MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_006624	GAT	2	6	348124	348129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640357
7002	NC_006624	AGGA	2	8	348200	348207	50 %	0 %	50 %	0 %	57640357
7003	NC_006624	TGG	2	6	348234	348239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640357
7004	NC_006624	CGA	2	6	348277	348282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640357
7005	NC_006624	GGA	2	6	348310	348315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640357
7006	NC_006624	TGG	2	6	348345	348350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640357
7007	NC_006624	TCA	2	6	348370	348375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640357
7008	NC_006624	CTG	2	6	348431	348436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640357
7009	NC_006624	GGC	2	6	348442	348447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640357
7010	NC_006624	CTG	2	6	348463	348468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640357
7011	NC_006624	GAAAA	2	10	348529	348538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_006624	CCCTCG	2	12	348617	348628	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	57640358
7013	NC_006624	TC	3	6	348694	348699	0 %	50 %	0 %	50 %	57640358
7014	NC_006624	GAA	2	6	348708	348713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640358
7015	NC_006624	GTC	2	6	348741	348746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640358
7016	NC_006624	CAG	2	6	348819	348824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640358
7017	NC_006624	GTC	2	6	348843	348848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640358
7018	NC_006624	TGAG	2	8	348958	348965	25 %	25 %	50 %	0 %	57640358
7019	NC_006624	CCG	2	6	348985	348990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640358
7020	NC_006624	GCG	2	6	349006	349011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640358
7021	NC_006624	ATC	2	6	349056	349061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640358
7022	NC_006624	CTC	2	6	349104	349109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640358
7023	NC_006624	CCG	2	6	349153	349158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640358
7024	NC_006624	GAA	2	6	349185	349190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640358
7025	NC_006624	CCG	2	6	349216	349221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640358
7026	NC_006624	AGT	2	6	349271	349276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640358
7027	NC_006624	CGTCC	2	10	349284	349293	0 %	20 %	20 %	60 %	57640358
7028	NC_006624	GGA	2	6	349412	349417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640358
7029	NC_006624	T	6	6	349422	349427	0 %	100 %	0 %	0 %	57640358
7030	NC_006624	CAA	2	6	349559	349564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640358
7031	NC_006624	TCCCT	2	10	349652	349661	0 %	40 %	0 %	60 %	57640358
7032	NC_006624	ACG	2	6	349687	349692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640358
7033	NC_006624	CCG	2	6	349703	349708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640358
7034	NC_006624	TC	4	8	349878	349885	0 %	50 %	0 %	50 %	57640358
7035	NC_006624	AGT	2	6	349967	349972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640358
7036	NC_006624	CA	3	6	349999	350004	50 %	0 %	0 %	50 %	57640358
7037	NC_006624	CCGCC	2	10	350069	350078	0 %	0 %	20 %	80 %	57640358
7038	NC_006624	GAA	3	9	350132	350140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640358
7039	NC_006624	TTA	2	6	350204	350209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640358
7040	NC_006624	ATG	2	6	350239	350244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640358
7041	NC_006624	TCG	2	6	350314	350319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640358
7042	NC_006624	CGA	2	6	350363	350368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640358
7043	NC_006624	TCCA	2	8	350398	350405	25 %	25 %	0 %	50 %	57640358
7044	NC_006624	GTT	2	6	350490	350495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_006624	ACCCGA	2	12	350613	350624	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	57640359
7046	NC_006624	ATA	2	6	350657	350662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640359
7047	NC_006624	GCAAAG	2	12	350723	350734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	57640359
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7049	NC_006624	AGC	2	6	350796	350801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640359
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7051	NC_006624	GGA	2	6	350857	350862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640359
7052	NC_006624	TTG	2	6	350874	350879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640359
7053	NC_006624	AGA	2	6	350895	350900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640359
7054	NC_006624	TAGAAG	2	12	350916	350927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57640359
7055	NC_006624	TCT	2	6	350932	350937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640359
7056	NC_006624	GGA	3	9	350938	350946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640359
7057	NC_006624	AGA	2	6	351107	351112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640359
7058	NC_006624	AAGGTT	2	12	351197	351208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640359
7059	NC_006624	AGATG	2	10	351235	351244	40 %	20 %	40 %	0 %	57640359
7060	NC_006624	TCT	2	6	351288	351293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640359
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7065	NC_006624	CTG	2	6	351536	351541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640359
7066	NC_006624	TCGA	2	8	351551	351558	25 %	25 %	25 %	25 %	57640359
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7069	NC_006624	GCCT	2	8	351718	351725	0 %	25 %	25 %	50 %	57640360
7070	NC_006624	CGT	2	6	351729	351734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640360
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7073	NC_006624	GA	3	6	351823	351828	50 %	0 %	50 %	0 %	57640360
7074	NC_006624	GAT	2	6	352140	352145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640360
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7080	NC_006624	CTA	3	9	352601	352609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640361
7081	NC_006624	ACG	2	6	352732	352737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640361
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7090	NC_006624	ACT	2	6	353285	353290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640362
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7092	NC_006624	ACCCA	2	10	353376	353385	40 %	0 %	0 %	60 %	57640362
7093	NC_006624	CAG	2	6	353403	353408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640362
7094	NC_006624	GTCT	2	8	353453	353460	0 %	50 %	25 %	25 %	57640362
7095	NC_006624	TTAT	2	8	353492	353499	25 %	75 %	0 %	0 %	57640362
7096	NC_006624	AG	4	8	353671	353678	50 %	0 %	50 %	0 %	57640362
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7099	NC_006624	CT	3	6	353722	353727	0 %	50 %	0 %	50 %	57640362
7100	NC_006624	C	6	6	353754	353759	0 %	0 %	0 %	100 %	57640362
7101	NC_006624	GA	3	6	353792	353797	50 %	0 %	50 %	0 %	57640362
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7104	NC_006624	GTT	2	6	353935	353940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640362
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7106	NC_006624	T	6	6	354139	354144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_006624	TGG	2	6	354165	354170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_006624	GGA	2	6	354171	354176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_006624	GTT	2	6	354225	354230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640363
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7112	NC_006624	CTT	2	6	354371	354376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640363
7113	NC_006624	AAGG	2	8	354390	354397	50 %	0 %	50 %	0 %	57640363
7114	NC_006624	CTT	2	6	354407	354412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640363
7115	NC_006624	AG	3	6	354458	354463	50 %	0 %	50 %	0 %	57640363
7116	NC_006624	CCT	2	6	354533	354538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640363
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7119	NC_006624	CT	3	6	354581	354586	0 %	50 %	0 %	50 %	57640363
7120	NC_006624	CGA	2	6	354641	354646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640363
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7122	NC_006624	CAC	2	6	354713	354718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640363
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7124	NC_006624	GAG	2	6	354743	354748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640363
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7138	NC_006624	CGT	3	9	355461	355469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640364
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7230	NC_006624	GGGGC	2	10	359609	359618	0 %	0 %	80 %	20 %	57640369
7231	NC_006624	CGT	3	9	359634	359642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640369
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7239	NC_006624	GAG	2	6	360010	360015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640369
7240	NC_006624	GAGG	2	8	360033	360040	25 %	0 %	75 %	0 %	57640369
7241	NC_006624	GGC	2	6	360069	360074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640369
7242	NC_006624	CTGG	2	8	360082	360089	0 %	25 %	50 %	25 %	57640369
7243	NC_006624	CGG	2	6	360114	360119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640369
7244	NC_006624	GGC	2	6	360141	360146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640369
7245	NC_006624	GGGGC	2	10	360222	360231	0 %	0 %	80 %	20 %	57640370
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7364	NC_006624	TA	3	6	367740	367745	50 %	50 %	0 %	0 %	57640375
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7370	NC_006624	TAA	2	6	368216	368221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7372	NC_006624	GCT	2	6	368292	368297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640376
7373	NC_006624	TCT	2	6	368305	368310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640376
7374	NC_006624	CTT	2	6	368321	368326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640376
7375	NC_006624	CTT	2	6	368363	368368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640376
7376	NC_006624	CCT	2	6	368407	368412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640376
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7397	NC_006624	GGT	2	6	369331	369336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7401	NC_006624	AAT	2	6	369408	369413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7402	NC_006624	ATATTG	2	12	369435	369446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7403	NC_006624	AAT	2	6	369447	369452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7409	NC_006624	CATA	2	8	369971	369978	50 %	25 %	0 %	25 %	57640377
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7415	NC_006624	CTTT	2	8	370427	370434	0 %	75 %	0 %	25 %	57640378
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7472	NC_006624	ACC	2	6	373554	373559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7473	NC_006624	TCC	2	6	373625	373630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7474	NC_006624	ATA	2	6	373634	373639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7480	NC_006624	TCC	2	6	374219	374224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7481	NC_006624	CAA	2	6	374243	374248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7484	NC_006624	AT	3	6	374414	374419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7485	NC_006624	GGT	2	6	374580	374585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7486	NC_006624	CAT	2	6	374594	374599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640380
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7497	NC_006624	TTC	3	9	375188	375196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640381
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