MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_006624	CCT	2	6	576231	576236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640606
11503	NC_006624	GC	3	6	576323	576328	0 %	0 %	50 %	50 %	57640606
11504	NC_006624	TAG	2	6	576398	576403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640606
11505	NC_006624	CGT	2	6	576429	576434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640606
11506	NC_006624	CT	3	6	576476	576481	0 %	50 %	0 %	50 %	57640606
11507	NC_006624	GA	3	6	576525	576530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_006624	GCA	2	6	576584	576589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640607
11509	NC_006624	CTT	2	6	576607	576612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640607
11510	NC_006624	CTTT	2	8	576618	576625	0 %	75 %	0 %	25 %	57640607
11511	NC_006624	TCCTT	2	10	576656	576665	0 %	60 %	0 %	40 %	57640607
11512	NC_006624	GAA	2	6	576712	576717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640607
11513	NC_006624	ACC	2	6	576755	576760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640607
11514	NC_006624	CCT	2	6	576997	577002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640607
11515	NC_006624	TCT	2	6	577017	577022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640607
11516	NC_006624	CCG	2	6	577059	577064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640607
11517	NC_006624	AGT	2	6	577125	577130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640607
11518	NC_006624	TGG	2	6	577154	577159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640607
11519	NC_006624	CGT	2	6	577173	577178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640607
11520	NC_006624	TC	3	6	577270	577275	0 %	50 %	0 %	50 %	57640607
11521	NC_006624	TCG	2	6	577301	577306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640607
11522	NC_006624	ACC	2	6	577331	577336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640607
11523	NC_006624	CTC	2	6	577386	577391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640607
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11526	NC_006624	TCT	2	6	577458	577463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640607
11527	NC_006624	GCC	2	6	577505	577510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640607
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11529	NC_006624	GAT	2	6	577534	577539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640607
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11531	NC_006624	T	7	7	577610	577616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_006624	TCG	2	6	577716	577721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_006624	TTA	2	6	577737	577742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_006624	ACT	2	6	577743	577748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_006624	CAT	2	6	577812	577817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640608
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11537	NC_006624	GTC	2	6	577871	577876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640608
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11539	NC_006624	GGC	2	6	578104	578109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640608
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11543	NC_006624	CTCGGT	2	12	578203	578214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640608
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11546	NC_006624	TGG	2	6	578481	578486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640608
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11556	NC_006624	GAG	2	6	578987	578992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640609
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11559	NC_006624	TTTC	2	8	579135	579142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_006624	TAA	2	6	579262	579267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_006624	TTTAA	2	10	579288	579297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_006624	TAATTG	2	12	579304	579315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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11565	NC_006624	AAT	2	6	579386	579391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11570	NC_006624	TCA	2	6	579509	579514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_006624	CATA	2	8	580836	580843	50 %	25 %	0 %	25 %	57640610
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11599	NC_006624	TTCA	2	8	581372	581379	25 %	50 %	0 %	25 %	57640611
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11602	NC_006624	AG	3	6	581422	581427	50 %	0 %	50 %	0 %	57640611
11603	NC_006624	ACAGC	2	10	581559	581568	40 %	0 %	20 %	40 %	57640611
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11606	NC_006624	GAATG	2	10	581644	581653	40 %	20 %	40 %	0 %	57640611
11607	NC_006624	TCG	2	6	581663	581668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640611
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11610	NC_006624	TATCCC	2	12	581853	581864	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	57640611
11611	NC_006624	GAAG	2	8	581867	581874	50 %	0 %	50 %	0 %	57640611
11612	NC_006624	GA	3	6	581897	581902	50 %	0 %	50 %	0 %	57640611
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11619	NC_006624	CTAG	2	8	582254	582261	25 %	25 %	25 %	25 %	57640611
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11624	NC_006624	TCC	2	6	582599	582604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640612
11625	NC_006624	CT	3	6	582620	582625	0 %	50 %	0 %	50 %	57640612
11626	NC_006624	TCGG	2	8	582635	582642	0 %	25 %	50 %	25 %	57640612
11627	NC_006624	GGGT	2	8	582644	582651	0 %	25 %	75 %	0 %	57640612
11628	NC_006624	CTGC	2	8	582747	582754	0 %	25 %	25 %	50 %	57640612
11629	NC_006624	TCA	2	6	582762	582767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640612
11630	NC_006624	GC	3	6	582768	582773	0 %	0 %	50 %	50 %	57640612
11631	NC_006624	ATG	2	6	582905	582910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640612
11632	NC_006624	TCC	2	6	582940	582945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640612
11633	NC_006624	ATT	2	6	582983	582988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640612
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11636	NC_006624	TCA	2	6	583256	583261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640612
11637	NC_006624	GAA	2	6	583324	583329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640612
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11639	NC_006624	CT	3	6	583454	583459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11640	NC_006624	TTCT	2	8	583534	583541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11641	NC_006624	CTG	2	6	583557	583562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11642	NC_006624	CCG	2	6	583617	583622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640613
11643	NC_006624	CCG	2	6	583629	583634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640613
11644	NC_006624	GCC	2	6	583640	583645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640613
11645	NC_006624	TGG	2	6	583654	583659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640613
11646	NC_006624	CGT	2	6	583675	583680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640613
11647	NC_006624	GCT	2	6	583701	583706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640613
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11649	NC_006624	GAT	2	6	583751	583756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640613
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11652	NC_006624	TCG	2	6	583965	583970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640613
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11686	NC_006624	TCC	2	6	585243	585248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11687	NC_006624	AAAT	2	8	585345	585352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11688	NC_006624	CT	3	6	585433	585438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11689	NC_006624	TGAGGT	2	12	585489	585500	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11692	NC_006624	CTT	2	6	585571	585576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11693	NC_006624	TGA	2	6	585692	585697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11697	NC_006624	GA	3	6	585877	585882	50 %	0 %	50 %	0 %	57640614
11698	NC_006624	AG	3	6	586035	586040	50 %	0 %	50 %	0 %	57640614
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11706	NC_006624	GAG	2	6	586371	586376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640614
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11722	NC_006624	AAGA	2	8	587290	587297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11723	NC_006624	AGAC	2	8	587301	587308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11724	NC_006624	AATA	2	8	587309	587316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11725	NC_006624	A	6	6	587322	587327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11740	NC_006624	T	6	6	588087	588092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11741	NC_006624	TAT	2	6	588110	588115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11742	NC_006624	AT	3	6	588114	588119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11743	NC_006624	T	6	6	588125	588130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11744	NC_006624	CTA	2	6	588201	588206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11991	NC_006624	AGT	2	6	602958	602963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640633
11992	NC_006624	GTT	2	6	603020	603025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640633
11993	NC_006624	GAG	2	6	603058	603063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640633
11994	NC_006624	TCG	3	9	603119	603127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640633
11995	NC_006624	GCG	2	6	603188	603193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640633
11996	NC_006624	TTG	2	6	603209	603214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640633
11997	NC_006624	AGGA	2	8	603218	603225	50 %	0 %	50 %	0 %	57640633
11998	NC_006624	CGG	2	6	603237	603242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640633
11999	NC_006624	CTTCC	2	10	603316	603325	0 %	40 %	0 %	60 %	57640633
12000	NC_006624	TC	3	6	603360	603365	0 %	50 %	0 %	50 %	57640633

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