MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006462	C	6	6	37283	37288	0 %	0 %	0 %	100 %	55978226
1002	NC_006462	GAG	2	6	37311	37316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978226
1003	NC_006462	GAA	2	6	37332	37337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978226
1004	NC_006462	CCT	2	6	37356	37361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978226
1005	NC_006462	GGC	3	9	37362	37370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978226
1006	NC_006462	GGTG	2	8	37379	37386	0 %	25 %	75 %	0 %	55978226
1007	NC_006462	GAG	2	6	37449	37454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978226
1008	NC_006462	G	6	6	37493	37498	0 %	0 %	100 %	0 %	55978226
1009	NC_006462	GAG	2	6	37503	37508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978226
1010	NC_006462	GCCCC	2	10	37622	37631	0 %	0 %	20 %	80 %	55978227
1011	NC_006462	CAC	3	9	37634	37642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978227
1012	NC_006462	CTC	2	6	37682	37687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978227
1013	NC_006462	ACC	2	6	37734	37739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978227
1014	NC_006462	GAG	2	6	37757	37762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978227
1015	NC_006462	CCT	2	6	37765	37770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978227
1016	NC_006462	GCCC	2	8	37773	37780	0 %	0 %	25 %	75 %	55978227
1017	NC_006462	CCT	2	6	37786	37791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978227
1018	NC_006462	GGC	2	6	37799	37804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978227
1019	NC_006462	CTC	2	6	37824	37829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978227
1020	NC_006462	AGG	2	6	37869	37874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978227
1021	NC_006462	GCGG	2	8	37898	37905	0 %	0 %	75 %	25 %	55978227
1022	NC_006462	GGC	2	6	37976	37981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978227
1023	NC_006462	TCG	2	6	38027	38032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978227
1024	NC_006462	CTC	2	6	38072	38077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978227
1025	NC_006462	GAA	2	6	38118	38123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978228
1026	NC_006462	AAG	2	6	38130	38135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978228
1027	NC_006462	ACC	2	6	38143	38148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978228
1028	NC_006462	CCT	2	6	38351	38356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978228
1029	NC_006462	CCT	2	6	38417	38422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978228
1030	NC_006462	GTCTCC	2	12	38443	38454	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55978228
1031	NC_006462	CCT	2	6	38516	38521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978228
1032	NC_006462	CCT	2	6	38648	38653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978228
1033	NC_006462	GTCTCC	2	12	38674	38685	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55978228
1034	NC_006462	GCC	2	6	38693	38698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978228
1035	NC_006462	CCT	2	6	38747	38752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978228
1036	NC_006462	CTC	2	6	38781	38786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978228
1037	NC_006462	GAGG	2	8	38870	38877	25 %	0 %	75 %	0 %	55978228
1038	NC_006462	GGT	2	6	38886	38891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978228
1039	NC_006462	CCA	2	6	38894	38899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978228
1040	NC_006462	AGG	2	6	38926	38931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978228
1041	NC_006462	AGGA	2	8	38976	38983	50 %	0 %	50 %	0 %	55978229
1042	NC_006462	AGG	3	9	39008	39016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1043	NC_006462	ACC	2	6	39017	39022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978229
1044	NC_006462	C	6	6	39064	39069	0 %	0 %	0 %	100 %	55978229
1045	NC_006462	CAGGC	2	10	39080	39089	20 %	0 %	40 %	40 %	55978229
1046	NC_006462	C	6	6	39096	39101	0 %	0 %	0 %	100 %	55978229
1047	NC_006462	GGC	2	6	39103	39108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978229
1048	NC_006462	GAG	2	6	39109	39114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1049	NC_006462	GAG	2	6	39118	39123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1050	NC_006462	AGG	3	9	39140	39148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1051	NC_006462	AGGGC	2	10	39150	39159	20 %	0 %	60 %	20 %	55978229
1052	NC_006462	AGG	2	6	39164	39169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1053	NC_006462	AGGGCC	2	12	39174	39185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978229
1054	NC_006462	C	8	8	39184	39191	0 %	0 %	0 %	100 %	55978229
1055	NC_006462	GGC	2	6	39199	39204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978229
1056	NC_006462	GGA	2	6	39234	39239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1057	NC_006462	GGA	2	6	39243	39248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1058	NC_006462	AGG	3	9	39275	39283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1059	NC_006462	CCAGGG	2	12	39300	39311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978229
1060	NC_006462	AGG	4	12	39320	39331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1061	NC_006462	C	8	8	39336	39343	0 %	0 %	0 %	100 %	55978229
1062	NC_006462	CGAAGG	2	12	39348	39359	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55978229
1063	NC_006462	CTC	2	6	39394	39399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978229
1064	NC_006462	GAG	2	6	39415	39420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1065	NC_006462	GAG	3	9	39472	39480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1066	NC_006462	GCG	2	6	39494	39499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978229
1067	NC_006462	GGAG	2	8	39509	39516	25 %	0 %	75 %	0 %	55978229
1068	NC_006462	GAG	2	6	39529	39534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1069	NC_006462	AGG	2	6	39551	39556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
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1071	NC_006462	TCC	3	9	39596	39604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978229
1072	NC_006462	GAG	2	6	39637	39642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978229
1073	NC_006462	TCC	2	6	39776	39781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1074	NC_006462	TCCC	2	8	39802	39809	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
1075	NC_006462	GGCG	2	8	39816	39823	0 %	0 %	75 %	25 %	55978230
1076	NC_006462	AGG	2	6	39824	39829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
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1078	NC_006462	AGG	2	6	39884	39889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1079	NC_006462	TCC	2	6	39890	39895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1080	NC_006462	GGC	2	6	39957	39962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978230
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1082	NC_006462	C	6	6	39983	39988	0 %	0 %	0 %	100 %	55978230
1083	NC_006462	TTCC	2	8	40000	40007	0 %	50 %	0 %	50 %	55978230
1084	NC_006462	GGC	2	6	40029	40034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978230
1085	NC_006462	G	7	7	40087	40093	0 %	0 %	100 %	0 %	55978230
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1091	NC_006462	G	6	6	40200	40205	0 %	0 %	100 %	0 %	55978230
1092	NC_006462	CCCG	2	8	40215	40222	0 %	0 %	25 %	75 %	55978230
1093	NC_006462	CCTC	2	8	40245	40252	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
1094	NC_006462	C	6	6	40254	40259	0 %	0 %	0 %	100 %	55978230
1095	NC_006462	CTC	2	6	40267	40272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
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1098	NC_006462	AGG	2	6	40325	40330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1099	NC_006462	AGG	3	9	40343	40351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1100	NC_006462	GCC	2	6	40409	40414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978230
1101	NC_006462	TCC	2	6	40421	40426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1102	NC_006462	GAG	2	6	40438	40443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
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1104	NC_006462	CCCT	2	8	40511	40518	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
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1107	NC_006462	CGGCC	2	10	40656	40665	0 %	0 %	40 %	60 %	55978230
1108	NC_006462	CCTCC	2	10	40699	40708	0 %	20 %	0 %	80 %	55978230
1109	NC_006462	CTC	2	6	40726	40731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1110	NC_006462	CCCTC	2	10	40791	40800	0 %	20 %	0 %	80 %	55978230
1111	NC_006462	AGG	2	6	40817	40822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1112	NC_006462	GAG	2	6	40864	40869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1113	NC_006462	GGGCC	2	10	40870	40879	0 %	0 %	60 %	40 %	55978230
1114	NC_006462	TCC	2	6	40880	40885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1115	NC_006462	CCT	2	6	40899	40904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1116	NC_006462	GAG	2	6	40918	40923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1117	NC_006462	AAGG	2	8	40993	41000	50 %	0 %	50 %	0 %	55978230
1118	NC_006462	C	6	6	41001	41006	0 %	0 %	0 %	100 %	55978230
1119	NC_006462	AGG	2	6	41027	41032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1120	NC_006462	AGGG	2	8	41075	41082	25 %	0 %	75 %	0 %	55978230
1121	NC_006462	TCC	2	6	41087	41092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1122	NC_006462	GGA	2	6	41129	41134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
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1124	NC_006462	GAGG	2	8	41184	41191	25 %	0 %	75 %	0 %	55978230
1125	NC_006462	CGC	2	6	41195	41200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978230
1126	NC_006462	AGG	2	6	41222	41227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1127	NC_006462	CCCA	2	8	41278	41285	25 %	0 %	0 %	75 %	55978230
1128	NC_006462	GAG	2	6	41425	41430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1129	NC_006462	CTC	2	6	41437	41442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978230
1130	NC_006462	AGG	2	6	41444	41449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978230
1131	NC_006462	CCT	2	6	41524	41529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1132	NC_006462	GGA	2	6	41545	41550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1133	NC_006462	TCCCC	2	10	41596	41605	0 %	20 %	0 %	80 %	55978231
1134	NC_006462	AGGTCC	2	12	41613	41624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978231
1135	NC_006462	TGG	2	6	41655	41660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1136	NC_006462	GGT	2	6	41698	41703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1137	NC_006462	C	7	7	41831	41837	0 %	0 %	0 %	100 %	55978231
1138	NC_006462	GCC	2	6	41844	41849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1139	NC_006462	GGCG	2	8	41878	41885	0 %	0 %	75 %	25 %	55978231
1140	NC_006462	CTC	2	6	41924	41929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1141	NC_006462	CAC	2	6	41951	41956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1142	NC_006462	GGGA	2	8	41963	41970	25 %	0 %	75 %	0 %	55978231
1143	NC_006462	GCG	2	6	41982	41987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1144	NC_006462	GCC	3	9	41997	42005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1145	NC_006462	GTG	2	6	42006	42011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1146	NC_006462	CGG	2	6	42031	42036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1147	NC_006462	GAG	2	6	42038	42043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1148	NC_006462	CGC	2	6	42071	42076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1149	NC_006462	AGG	2	6	42090	42095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1150	NC_006462	CCT	2	6	42106	42111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1151	NC_006462	GGT	2	6	42181	42186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978231
1152	NC_006462	CAC	2	6	42200	42205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1153	NC_006462	CCG	2	6	42235	42240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978231
1154	NC_006462	GGC	2	6	42260	42265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1155	NC_006462	GGA	2	6	42274	42279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978231
1156	NC_006462	CCT	2	6	42304	42309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1157	NC_006462	CCA	2	6	42334	42339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
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1159	NC_006462	CCA	3	9	42358	42366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978231
1160	NC_006462	C	6	6	42370	42375	0 %	0 %	0 %	100 %	55978231
1161	NC_006462	GCG	2	6	42408	42413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978231
1162	NC_006462	CCT	2	6	42427	42432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978231
1163	NC_006462	G	7	7	42451	42457	0 %	0 %	100 %	0 %	55978231
1164	NC_006462	GGGA	2	8	42581	42588	25 %	0 %	75 %	0 %	55978232
1165	NC_006462	GGAC	2	8	42602	42609	25 %	0 %	50 %	25 %	55978232
1166	NC_006462	CGG	2	6	42620	42625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978232
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1168	NC_006462	CCT	2	6	42690	42695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978232
1169	NC_006462	CGG	2	6	42710	42715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978232
1170	NC_006462	C	6	6	42731	42736	0 %	0 %	0 %	100 %	55978232
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1172	NC_006462	CCT	2	6	42822	42827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978232
1173	NC_006462	C	6	6	42846	42851	0 %	0 %	0 %	100 %	55978232
1174	NC_006462	G	7	7	42937	42943	0 %	0 %	100 %	0 %	55978232
1175	NC_006462	GCGG	2	8	42948	42955	0 %	0 %	75 %	25 %	55978232
1176	NC_006462	GGA	2	6	42972	42977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978232
1177	NC_006462	GCGGTG	2	12	43000	43011	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55978232
1178	NC_006462	AGG	2	6	43021	43026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978232
1179	NC_006462	GAG	2	6	43054	43059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978232
1180	NC_006462	GC	3	6	43228	43233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1181	NC_006462	AGG	2	6	43260	43265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1182	NC_006462	TCC	2	6	43310	43315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1183	NC_006462	AAGG	2	8	43322	43329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1184	NC_006462	ACC	2	6	43394	43399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978233
1185	NC_006462	GGC	2	6	43401	43406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978233
1186	NC_006462	G	7	7	43471	43477	0 %	0 %	100 %	0 %	55978233
1187	NC_006462	CCT	2	6	43485	43490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1188	NC_006462	CCT	2	6	43509	43514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1189	NC_006462	CGGG	2	8	43515	43522	0 %	0 %	75 %	25 %	55978233
1190	NC_006462	TCC	3	9	43553	43561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1191	NC_006462	TGG	2	6	43565	43570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978233
1192	NC_006462	CTC	2	6	43591	43596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
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1194	NC_006462	CTC	2	6	43633	43638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1195	NC_006462	CTC	3	9	43645	43653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
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1202	NC_006462	GGCCTC	2	12	43939	43950	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978233
1203	NC_006462	CCT	2	6	43956	43961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978233
1204	NC_006462	C	6	6	44009	44014	0 %	0 %	0 %	100 %	55978234
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1209	NC_006462	GCCCTC	2	12	44088	44099	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978234
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1213	NC_006462	TGG	2	6	44197	44202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978234
1214	NC_006462	GAT	2	6	44204	44209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978234
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1217	NC_006462	G	6	6	44294	44299	0 %	0 %	100 %	0 %	55978234
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1229	NC_006462	AGCG	2	8	44631	44638	25 %	0 %	50 %	25 %	55978234
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1237	NC_006462	CTC	2	6	44847	44852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978234
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1239	NC_006462	AGG	2	6	44884	44889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978234
1240	NC_006462	CCGC	2	8	44905	44912	0 %	0 %	25 %	75 %	55978234
1241	NC_006462	AGA	2	6	44933	44938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978234
1242	NC_006462	TTC	2	6	44952	44957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978234
1243	NC_006462	CGC	2	6	45059	45064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978234
1244	NC_006462	CCA	2	6	45123	45128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1245	NC_006462	GGGC	2	8	45142	45149	0 %	0 %	75 %	25 %	55978235
1246	NC_006462	AGG	2	6	45155	45160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978235
1247	NC_006462	C	6	6	45206	45211	0 %	0 %	0 %	100 %	55978235
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1249	NC_006462	GAT	2	6	45234	45239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978235
1250	NC_006462	CCG	2	6	45248	45253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978235
1251	NC_006462	TGG	2	6	45338	45343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978235
1252	NC_006462	GAT	2	6	45351	45356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978235
1253	NC_006462	AGGCTC	2	12	45379	45390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978235
1254	NC_006462	GGT	2	6	45402	45407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978235
1255	NC_006462	CTC	2	6	45412	45417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978235
1256	NC_006462	GGT	2	6	45429	45434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978235
1257	NC_006462	G	6	6	45453	45458	0 %	0 %	100 %	0 %	55978235
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1259	NC_006462	GTGGGG	2	12	45520	45531	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	55978235
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1383	NC_006462	C	6	6	50015	50020	0 %	0 %	0 %	100 %	55978240
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1385	NC_006462	CGG	2	6	50032	50037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978240
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