	50 %	0 %	57640694
13032	NC_006624	ATC	2	6	654004	654009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640694
13033	NC_006624	CG	3	6	654034	654039	0 %	0 %	50 %	50 %	57640694
13034	NC_006624	GA	3	6	654062	654067	50 %	0 %	50 %	0 %	57640694
13035	NC_006624	CTT	2	6	654093	654098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640694
13036	NC_006624	GCGA	2	8	654115	654122	25 %	0 %	50 %	25 %	57640694
13037	NC_006624	TCC	2	6	654128	654133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640694
13038	NC_006624	GGC	2	6	654207	654212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640694
13039	NC_006624	CTC	2	6	654223	654228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640694
13040	NC_006624	CCG	2	6	654253	654258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640694
13041	NC_006624	GGC	2	6	654360	654365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640694
13042	NC_006624	GAG	2	6	654429	654434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640694
13043	NC_006624	TGGA	2	8	654475	654482	25 %	25 %	50 %	0 %	57640694
13044	NC_006624	CAT	2	6	654492	654497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640694
13045	NC_006624	GAA	2	6	654552	654557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640694
13046	NC_006624	ACG	2	6	654632	654637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640694
13047	NC_006624	CGA	2	6	654699	654704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640694
13048	NC_006624	GAG	2	6	654721	654726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640694
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13050	NC_006624	GAAG	2	8	654783	654790	50 %	0 %	50 %	0 %	57640694
13051	NC_006624	CGG	2	6	654858	654863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640694
13052	NC_006624	GAC	2	6	654877	654882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640694
13053	NC_006624	TCGGCC	2	12	654986	654997	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	57640694
13054	NC_006624	TCG	2	6	655007	655012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640694
13055	NC_006624	A	7	7	655173	655179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_006624	TTCGAG	2	12	655203	655214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13057	NC_006624	TAA	2	6	655222	655227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_006624	GAA	2	6	655252	655257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_006624	GTTTT	2	10	655264	655273	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_006624	T	6	6	655371	655376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_006624	GGA	2	6	655425	655430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_006624	G	6	6	655435	655440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_006624	C	6	6	655447	655452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13064	NC_006624	GAAG	2	8	655467	655474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_006624	TCA	2	6	655548	655553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_006624	GA	3	6	655692	655697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_006624	TAG	2	6	655708	655713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_006624	TGG	2	6	655829	655834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_006624	GCCC	2	8	655902	655909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13070	NC_006624	T	6	6	655938	655943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_006624	CCT	2	6	655959	655964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640695
13072	NC_006624	CTG	2	6	655983	655988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13073	NC_006624	CTC	2	6	656001	656006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640695
13074	NC_006624	GAG	2	6	656013	656018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640695
13075	NC_006624	GAG	2	6	656034	656039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640695
13076	NC_006624	AAC	2	6	656055	656060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640695
13077	NC_006624	TCG	2	6	656068	656073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13078	NC_006624	TTC	2	6	656122	656127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640695
13079	NC_006624	CCT	2	6	656130	656135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640695
13080	NC_006624	ACA	2	6	656164	656169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640695
13081	NC_006624	CAG	2	6	656229	656234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13082	NC_006624	TCT	3	9	656425	656433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640695
13083	NC_006624	TGAG	2	8	656459	656466	25 %	25 %	50 %	0 %	57640695
13084	NC_006624	GC	3	6	656548	656553	0 %	0 %	50 %	50 %	57640695
13085	NC_006624	CCT	2	6	656576	656581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640695
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13087	NC_006624	TTC	2	6	656623	656628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640695
13088	NC_006624	TGGGA	2	10	656678	656687	20 %	20 %	60 %	0 %	57640695
13089	NC_006624	GCTT	2	8	656734	656741	0 %	50 %	25 %	25 %	57640695
13090	NC_006624	TCC	2	6	656755	656760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640695
13091	NC_006624	TCCTC	2	10	656798	656807	0 %	40 %	0 %	60 %	57640695
13092	NC_006624	GCG	2	6	656831	656836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640695
13093	NC_006624	GTC	2	6	656919	656924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13094	NC_006624	GTCTG	2	10	657030	657039	0 %	40 %	40 %	20 %	57640695
13095	NC_006624	CCA	2	6	657068	657073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640695
13096	NC_006624	AAC	2	6	657105	657110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640695
13097	NC_006624	CTG	2	6	657142	657147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13098	NC_006624	CT	3	6	657150	657155	0 %	50 %	0 %	50 %	57640695
13099	NC_006624	CGG	2	6	657197	657202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640695
13100	NC_006624	CTT	2	6	657233	657238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640695
13101	NC_006624	CGA	2	6	657353	657358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13102	NC_006624	CGC	2	6	657380	657385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640695
13103	NC_006624	CGT	2	6	657431	657436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640695
13104	NC_006624	TATAT	2	10	657496	657505	40 %	60 %	0 %	0 %	57640695
13105	NC_006624	ATC	2	6	657520	657525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640695
13106	NC_006624	TGA	2	6	657578	657583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640695
13107	NC_006624	ATT	2	6	657589	657594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640695
13108	NC_006624	CG	3	6	657653	657658	0 %	0 %	50 %	50 %	57640695
13109	NC_006624	ACCT	2	8	657694	657701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_006624	GGA	2	6	657735	657740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640696
13111	NC_006624	TTG	2	6	657826	657831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640696
13112	NC_006624	CGA	2	6	657872	657877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640696
13113	NC_006624	CCTGA	2	10	657881	657890	20 %	20 %	20 %	40 %	57640696
13114	NC_006624	TCA	2	6	657998	658003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640696
13115	NC_006624	GAG	2	6	658050	658055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640696
13116	NC_006624	CTC	2	6	658070	658075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640696
13117	NC_006624	AGG	2	6	658124	658129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640696
13118	NC_006624	GAG	2	6	658200	658205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640696
13119	NC_006624	CCAG	2	8	658243	658250	25 %	0 %	25 %	50 %	57640696
13120	NC_006624	TAT	2	6	658344	658349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640696
13121	NC_006624	TG	3	6	658354	658359	0 %	50 %	50 %	0 %	57640696
13122	NC_006624	CCG	2	6	658486	658491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640696
13123	NC_006624	GAG	2	6	658524	658529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640696
13124	NC_006624	CGG	2	6	658565	658570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640696
13125	NC_006624	CAT	2	6	658638	658643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640696
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13127	NC_006624	GAG	2	6	658689	658694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_006624	GT	3	6	658747	658752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_006624	CGG	2	6	658857	658862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640697
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13164	NC_006624	TC	3	6	660453	660458	0 %	50 %	0 %	50 %	57640699
13165	NC_006624	GGAAA	2	10	660484	660493	60 %	0 %	40 %	0 %	57640699
13166	NC_006624	A	6	6	660687	660692	100 %	0 %	0 %	0 %	57640699
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13225	NC_006624	CAG	2	6	664117	664122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640699
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13229	NC_006624	GTC	2	6	664273	664278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640699
13230	NC_006624	GGA	2	6	664353	664358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640699
13231	NC_006624	AGG	2	6	664360	664365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640699
13232	NC_006624	GAT	2	6	664368	664373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640699
13233	NC_006624	T	7	7	664432	664438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13234	NC_006624	TTTGC	2	10	664485	664494	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13235	NC_006624	CCG	2	6	664532	664537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13236	NC_006624	GGT	2	6	664580	664585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13237	NC_006624	GAC	2	6	664661	664666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640700
13238	NC_006624	CGAG	2	8	664749	664756	25 %	0 %	50 %	25 %	57640700
13239	NC_006624	TCC	2	6	664761	664766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640700
13240	NC_006624	AGGC	2	8	664890	664897	25 %	0 %	50 %	25 %	57640700
13241	NC_006624	GTC	2	6	665000	665005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640700
13242	NC_006624	CGC	2	6	665084	665089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640700
13243	NC_006624	CAC	2	6	665159	665164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640700
13244	NC_006624	TCG	2	6	665214	665219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640700
13245	NC_006624	AAG	2	6	665264	665269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640700
13246	NC_006624	GATA	2	8	665290	665297	50 %	25 %	25 %	0 %	57640700
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13261	NC_006624	A	6	6	666017	666022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13362	NC_006624	TA	3	6	671986	671991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13492	NC_006624	CGT	2	6	677728	677733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640712
13493	NC_006624	GAA	2	6	677785	677790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640712
13494	NC_006624	TC	3	6	677802	677807	0 %	50 %	0 %	50 %	57640712
13495	NC_006624	TTG	2	6	677812	677817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640712
13496	NC_006624	AG	3	6	677828	677833	50 %	0 %	50 %	0 %	57640712
13497	NC_006624	CCT	2	6	677845	677850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640712
13498	NC_006624	AGTG	2	8	677855	677862	25 %	25 %	50 %	0 %	57640712
13499	NC_006624	CTC	2	6	677874	677879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640712
13500	NC_006624	GAC	2	6	677954	677959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640712

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