MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_006624	CAT	2	6	479879	479884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640493
9503	NC_006624	ATAGT	2	10	479904	479913	40 %	40 %	20 %	0 %	57640493
9504	NC_006624	CTT	2	6	479963	479968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640493
9505	NC_006624	CGGT	2	8	480009	480016	0 %	25 %	50 %	25 %	57640493
9506	NC_006624	TAT	2	6	480017	480022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640493
9507	NC_006624	TCA	2	6	480042	480047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640493
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9509	NC_006624	ACC	2	6	480173	480178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9510	NC_006624	AAT	2	6	480268	480273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640494
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9512	NC_006624	CTCC	2	8	480359	480366	0 %	25 %	0 %	75 %	57640494
9513	NC_006624	CTT	3	9	480457	480465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640494
9514	NC_006624	GAA	2	6	480474	480479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640494
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9517	NC_006624	CTT	2	6	480538	480543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640494
9518	NC_006624	TC	3	6	480649	480654	0 %	50 %	0 %	50 %	57640494
9519	NC_006624	GC	3	6	480716	480721	0 %	0 %	50 %	50 %	57640494
9520	NC_006624	TCG	2	6	480722	480727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640494
9521	NC_006624	GAAGG	2	10	480775	480784	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_006624	AAGGAA	2	12	480827	480838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9539	NC_006624	CG	4	8	481468	481475	0 %	0 %	50 %	50 %	57640496
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9541	NC_006624	GCG	2	6	481587	481592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640496
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9599	NC_006624	TG	3	6	484117	484122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_006624	TTAT	2	8	484132	484139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9606	NC_006624	TTTGT	2	10	484349	484358	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_006624	TA	3	6	484378	484383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_006624	TTTA	2	8	484410	484417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9998	NC_006624	CAT	2	6	503479	503484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640521
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10000	NC_006624	GAC	2	6	503502	503507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640522

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