MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_006624	GCTCAG	2	12	454590	454601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	57640463
9002	NC_006624	CTT	2	6	454664	454669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_006624	T	7	7	454676	454682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_006624	GAA	2	6	454683	454688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_006624	AAC	2	6	454698	454703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_006624	ATT	3	9	454854	454862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640464
9007	NC_006624	GTT	3	9	454923	454931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640464
9008	NC_006624	TGGGA	2	10	454962	454971	20 %	20 %	60 %	0 %	57640464
9009	NC_006624	CGC	2	6	454987	454992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640464
9010	NC_006624	GAA	2	6	455127	455132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640464
9011	NC_006624	GGA	2	6	455144	455149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640464
9012	NC_006624	GTT	2	6	455378	455383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640465
9013	NC_006624	TCT	2	6	455386	455391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640465
9014	NC_006624	T	6	6	455403	455408	0 %	100 %	0 %	0 %	57640465
9015	NC_006624	AGG	2	6	455490	455495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640465
9016	NC_006624	ATA	2	6	455552	455557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_006624	CTG	2	6	455582	455587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640466
9018	NC_006624	CCG	2	6	455651	455656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640466
9019	NC_006624	GGC	2	6	455657	455662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640466
9020	NC_006624	GGC	2	6	455862	455867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640467
9021	NC_006624	ATA	2	6	455878	455883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640467
9022	NC_006624	ATC	2	6	455942	455947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640467
9023	NC_006624	CTG	2	6	456136	456141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640467
9024	NC_006624	CTG	2	6	456262	456267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640467
9025	NC_006624	GTG	2	6	456327	456332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_006624	AGGAAG	2	12	456379	456390	50 %	0 %	50 %	0 %	57640468
9027	NC_006624	CGA	2	6	456429	456434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640468
9028	NC_006624	AG	3	6	456445	456450	50 %	0 %	50 %	0 %	57640468
9029	NC_006624	GAG	2	6	456490	456495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640468
9030	NC_006624	GTG	2	6	456502	456507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640468
9031	NC_006624	TGG	2	6	456577	456582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640468
9032	NC_006624	CGAGC	2	10	456606	456615	20 %	0 %	40 %	40 %	57640468
9033	NC_006624	TCT	2	6	456620	456625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640468
9034	NC_006624	GAG	2	6	456726	456731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640469
9035	NC_006624	TTAT	2	8	456770	456777	25 %	75 %	0 %	0 %	57640469
9036	NC_006624	AAAG	2	8	456786	456793	75 %	0 %	25 %	0 %	57640469
9037	NC_006624	AGG	2	6	456832	456837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640469
9038	NC_006624	GTT	2	6	456857	456862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640470
9039	NC_006624	GCAA	2	8	456902	456909	50 %	0 %	25 %	25 %	57640470
9040	NC_006624	CGA	2	6	456916	456921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640470
9041	NC_006624	GCC	2	6	456923	456928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640470
9042	NC_006624	GC	3	6	456958	456963	0 %	0 %	50 %	50 %	57640470
9043	NC_006624	TCT	2	6	457014	457019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640470
9044	NC_006624	CGA	2	6	457126	457131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640470
9045	NC_006624	TCC	2	6	457248	457253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640470
9046	NC_006624	AGG	2	6	457269	457274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640470
9047	NC_006624	CGA	2	6	457486	457491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640470
9048	NC_006624	TCC	2	6	457497	457502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640470
9049	NC_006624	GCTC	2	8	457570	457577	0 %	25 %	25 %	50 %	57640470
9050	NC_006624	CG	3	6	457578	457583	0 %	0 %	50 %	50 %	57640470
9051	NC_006624	GAG	2	6	457586	457591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640470
9052	NC_006624	CCTC	2	8	457595	457602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9053	NC_006624	T	6	6	457608	457613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_006624	AG	3	6	457747	457752	50 %	0 %	50 %	0 %	57640471
9055	NC_006624	ATC	2	6	457832	457837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640471
9056	NC_006624	AG	3	6	457987	457992	50 %	0 %	50 %	0 %	57640471
9057	NC_006624	AGG	2	6	458019	458024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640471
9058	NC_006624	GA	4	8	458153	458160	50 %	0 %	50 %	0 %	57640471
9059	NC_006624	AAGT	2	8	458191	458198	50 %	25 %	25 %	0 %	57640471
9060	NC_006624	TCC	2	6	458236	458241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9061	NC_006624	AATG	2	8	458243	458250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_006624	T	6	6	458277	458282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_006624	AAACC	2	10	458401	458410	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9064	NC_006624	TA	3	6	458419	458424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_006624	AACC	2	8	458429	458436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9066	NC_006624	GAC	2	6	458451	458456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_006624	AC	3	6	458455	458460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_006624	AAAG	2	8	458463	458470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_006624	GTC	2	6	458486	458491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9070	NC_006624	ACC	2	6	458525	458530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640472
9071	NC_006624	ACT	2	6	458553	458558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640472
9072	NC_006624	AGA	2	6	458643	458648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640472
9073	NC_006624	TGGA	2	8	458723	458730	25 %	25 %	50 %	0 %	57640472
9074	NC_006624	GAG	2	6	458753	458758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640472
9075	NC_006624	CGA	2	6	458779	458784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9076	NC_006624	GCG	2	6	458823	458828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640472
9077	NC_006624	CCA	2	6	458829	458834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640472
9078	NC_006624	TCG	2	6	458856	458861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9079	NC_006624	CAT	2	6	458872	458877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640472
9080	NC_006624	CTA	2	6	458890	458895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640472
9081	NC_006624	CGA	2	6	458959	458964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9082	NC_006624	AAC	2	6	458996	459001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640472
9083	NC_006624	CGA	2	6	459046	459051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9084	NC_006624	AGC	2	6	459057	459062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9085	NC_006624	AGGCCA	2	12	459069	459080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640472
9086	NC_006624	TGG	2	6	459104	459109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640472
9087	NC_006624	AAG	2	6	459119	459124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640472
9088	NC_006624	CTT	2	6	459135	459140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_006624	TTC	2	6	459148	459153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640473
9090	NC_006624	CTT	2	6	459211	459216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640473
9091	NC_006624	A	6	6	459541	459546	100 %	0 %	0 %	0 %	57640473
9092	NC_006624	CCT	2	6	459574	459579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640473
9093	NC_006624	CTC	2	6	459611	459616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640473
9094	NC_006624	CAGC	2	8	459636	459643	25 %	0 %	25 %	50 %	57640473
9095	NC_006624	ACC	2	6	459662	459667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640473
9096	NC_006624	TTA	2	6	459695	459700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_006624	AGA	2	6	459886	459891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640474
9098	NC_006624	GGA	2	6	459898	459903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640474
9099	NC_006624	TTC	2	6	459923	459928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640474
9100	NC_006624	TTG	2	6	459945	459950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640474
9101	NC_006624	GCG	2	6	459966	459971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640474
9102	NC_006624	GTG	2	6	459986	459991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640474
9103	NC_006624	AAC	2	6	460049	460054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640474
9104	NC_006624	GGT	2	6	460082	460087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640474
9105	NC_006624	GA	3	6	460117	460122	50 %	0 %	50 %	0 %	57640474
9106	NC_006624	GCT	2	6	460165	460170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640474
9107	NC_006624	GCG	2	6	460206	460211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640474
9108	NC_006624	TGA	2	6	460258	460263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640474
9109	NC_006624	CGC	2	6	460332	460337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640474
9110	NC_006624	GAA	2	6	460393	460398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640474
9111	NC_006624	GAC	2	6	460427	460432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640474
9112	NC_006624	CCA	2	6	460473	460478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640474
9113	NC_006624	TGG	2	6	460494	460499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640474
9114	NC_006624	GAA	2	6	460648	460653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640474
9115	NC_006624	CCT	2	6	460764	460769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640475
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9117	NC_006624	CTT	2	6	460959	460964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640475
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9120	NC_006624	TCG	2	6	461158	461163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640475
9121	NC_006624	TTCC	2	8	461192	461199	0 %	50 %	0 %	50 %	57640475
9122	NC_006624	GTG	2	6	461214	461219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640475
9123	NC_006624	CAT	2	6	461256	461261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640475
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9249	NC_006624	TAG	2	6	466989	466994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640482
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