MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_006624	GAC	2	6	325590	325595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640321
6502	NC_006624	GA	3	6	325613	325618	50 %	0 %	50 %	0 %	57640321
6503	NC_006624	TCACGA	2	12	325768	325779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57640321
6504	NC_006624	GA	3	6	325778	325783	50 %	0 %	50 %	0 %	57640321
6505	NC_006624	TTG	2	6	325810	325815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640321
6506	NC_006624	ATCA	2	8	325923	325930	50 %	25 %	0 %	25 %	57640321
6507	NC_006624	CAGC	2	8	325945	325952	25 %	0 %	25 %	50 %	57640321
6508	NC_006624	GCC	2	6	325983	325988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640321
6509	NC_006624	AAG	3	9	325998	326006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640321
6510	NC_006624	CAA	2	6	326087	326092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640321
6511	NC_006624	TGA	2	6	326240	326245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640321
6512	NC_006624	CA	3	6	326275	326280	50 %	0 %	0 %	50 %	57640321
6513	NC_006624	AAC	2	6	326291	326296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640321
6514	NC_006624	AAG	2	6	326316	326321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640321
6515	NC_006624	GGT	2	6	326406	326411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_006624	AAC	3	9	326430	326438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640322
6517	NC_006624	A	7	7	326440	326446	100 %	0 %	0 %	0 %	57640322
6518	NC_006624	ACA	2	6	326521	326526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640322
6519	NC_006624	CAG	2	6	326540	326545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640322
6520	NC_006624	ACA	2	6	326546	326551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640322
6521	NC_006624	ACT	2	6	326625	326630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640322
6522	NC_006624	ACA	2	6	326631	326636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640322
6523	NC_006624	AGA	2	6	326673	326678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640322
6524	NC_006624	TCA	2	6	326697	326702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640322
6525	NC_006624	CAA	2	6	326845	326850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640322
6526	NC_006624	CCG	2	6	326874	326879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640322
6527	NC_006624	CATT	2	8	326901	326908	25 %	50 %	0 %	25 %	57640322
6528	NC_006624	CA	3	6	326919	326924	50 %	0 %	0 %	50 %	57640322
6529	NC_006624	TGAC	2	8	326944	326951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_006624	GCA	2	6	326968	326973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640323
6531	NC_006624	CCT	2	6	326988	326993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640323
6532	NC_006624	CAG	2	6	327026	327031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640323
6533	NC_006624	CCT	2	6	327036	327041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640323
6534	NC_006624	CGG	2	6	327140	327145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640323
6535	NC_006624	CGG	2	6	327159	327164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640323
6536	NC_006624	AGC	2	6	327264	327269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640323
6537	NC_006624	AGG	2	6	327277	327282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640323
6538	NC_006624	CAT	2	6	327304	327309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640324
6539	NC_006624	ATCCTC	2	12	327362	327373	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	57640324
6540	NC_006624	CTC	2	6	327434	327439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640324
6541	NC_006624	CTTT	2	8	327462	327469	0 %	75 %	0 %	25 %	57640324
6542	NC_006624	GAAA	2	8	327528	327535	75 %	0 %	25 %	0 %	57640325
6543	NC_006624	GA	3	6	327536	327541	50 %	0 %	50 %	0 %	57640325
6544	NC_006624	TAC	2	6	327564	327569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640325
6545	NC_006624	CGC	2	6	327574	327579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640325
6546	NC_006624	TGG	2	6	327587	327592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640325
6547	NC_006624	CGG	3	9	327601	327609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640325
6548	NC_006624	GGC	2	6	327611	327616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640325
6549	NC_006624	CAC	2	6	327658	327663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640325
6550	NC_006624	GAG	2	6	327749	327754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640325
6551	NC_006624	TAC	2	6	327896	327901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640325
6552	NC_006624	ACG	2	6	328056	328061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640325
6553	NC_006624	CTA	2	6	328072	328077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640325
6554	NC_006624	TAT	2	6	328082	328087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640325
6555	NC_006624	AGC	2	6	328103	328108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640325
6556	NC_006624	TAC	2	6	328120	328125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640325
6557	NC_006624	TCA	2	6	328164	328169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640325
6558	NC_006624	AAC	2	6	328184	328189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640325
6559	NC_006624	CAA	2	6	328228	328233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640325
6560	NC_006624	GTT	2	6	328298	328303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640325
6561	NC_006624	CAC	2	6	328348	328353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640326
6562	NC_006624	T	7	7	328409	328415	0 %	100 %	0 %	0 %	57640326
6563	NC_006624	AAAG	2	8	328459	328466	75 %	0 %	25 %	0 %	57640326
6564	NC_006624	CAA	2	6	328509	328514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640326
6565	NC_006624	ACA	2	6	328628	328633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640326
6566	NC_006624	AAG	2	6	328672	328677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640326
6567	NC_006624	TGG	2	6	328740	328745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640326
6568	NC_006624	GAA	2	6	328822	328827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640327
6569	NC_006624	AT	3	6	328850	328855	50 %	50 %	0 %	0 %	57640327
6570	NC_006624	AT	3	6	328858	328863	50 %	50 %	0 %	0 %	57640327
6571	NC_006624	TA	3	6	328864	328869	50 %	50 %	0 %	0 %	57640327
6572	NC_006624	TAG	2	6	328873	328878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640327
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6574	NC_006624	TTGG	2	8	328912	328919	0 %	50 %	50 %	0 %	57640327
6575	NC_006624	GAG	2	6	329034	329039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640327
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6578	NC_006624	CAA	2	6	329174	329179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640327
6579	NC_006624	AAT	2	6	329186	329191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640327
6580	NC_006624	ACG	2	6	329214	329219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640327
6581	NC_006624	TAC	2	6	329220	329225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640327
6582	NC_006624	AAC	2	6	329274	329279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640327
6583	NC_006624	CTG	2	6	329329	329334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640328
6584	NC_006624	CAG	2	6	329351	329356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640328
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6587	NC_006624	GTT	2	6	329464	329469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640328
6588	NC_006624	TTCAGG	2	12	329570	329581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57640328
6589	NC_006624	GA	3	6	329655	329660	50 %	0 %	50 %	0 %	57640328
6590	NC_006624	AAC	2	6	329686	329691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640328
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6594	NC_006624	CAG	2	6	329887	329892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640328
6595	NC_006624	ACG	2	6	329894	329899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640328
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6601	NC_006624	CGG	2	6	330021	330026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640328
6602	NC_006624	TCG	2	6	330032	330037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640328
6603	NC_006624	TGG	2	6	330041	330046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640328
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6606	NC_006624	G	6	6	330122	330127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_006624	TAG	2	6	330172	330177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_006624	T	6	6	330178	330183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_006624	A	6	6	330209	330214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_006624	CAGC	2	8	330288	330295	25 %	0 %	25 %	50 %	57640329
6611	NC_006624	TAC	2	6	330449	330454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640329
6612	NC_006624	CAG	2	6	330457	330462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640329
6613	NC_006624	GA	3	6	330491	330496	50 %	0 %	50 %	0 %	57640329
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6618	NC_006624	AGG	2	6	330773	330778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640329
6619	NC_006624	GGT	2	6	330827	330832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640329
6620	NC_006624	GA	3	6	330868	330873	50 %	0 %	50 %	0 %	57640329
6621	NC_006624	CG	3	6	330892	330897	0 %	0 %	50 %	50 %	57640329
6622	NC_006624	GAG	2	6	330988	330993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640329
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6990	NC_006624	A	6	6	347446	347451	100 %	0 %	0 %	0 %	57640357
6991	NC_006624	C	6	6	347577	347582	0 %	0 %	0 %	100 %	57640357
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7000	NC_006624	CGT	2	6	348073	348078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640357

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