MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006462	GAC	2	6	53702	53707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978245
1502	NC_006462	CCGGC	2	10	53723	53732	0 %	0 %	40 %	60 %	55978245
1503	NC_006462	C	6	6	53752	53757	0 %	0 %	0 %	100 %	55978245
1504	NC_006462	AGG	2	6	53781	53786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978245
1505	NC_006462	GCC	2	6	53825	53830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978245
1506	NC_006462	G	6	6	53865	53870	0 %	0 %	100 %	0 %	55978245
1507	NC_006462	G	6	6	53938	53943	0 %	0 %	100 %	0 %	55978245
1508	NC_006462	CCT	3	9	53962	53970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978245
1509	NC_006462	CGG	2	6	53973	53978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978245
1510	NC_006462	GGAGC	2	10	54007	54016	20 %	0 %	60 %	20 %	55978246
1511	NC_006462	CAGGC	2	10	54053	54062	20 %	0 %	40 %	40 %	55978246
1512	NC_006462	T	6	6	54080	54085	0 %	100 %	0 %	0 %	55978246
1513	NC_006462	GGC	2	6	54091	54096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978246
1514	NC_006462	GGC	2	6	54112	54117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978246
1515	NC_006462	CCT	2	6	54184	54189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978246
1516	NC_006462	GGA	2	6	54190	54195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978246
1517	NC_006462	GCC	2	6	54236	54241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978246
1518	NC_006462	CGG	2	6	54317	54322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978246
1519	NC_006462	GAGG	2	8	54398	54405	25 %	0 %	75 %	0 %	55978246
1520	NC_006462	CTC	3	9	54408	54416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978246
1521	NC_006462	GAG	2	6	54423	54428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978246
1522	NC_006462	AGG	2	6	54448	54453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978247
1523	NC_006462	CTC	2	6	54459	54464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978247
1524	NC_006462	CCT	4	12	54524	54535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978247
1525	NC_006462	CCG	2	6	54548	54553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978247
1526	NC_006462	GGA	2	6	54554	54559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978247
1527	NC_006462	GAG	3	9	54621	54629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978247
1528	NC_006462	CCTCCG	2	12	54674	54685	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978247
1529	NC_006462	GAC	2	6	54744	54749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978248
1530	NC_006462	TCC	2	6	54751	54756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978248
1531	NC_006462	CGA	2	6	54776	54781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978248
1532	NC_006462	CCA	2	6	54808	54813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978248
1533	NC_006462	TC	3	6	54934	54939	0 %	50 %	0 %	50 %	55978248
1534	NC_006462	CGAG	2	8	54967	54974	25 %	0 %	50 %	25 %	55978248
1535	NC_006462	ACCT	2	8	54999	55006	25 %	25 %	0 %	50 %	55978248
1536	NC_006462	TCC	4	12	55018	55029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978248
1537	NC_006462	C	7	7	55028	55034	0 %	0 %	0 %	100 %	55978248
1538	NC_006462	GCC	2	6	55056	55061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978248
1539	NC_006462	CAA	2	6	55154	55159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978248
1540	NC_006462	GGA	2	6	55187	55192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978248
1541	NC_006462	GGC	2	6	55193	55198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978248
1542	NC_006462	GC	3	6	55202	55207	0 %	0 %	50 %	50 %	55978248
1543	NC_006462	CTA	2	6	55235	55240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978248
1544	NC_006462	C	7	7	55255	55261	0 %	0 %	0 %	100 %	55978248
1545	NC_006462	CAA	2	6	55298	55303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978248
1546	NC_006462	CCT	2	6	55337	55342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978248
1547	NC_006462	C	6	6	55345	55350	0 %	0 %	0 %	100 %	55978248
1548	NC_006462	TCC	2	6	55414	55419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978248
1549	NC_006462	CTGG	2	8	55448	55455	0 %	25 %	50 %	25 %	55978248
1550	NC_006462	CCT	2	6	55490	55495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978248
1551	NC_006462	AGG	2	6	55509	55514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978248
1552	NC_006462	GAG	2	6	55671	55676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978248
1553	NC_006462	CTC	3	9	55689	55697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978248
1554	NC_006462	GGA	2	6	55703	55708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978248
1555	NC_006462	GGA	2	6	55759	55764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_006462	AAG	2	6	55769	55774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_006462	GGA	2	6	55780	55785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_006462	GCC	2	6	55926	55931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_006462	GTG	2	6	55968	55973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978249
1560	NC_006462	CGGGG	2	10	55974	55983	0 %	0 %	80 %	20 %	55978249
1561	NC_006462	GGC	2	6	56015	56020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978249
1562	NC_006462	GGT	3	9	56087	56095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978249
1563	NC_006462	GGAA	2	8	56134	56141	50 %	0 %	50 %	0 %	55978249
1564	NC_006462	AGG	2	6	56142	56147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1565	NC_006462	CCT	2	6	56186	56191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1566	NC_006462	CCT	2	6	56204	56209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1567	NC_006462	TGG	2	6	56305	56310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978249
1568	NC_006462	CCT	2	6	56360	56365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1569	NC_006462	CAA	2	6	56402	56407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978249
1570	NC_006462	G	6	6	56413	56418	0 %	0 %	100 %	0 %	55978249
1571	NC_006462	CTC	2	6	56448	56453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1572	NC_006462	CCCTCC	2	12	56485	56496	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	55978249
1573	NC_006462	GAG	2	6	56514	56519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1574	NC_006462	CCG	2	6	56542	56547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978249
1575	NC_006462	CTC	2	6	56568	56573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1576	NC_006462	CGC	2	6	56585	56590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978249
1577	NC_006462	GGT	2	6	56630	56635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978249
1578	NC_006462	GAG	2	6	56652	56657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1579	NC_006462	TCC	2	6	56680	56685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1580	NC_006462	GCC	2	6	56692	56697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978249
1581	NC_006462	TCC	2	6	56731	56736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1582	NC_006462	CCT	2	6	56813	56818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1583	NC_006462	GGA	2	6	56834	56839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1584	NC_006462	CGGCCT	2	12	56855	56866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978249
1585	NC_006462	CCA	2	6	56987	56992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978249
1586	NC_006462	CCA	2	6	57014	57019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978249
1587	NC_006462	GGAA	2	8	57020	57027	50 %	0 %	50 %	0 %	55978249
1588	NC_006462	CCT	2	6	57029	57034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1589	NC_006462	CCT	2	6	57053	57058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1590	NC_006462	GGA	2	6	57110	57115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1591	NC_006462	C	6	6	57258	57263	0 %	0 %	0 %	100 %	55978249
1592	NC_006462	TCC	3	9	57271	57279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1593	NC_006462	GGGCG	2	10	57281	57290	0 %	0 %	80 %	20 %	55978249
1594	NC_006462	CCG	2	6	57352	57357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978249
1595	NC_006462	GAG	2	6	57369	57374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1596	NC_006462	CCG	2	6	57389	57394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978249
1597	NC_006462	CCA	2	6	57395	57400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978249
1598	NC_006462	GGA	2	6	57401	57406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1599	NC_006462	C	7	7	57410	57416	0 %	0 %	0 %	100 %	55978249
1600	NC_006462	CCACC	2	10	57473	57482	20 %	0 %	0 %	80 %	55978249
1601	NC_006462	GTG	3	9	57483	57491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978249
1602	NC_006462	GAGGC	2	10	57549	57558	20 %	0 %	60 %	20 %	55978249
1603	NC_006462	GGA	2	6	57575	57580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1604	NC_006462	TGGGGA	2	12	57616	57627	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55978249
1605	NC_006462	CGCC	2	8	57647	57654	0 %	0 %	25 %	75 %	55978249
1606	NC_006462	CCT	2	6	57665	57670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1607	NC_006462	GGC	2	6	57698	57703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978249
1608	NC_006462	AGG	2	6	57706	57711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1609	NC_006462	CCT	2	6	57716	57721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1610	NC_006462	GGCGG	2	10	57725	57734	0 %	0 %	80 %	20 %	55978249
1611	NC_006462	CGG	2	6	57746	57751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978249
1612	NC_006462	GGCCT	2	10	57873	57882	0 %	20 %	40 %	40 %	55978250
1613	NC_006462	CCT	3	9	57898	57906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1614	NC_006462	TCA	2	6	57910	57915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978250
1615	NC_006462	AGG	2	6	58017	58022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1616	NC_006462	TGC	2	6	58044	58049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978250
1617	NC_006462	CAC	2	6	58184	58189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978250
1618	NC_006462	CCT	2	6	58240	58245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1619	NC_006462	AGG	2	6	58317	58322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1620	NC_006462	C	6	6	58370	58375	0 %	0 %	0 %	100 %	55978250
1621	NC_006462	GAG	2	6	58406	58411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1622	NC_006462	GAG	2	6	58442	58447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1623	NC_006462	CCG	2	6	58462	58467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978250
1624	NC_006462	CGT	2	6	58495	58500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978250
1625	NC_006462	GGC	2	6	58562	58567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1626	NC_006462	GCG	2	6	58628	58633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1627	NC_006462	CTC	2	6	58703	58708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1628	NC_006462	CAC	2	6	58718	58723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978250
1629	NC_006462	GGC	2	6	58736	58741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1630	NC_006462	GGC	2	6	58745	58750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1631	NC_006462	GAA	2	6	58787	58792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978250
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1699	NC_006462	GGC	2	6	61783	61788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978252
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1744	NC_006462	GGA	2	6	63840	63845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1745	NC_006462	GAG	3	9	63857	63865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1747	NC_006462	GCCCAG	2	12	63932	63943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1748	NC_006462	GA	3	6	63987	63992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1749	NC_006462	GCC	2	6	64074	64079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978255
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1752	NC_006462	GGGGA	2	10	64101	64110	20 %	0 %	80 %	0 %	55978255
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1755	NC_006462	CCT	2	6	64222	64227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978255
1756	NC_006462	GGAAGC	2	12	64258	64269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55978255
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