MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_006624	CGT	2	6	628180	628185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640663
12503	NC_006624	AGG	2	6	628197	628202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640663
12504	NC_006624	GA	3	6	628347	628352	50 %	0 %	50 %	0 %	57640663
12505	NC_006624	TTC	2	6	628449	628454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640663
12506	NC_006624	T	6	6	628691	628696	0 %	100 %	0 %	0 %	57640663
12507	NC_006624	CTTC	2	8	628722	628729	0 %	50 %	0 %	50 %	57640663
12508	NC_006624	AGG	2	6	628740	628745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640663
12509	NC_006624	GTT	2	6	628748	628753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640663
12510	NC_006624	GAA	2	6	628767	628772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640663
12511	NC_006624	TTG	2	6	628786	628791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640663
12512	NC_006624	GAG	3	9	628799	628807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640663
12513	NC_006624	GA	3	6	628819	628824	50 %	0 %	50 %	0 %	57640663
12514	NC_006624	CGC	2	6	628889	628894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640663
12515	NC_006624	TC	3	6	628996	629001	0 %	50 %	0 %	50 %	57640663
12516	NC_006624	CGC	2	6	629106	629111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640664
12517	NC_006624	GTA	2	6	629113	629118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640664
12518	NC_006624	GTC	3	9	629179	629187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640664
12519	NC_006624	GAG	2	6	629188	629193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640664
12520	NC_006624	AGG	2	6	629219	629224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640664
12521	NC_006624	GCTC	2	8	629241	629248	0 %	25 %	25 %	50 %	57640664
12522	NC_006624	GT	3	6	629258	629263	0 %	50 %	50 %	0 %	57640664
12523	NC_006624	TCT	2	6	629309	629314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640664
12524	NC_006624	AGA	2	6	629343	629348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640664
12525	NC_006624	GAAG	2	8	629350	629357	50 %	0 %	50 %	0 %	57640664
12526	NC_006624	GAA	2	6	629371	629376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640664
12527	NC_006624	TCA	2	6	629378	629383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640664
12528	NC_006624	CT	3	6	629396	629401	0 %	50 %	0 %	50 %	57640664
12529	NC_006624	GTA	2	6	629512	629517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640664
12530	NC_006624	GA	3	6	629569	629574	50 %	0 %	50 %	0 %	57640664
12531	NC_006624	GAA	2	6	629599	629604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640664
12532	NC_006624	AGA	2	6	629837	629842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640665
12533	NC_006624	CTC	2	6	629844	629849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640665
12534	NC_006624	CGC	2	6	629868	629873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640665
12535	NC_006624	GAG	2	6	629949	629954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640665
12536	NC_006624	GAT	2	6	630000	630005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640665
12537	NC_006624	ACG	2	6	630016	630021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640665
12538	NC_006624	CGCT	2	8	630062	630069	0 %	25 %	25 %	50 %	57640665
12539	NC_006624	GGA	2	6	630080	630085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640665
12540	NC_006624	GCC	2	6	630093	630098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640665
12541	NC_006624	GCC	2	6	630153	630158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640665
12542	NC_006624	CTC	2	6	630159	630164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640665
12543	NC_006624	AGT	2	6	630170	630175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640665
12544	NC_006624	CGT	2	6	630216	630221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640665
12545	NC_006624	TGA	2	6	630224	630229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640665
12546	NC_006624	GC	4	8	630231	630238	0 %	0 %	50 %	50 %	57640665
12547	NC_006624	CCCT	2	8	630239	630246	0 %	25 %	0 %	75 %	57640665
12548	NC_006624	GGA	2	6	630296	630301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640665
12549	NC_006624	GAG	2	6	630369	630374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640665
12550	NC_006624	ATG	2	6	630427	630432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640665
12551	NC_006624	TG	3	6	630437	630442	0 %	50 %	50 %	0 %	57640665
12552	NC_006624	GAA	2	6	630474	630479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640665
12553	NC_006624	GGGAA	2	10	630490	630499	40 %	0 %	60 %	0 %	57640665
12554	NC_006624	CCTT	2	8	630508	630515	0 %	50 %	0 %	50 %	57640665
12555	NC_006624	CCG	2	6	630532	630537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640665
12556	NC_006624	TGC	2	6	630601	630606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640665
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12558	NC_006624	GGA	2	6	630647	630652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640665
12559	NC_006624	CTT	2	6	630663	630668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640665
12560	NC_006624	GAG	2	6	630771	630776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640665
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12563	NC_006624	TGAAG	2	10	630851	630860	40 %	20 %	40 %	0 %	57640665
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12569	NC_006624	GAG	2	6	631187	631192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640666
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12572	NC_006624	CTG	2	6	631230	631235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640666
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12576	NC_006624	TCG	2	6	631548	631553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640666
12577	NC_006624	T	6	6	631802	631807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_006624	CGA	2	6	631928	631933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640667
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12581	NC_006624	GGT	2	6	632012	632017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640667
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12589	NC_006624	TTTC	2	8	632382	632389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12590	NC_006624	A	7	7	632418	632424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12593	NC_006624	A	6	6	632488	632493	100 %	0 %	0 %	0 %	57640668
12594	NC_006624	ATA	2	6	632530	632535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640668
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12601	NC_006624	ATTG	2	8	632918	632925	25 %	50 %	25 %	0 %	57640669
12602	NC_006624	CT	3	6	632939	632944	0 %	50 %	0 %	50 %	57640669
12603	NC_006624	TAG	2	6	632991	632996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640669
12604	NC_006624	AGA	2	6	633021	633026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640669
12605	NC_006624	TC	3	6	633075	633080	0 %	50 %	0 %	50 %	57640669
12606	NC_006624	GGA	2	6	633165	633170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640670
12607	NC_006624	ACGG	2	8	633245	633252	25 %	0 %	50 %	25 %	57640670
12608	NC_006624	CTC	2	6	633260	633265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640670
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12611	NC_006624	CCCA	2	8	633396	633403	25 %	0 %	0 %	75 %	57640670
12612	NC_006624	GGAG	2	8	633441	633448	25 %	0 %	75 %	0 %	57640670
12613	NC_006624	AGGA	2	8	633467	633474	50 %	0 %	50 %	0 %	57640670
12614	NC_006624	TTCC	2	8	633524	633531	0 %	50 %	0 %	50 %	57640670
12615	NC_006624	TCC	2	6	633542	633547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640670
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12617	NC_006624	TTG	2	6	633591	633596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640670
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12620	NC_006624	CT	3	6	633837	633842	0 %	50 %	0 %	50 %	57640670
12621	NC_006624	T	6	6	633941	633946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_006624	CT	3	6	633995	634000	0 %	50 %	0 %	50 %	57640671
12623	NC_006624	CAAG	2	8	634026	634033	50 %	0 %	25 %	25 %	57640671
12624	NC_006624	GTA	2	6	634082	634087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640671
12625	NC_006624	GAG	2	6	634103	634108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640671
12626	NC_006624	AGG	2	6	634184	634189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640671
12627	NC_006624	GA	3	6	634199	634204	50 %	0 %	50 %	0 %	57640671
12628	NC_006624	TTC	3	9	634244	634252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640671
12629	NC_006624	GGA	2	6	634297	634302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640671
12630	NC_006624	TGGC	2	8	634470	634477	0 %	25 %	50 %	25 %	57640671
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12633	NC_006624	GAT	2	6	634561	634566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640671
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12637	NC_006624	CATC	2	8	634786	634793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12638	NC_006624	CAA	2	6	634840	634845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640672
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12659	NC_006624	T	6	6	635933	635938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12747	NC_006624	GAT	2	6	640251	640256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640680
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12993	NC_006624	CGA	2	6	652247	652252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640692
12994	NC_006624	CGG	2	6	652275	652280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640692
12995	NC_006624	TCG	2	6	652301	652306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640692
12996	NC_006624	GAG	3	9	652332	652340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640692
12997	NC_006624	TCC	2	6	652356	652361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640693
12998	NC_006624	AG	3	6	652432	652437	50 %	0 %	50 %	0 %	57640693
12999	NC_006624	AGG	2	6	652486	652491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640693
13000	NC_006624	TGA	2	6	652511	652516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640693

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