MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 41071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006624	TGC	2	6	301695	301700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640292
6002	NC_006624	CTC	2	6	301754	301759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_006624	GAA	2	6	301773	301778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_006624	AGA	2	6	301781	301786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_006624	A	6	6	301789	301794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_006624	CAT	2	6	301806	301811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640293
6007	NC_006624	GAC	2	6	301871	301876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640293
6008	NC_006624	GAC	2	6	301880	301885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640293
6009	NC_006624	CCT	2	6	301915	301920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640293
6010	NC_006624	ACG	2	6	301926	301931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640293
6011	NC_006624	GGA	2	6	301966	301971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640293
6012	NC_006624	GTTC	2	8	301972	301979	0 %	50 %	25 %	25 %	57640293
6013	NC_006624	CGC	2	6	301990	301995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640293
6014	NC_006624	TGG	2	6	302005	302010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640293
6015	NC_006624	TC	4	8	302062	302069	0 %	50 %	0 %	50 %	57640293
6016	NC_006624	ACG	2	6	302211	302216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640293
6017	NC_006624	ACCTTC	2	12	302217	302228	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	57640293
6018	NC_006624	CTC	2	6	302246	302251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640293
6019	NC_006624	TGT	2	6	302263	302268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640293
6020	NC_006624	ATCTCC	2	12	302286	302297	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	57640293
6021	NC_006624	TCT	2	6	302301	302306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640293
6022	NC_006624	ATC	2	6	302355	302360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640293
6023	NC_006624	GGC	2	6	302384	302389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640293
6024	NC_006624	CTG	2	6	302411	302416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640293
6025	NC_006624	TCCT	2	8	302417	302424	0 %	50 %	0 %	50 %	57640293
6026	NC_006624	TCGC	2	8	302511	302518	0 %	25 %	25 %	50 %	57640293
6027	NC_006624	TGG	2	6	302523	302528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640293
6028	NC_006624	GT	3	6	302547	302552	0 %	50 %	50 %	0 %	57640293
6029	NC_006624	TCCT	2	8	302728	302735	0 %	50 %	0 %	50 %	57640293
6030	NC_006624	CTT	2	6	302737	302742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640293
6031	NC_006624	TC	4	8	302757	302764	0 %	50 %	0 %	50 %	57640293
6032	NC_006624	AGCCGT	2	12	302767	302778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	57640293
6033	NC_006624	AGTT	2	8	302932	302939	25 %	50 %	25 %	0 %	57640293
6034	NC_006624	TGA	2	6	302941	302946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640293
6035	NC_006624	TTA	2	6	302989	302994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640293
6036	NC_006624	CCT	2	6	302998	303003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640293
6037	NC_006624	GTCCT	2	10	303123	303132	0 %	40 %	20 %	40 %	57640293
6038	NC_006624	TCT	2	6	303139	303144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640293
6039	NC_006624	TCA	2	6	303156	303161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640293
6040	NC_006624	TC	4	8	303247	303254	0 %	50 %	0 %	50 %	57640293
6041	NC_006624	ACCCC	2	10	303255	303264	20 %	0 %	0 %	80 %	57640293
6042	NC_006624	CCT	2	6	303325	303330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640294
6043	NC_006624	GTA	2	6	303385	303390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640294
6044	NC_006624	TCG	2	6	303473	303478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640294
6045	NC_006624	TTC	2	6	303494	303499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640294
6046	NC_006624	AGCC	2	8	303575	303582	25 %	0 %	25 %	50 %	57640294
6047	NC_006624	TGG	2	6	303632	303637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640294
6048	NC_006624	TGA	2	6	303645	303650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640294
6049	NC_006624	TCGT	2	8	303713	303720	0 %	50 %	25 %	25 %	57640294
6050	NC_006624	CTCA	2	8	303754	303761	25 %	25 %	0 %	50 %	57640294
6051	NC_006624	GAA	2	6	303794	303799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640295
6052	NC_006624	GTCGTT	2	12	303809	303820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	57640295
6053	NC_006624	CTC	2	6	303848	303853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640295
6054	NC_006624	TC	3	6	303914	303919	0 %	50 %	0 %	50 %	57640295
6055	NC_006624	CGTC	2	8	303928	303935	0 %	25 %	25 %	50 %	57640295
6056	NC_006624	GAG	2	6	303941	303946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640295
6057	NC_006624	CCT	2	6	303958	303963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640295
6058	NC_006624	ATC	2	6	304119	304124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640295
6059	NC_006624	GAG	2	6	304131	304136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640295
6060	NC_006624	GAG	2	6	304148	304153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640295
6061	NC_006624	GTT	2	6	304203	304208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640295
6062	NC_006624	TAT	2	6	304286	304291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640295
6063	NC_006624	ATC	2	6	304401	304406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640295
6064	NC_006624	CCT	2	6	304414	304419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640295
6065	NC_006624	AGGCCG	2	12	304431	304442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	57640295
6066	NC_006624	GAA	2	6	304478	304483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640295
6067	NC_006624	GCTCAA	2	12	304507	304518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57640295
6068	NC_006624	CTC	2	6	304520	304525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640295
6069	NC_006624	TCG	2	6	304617	304622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640295
6070	NC_006624	CCT	2	6	304666	304671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640295
6071	NC_006624	AAC	2	6	304673	304678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640295
6072	NC_006624	GAAC	2	8	304714	304721	50 %	0 %	25 %	25 %	57640296
6073	NC_006624	CCAT	2	8	304726	304733	25 %	25 %	0 %	50 %	57640296
6074	NC_006624	CTT	2	6	304786	304791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640296
6075	NC_006624	TCT	2	6	304864	304869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640296
6076	NC_006624	CTC	2	6	304928	304933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640296
6077	NC_006624	TCC	2	6	304965	304970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640296
6078	NC_006624	TCAACT	2	12	304971	304982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640296
6079	NC_006624	CCT	2	6	305059	305064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640296
6080	NC_006624	CAG	2	6	305098	305103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640296
6081	NC_006624	ATT	2	6	305150	305155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640297
6082	NC_006624	CT	3	6	305203	305208	0 %	50 %	0 %	50 %	57640297
6083	NC_006624	GAGT	2	8	305272	305279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_006624	CCG	2	6	305316	305321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_006624	GTG	2	6	305336	305341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_006624	GGAA	2	8	305384	305391	50 %	0 %	50 %	0 %	57640298
6087	NC_006624	TCG	2	6	305465	305470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640298
6088	NC_006624	CTCG	2	8	305475	305482	0 %	25 %	25 %	50 %	57640298
6089	NC_006624	GAA	2	6	305623	305628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640298
6090	NC_006624	GGC	2	6	305686	305691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640298
6091	NC_006624	GAG	2	6	305824	305829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640298
6092	NC_006624	GTTC	2	8	305886	305893	0 %	50 %	25 %	25 %	57640298
6093	NC_006624	GGA	2	6	305919	305924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640298
6094	NC_006624	CGGGG	2	10	305949	305958	0 %	0 %	80 %	20 %	57640298
6095	NC_006624	CCT	2	6	305994	305999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640298
6096	NC_006624	AAG	2	6	306031	306036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640298
6097	NC_006624	ACT	2	6	306122	306127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640298
6098	NC_006624	GAC	2	6	306145	306150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640298
6099	NC_006624	GA	3	6	306154	306159	50 %	0 %	50 %	0 %	57640298
6100	NC_006624	AAG	2	6	306160	306165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640298
6101	NC_006624	GGA	2	6	306186	306191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640298
6102	NC_006624	ATG	2	6	306195	306200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640298
6103	NC_006624	GGT	2	6	306204	306209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640299
6104	NC_006624	GAG	2	6	306243	306248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640299
6105	NC_006624	TGA	2	6	306308	306313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640299
6106	NC_006624	ATA	2	6	306325	306330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640299
6107	NC_006624	GA	3	6	306419	306424	50 %	0 %	50 %	0 %	57640299
6108	NC_006624	CAC	2	6	306437	306442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640299
6109	NC_006624	AGA	2	6	306488	306493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640299
6110	NC_006624	GAGGG	2	10	306522	306531	20 %	0 %	80 %	0 %	57640299
6111	NC_006624	AAGG	2	8	306551	306558	50 %	0 %	50 %	0 %	57640299
6112	NC_006624	AGG	2	6	306588	306593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640299
6113	NC_006624	ATA	2	6	306603	306608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640299
6114	NC_006624	ACG	2	6	306609	306614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640299
6115	NC_006624	TCA	2	6	306619	306624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640299
6116	NC_006624	AG	3	6	306701	306706	50 %	0 %	50 %	0 %	57640299
6117	NC_006624	CTG	2	6	306840	306845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640299
6118	NC_006624	TGT	2	6	306895	306900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_006624	CAG	2	6	306914	306919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_006624	AAG	2	6	306988	306993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_006624	TAA	2	6	307009	307014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_006624	ATA	2	6	307022	307027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_006624	TTG	2	6	307065	307070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_006624	CTA	2	6	307122	307127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_006624	CA	3	6	307154	307159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_006624	ATG	2	6	307216	307221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_006624	ATA	3	9	307253	307261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_006624	CCGGGA	2	12	307268	307279	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_006624	CCG	2	6	307309	307314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_006624	G	6	6	307352	307357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_006624	CAG	2	6	307408	307413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640300
6132	NC_006624	CAG	2	6	307441	307446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640300
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6137	NC_006624	CCA	2	6	307664	307669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640300
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6141	NC_006624	CCG	2	6	307836	307841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640300
6142	NC_006624	TAA	2	6	307952	307957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640300
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6144	NC_006624	TTGAT	2	10	308172	308181	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_006624	TCA	2	6	308183	308188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6146	NC_006624	TCA	2	6	308209	308214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6147	NC_006624	AGT	2	6	308239	308244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_006624	ATC	2	6	308245	308250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_006624	T	6	6	308279	308284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_006624	GTA	2	6	308286	308291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_006624	AACT	2	8	308309	308316	50 %	25 %	0 %	25 %	57640301
6152	NC_006624	GGA	2	6	308330	308335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640301
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6155	NC_006624	TTA	2	6	308567	308572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640301
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6159	NC_006624	CT	3	6	308900	308905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6162	NC_006624	GTCA	2	8	309142	309149	25 %	25 %	25 %	25 %	57640302
6163	NC_006624	CAG	2	6	309154	309159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640302
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6168	NC_006624	GA	3	6	309349	309354	50 %	0 %	50 %	0 %	57640302
6169	NC_006624	GAT	2	6	309433	309438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6212	NC_006624	TGGG	2	8	311652	311659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6213	NC_006624	G	6	6	311657	311662	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6214	NC_006624	ACTA	2	8	311740	311747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6215	NC_006624	AG	3	6	311759	311764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6216	NC_006624	TCC	2	6	311782	311787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6217	NC_006624	TA	3	6	311828	311833	50 %	50 %	0 %	0 %	57640306
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6231	NC_006624	TC	4	8	312438	312445	0 %	50 %	0 %	50 %	57640307
6232	NC_006624	CCAT	2	8	312493	312500	25 %	25 %	0 %	50 %	57640307
6233	NC_006624	CCT	2	6	312504	312509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6234	NC_006624	CT	3	6	312512	312517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6235	NC_006624	ATC	2	6	312556	312561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6236	NC_006624	TAC	2	6	312649	312654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6237	NC_006624	GTT	2	6	312687	312692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640308
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6241	NC_006624	A	6	6	312807	312812	100 %	0 %	0 %	0 %	57640308
6242	NC_006624	AGG	2	6	312820	312825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640308
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6247	NC_006624	GGA	2	6	313113	313118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640309
6248	NC_006624	CAT	2	6	313449	313454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640310
6249	NC_006624	ACG	2	6	313460	313465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640310
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6251	NC_006624	CCTG	2	8	313489	313496	0 %	25 %	25 %	50 %	57640310
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6495	NC_006624	CAA	2	6	325045	325050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640321
6496	NC_006624	GGTCA	2	10	325104	325113	20 %	20 %	40 %	20 %	57640321
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