MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006462	GAG	2	6	229148	229153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978407
6002	NC_006462	GAG	2	6	229169	229174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978407
6003	NC_006462	GCGG	2	8	229195	229202	0 %	0 %	75 %	25 %	55978407
6004	NC_006462	GCTCC	2	10	229205	229214	0 %	20 %	20 %	60 %	55978407
6005	NC_006462	CGG	2	6	229267	229272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978407
6006	NC_006462	GC	3	6	229311	229316	0 %	0 %	50 %	50 %	55978407
6007	NC_006462	GTA	2	6	229511	229516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978407
6008	NC_006462	GAG	2	6	229571	229576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978407
6009	NC_006462	ACC	2	6	229587	229592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978407
6010	NC_006462	TCC	2	6	229614	229619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978407
6011	NC_006462	CGG	2	6	229662	229667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978407
6012	NC_006462	C	6	6	229683	229688	0 %	0 %	0 %	100 %	55978407
6013	NC_006462	G	6	6	229804	229809	0 %	0 %	100 %	0 %	55978408
6014	NC_006462	G	6	6	229823	229828	0 %	0 %	100 %	0 %	55978408
6015	NC_006462	GCC	2	6	229865	229870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978408
6016	NC_006462	CGG	2	6	229910	229915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978408
6017	NC_006462	GTA	2	6	229930	229935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978408
6018	NC_006462	GGCCC	2	10	230032	230041	0 %	0 %	40 %	60 %	55978408
6019	NC_006462	C	6	6	230067	230072	0 %	0 %	0 %	100 %	55978408
6020	NC_006462	GCC	2	6	230073	230078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978408
6021	NC_006462	CCA	2	6	230091	230096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978408
6022	NC_006462	AAG	2	6	230101	230106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978408
6023	NC_006462	CTC	2	6	230140	230145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978408
6024	NC_006462	GGT	3	9	230193	230201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978408
6025	NC_006462	ACC	2	6	230255	230260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978408
6026	NC_006462	ACCT	2	8	230318	230325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_006462	CTT	2	6	230435	230440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_006462	GCC	2	6	230453	230458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_006462	GGT	2	6	230465	230470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978409
6030	NC_006462	CT	3	6	230530	230535	0 %	50 %	0 %	50 %	55978409
6031	NC_006462	CGG	2	6	230595	230600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978409
6032	NC_006462	GGA	2	6	230608	230613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978409
6033	NC_006462	G	6	6	230638	230643	0 %	0 %	100 %	0 %	55978409
6034	NC_006462	AGG	2	6	230644	230649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978409
6035	NC_006462	GCC	2	6	230683	230688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978409
6036	NC_006462	CTTC	2	8	230696	230703	0 %	50 %	0 %	50 %	55978409
6037	NC_006462	CTT	2	6	230706	230711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978409
6038	NC_006462	CGC	2	6	230747	230752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978409
6039	NC_006462	GGC	2	6	230767	230772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978409
6040	NC_006462	C	6	6	230849	230854	0 %	0 %	0 %	100 %	55978409
6041	NC_006462	GAG	2	6	230907	230912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978409
6042	NC_006462	C	6	6	231043	231048	0 %	0 %	0 %	100 %	55978409
6043	NC_006462	C	6	6	231062	231067	0 %	0 %	0 %	100 %	55978409
6044	NC_006462	GCGG	2	8	231080	231087	0 %	0 %	75 %	25 %	55978409
6045	NC_006462	GCG	2	6	231104	231109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978409
6046	NC_006462	TGG	2	6	231205	231210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978409
6047	NC_006462	CGG	2	6	231228	231233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978409
6048	NC_006462	CGC	2	6	231342	231347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978409
6049	NC_006462	CCG	2	6	231422	231427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978409
6050	NC_006462	CGC	2	6	231432	231437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978409
6051	NC_006462	CACCC	2	10	231438	231447	20 %	0 %	0 %	80 %	55978409
6052	NC_006462	GGT	2	6	231449	231454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978409
6053	NC_006462	GGA	2	6	231455	231460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978409
6054	NC_006462	CT	3	6	231501	231506	0 %	50 %	0 %	50 %	55978409
6055	NC_006462	GAG	2	6	231564	231569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978409
6056	NC_006462	GGC	2	6	231574	231579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978409
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6058	NC_006462	GGC	2	6	231608	231613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978409
6059	NC_006462	AAG	2	6	231780	231785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978410
6060	NC_006462	CT	3	6	231878	231883	0 %	50 %	0 %	50 %	55978410
6061	NC_006462	GTG	2	6	232007	232012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978410
6062	NC_006462	CTT	2	6	232133	232138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978410
6063	NC_006462	CGGG	2	8	232165	232172	0 %	0 %	75 %	25 %	55978410
6064	NC_006462	GTGCCC	2	12	232190	232201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978410
6065	NC_006462	CGC	2	6	232225	232230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978410
6066	NC_006462	CGC	2	6	232292	232297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978410
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6069	NC_006462	G	7	7	232403	232409	0 %	0 %	100 %	0 %	55978410
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6071	NC_006462	GAA	2	6	232427	232432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978410
6072	NC_006462	GGA	2	6	232441	232446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978410
6073	NC_006462	GCG	2	6	232465	232470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978410
6074	NC_006462	GAC	2	6	232592	232597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978410
6075	NC_006462	CAA	2	6	232723	232728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978410
6076	NC_006462	GAG	2	6	232745	232750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978410
6077	NC_006462	CTC	2	6	232751	232756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978410
6078	NC_006462	CCT	2	6	232759	232764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978410
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6081	NC_006462	CCT	2	6	232996	233001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978410
6082	NC_006462	GGGGA	2	10	233018	233027	20 %	0 %	80 %	0 %	55978410
6083	NC_006462	GGC	2	6	233065	233070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978410
6084	NC_006462	CGCC	2	8	233080	233087	0 %	0 %	25 %	75 %	55978410
6085	NC_006462	G	6	6	233153	233158	0 %	0 %	100 %	0 %	55978410
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6088	NC_006462	CCGG	2	8	233335	233342	0 %	0 %	50 %	50 %	55978410
6089	NC_006462	GCG	2	6	233349	233354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978410
6090	NC_006462	GGCGC	2	10	233428	233437	0 %	0 %	60 %	40 %	55978410
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6093	NC_006462	GGCC	2	8	233557	233564	0 %	0 %	50 %	50 %	55978410
6094	NC_006462	TGGG	2	8	233585	233592	0 %	25 %	75 %	0 %	55978410
6095	NC_006462	GGT	2	6	233641	233646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978410
6096	NC_006462	GCC	2	6	233693	233698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978410
6097	NC_006462	ACC	2	6	233700	233705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978410
6098	NC_006462	GGCG	2	8	233734	233741	0 %	0 %	75 %	25 %	55978410
6099	NC_006462	TCT	2	6	233748	233753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978410
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6101	NC_006462	CTC	2	6	233771	233776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978410
6102	NC_006462	AGG	2	6	233778	233783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978410
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6104	NC_006462	GGA	2	6	233806	233811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978410
6105	NC_006462	GAC	2	6	233843	233848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978410
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6107	NC_006462	GC	3	6	233876	233881	0 %	0 %	50 %	50 %	55978410
6108	NC_006462	AGG	2	6	233967	233972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978410
6109	NC_006462	C	6	6	234046	234051	0 %	0 %	0 %	100 %	55978411
6110	NC_006462	AGG	2	6	234052	234057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978411
6111	NC_006462	GTGAAC	2	12	234081	234092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55978411
6112	NC_006462	GAGC	2	8	234122	234129	25 %	0 %	50 %	25 %	55978411
6113	NC_006462	CCA	2	6	234145	234150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978411
6114	NC_006462	GCG	2	6	234167	234172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978411
6115	NC_006462	CCT	2	6	234176	234181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978411
6116	NC_006462	GCA	2	6	234206	234211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978411
6117	NC_006462	CCT	2	6	234227	234232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978411
6118	NC_006462	GCG	2	6	234308	234313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978411
6119	NC_006462	CAC	2	6	234329	234334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978411
6120	NC_006462	CGGC	2	8	234341	234348	0 %	0 %	50 %	50 %	55978411
6121	NC_006462	AGC	2	6	234397	234402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978411
6122	NC_006462	GGC	2	6	234460	234465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978411
6123	NC_006462	CCT	2	6	234482	234487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978411
6124	NC_006462	CTCGG	2	10	234568	234577	0 %	20 %	40 %	40 %	55978411
6125	NC_006462	GCG	2	6	234665	234670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978411
6126	NC_006462	GGT	2	6	234671	234676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978411
6127	NC_006462	GGA	2	6	234734	234739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978411
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6129	NC_006462	GGA	3	9	234824	234832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978411
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6140	NC_006462	AGGG	2	8	235193	235200	25 %	0 %	75 %	0 %	55978412
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6213	NC_006462	CAGG	2	8	238700	238707	25 %	0 %	50 %	25 %	55978414
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6222	NC_006462	C	6	6	239074	239079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6223	NC_006462	GTA	2	6	239256	239261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6224	NC_006462	CAT	2	6	239277	239282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6226	NC_006462	G	6	6	239335	239340	0 %	0 %	100 %	0 %	55978415
6227	NC_006462	TCT	2	6	239359	239364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978415
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6233	NC_006462	CCT	2	6	239656	239661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978415
6234	NC_006462	CTT	2	6	239677	239682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978415
6235	NC_006462	TCC	2	6	239715	239720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978415
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6239	NC_006462	TCCCA	2	10	239907	239916	20 %	20 %	0 %	60 %	55978415
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6242	NC_006462	GCC	2	6	240183	240188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978415
6243	NC_006462	CTGA	2	8	240194	240201	25 %	25 %	25 %	25 %	55978415
6244	NC_006462	CGG	2	6	240205	240210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978415
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6248	NC_006462	GTA	2	6	240350	240355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978415
6249	NC_006462	AAG	2	6	240384	240389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978415
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6251	NC_006462	C	6	6	240511	240516	0 %	0 %	0 %	100 %	55978415
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