MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49022	NC_006461	GAG	2	6	1805887	1805892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981893
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49120	NC_006461	CCCG	2	8	1809409	1809416	0 %	0 %	25 %	75 %	55981897
49121	NC_006461	GGA	2	6	1809417	1809422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981897
49122	NC_006461	GGT	2	6	1809465	1809470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981897
49123	NC_006461	GGC	2	6	1809552	1809557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981897
49124	NC_006461	GGA	2	6	1809570	1809575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981897
49125	NC_006461	ACG	2	6	1809620	1809625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981897
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49128	NC_006461	AGG	2	6	1809844	1809849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981898
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49130	NC_006461	CGC	2	6	1809866	1809871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981898
49131	NC_006461	CTA	2	6	1809881	1809886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981898
49132	NC_006461	CTC	2	6	1809891	1809896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49133	NC_006461	CTC	2	6	1809909	1809914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49134	NC_006461	TCC	2	6	1809916	1809921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49135	NC_006461	TGG	2	6	1809922	1809927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981898
49136	NC_006461	CTTC	2	8	1809938	1809945	0 %	50 %	0 %	50 %	55981898
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49138	NC_006461	CGCC	2	8	1810016	1810023	0 %	0 %	25 %	75 %	55981898
49139	NC_006461	CCT	2	6	1810040	1810045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49140	NC_006461	CCT	4	12	1810091	1810102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
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49145	NC_006461	TCC	2	6	1810228	1810233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
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49149	NC_006461	TCC	2	6	1810339	1810344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49150	NC_006461	CTC	2	6	1810365	1810370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49151	NC_006461	CCCT	2	8	1810393	1810400	0 %	25 %	0 %	75 %	55981898
49152	NC_006461	CGC	2	6	1810406	1810411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981898
49153	NC_006461	CGGGG	2	10	1810412	1810421	0 %	0 %	80 %	20 %	55981898
49154	NC_006461	CTC	2	6	1810431	1810436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49155	NC_006461	CTC	2	6	1810467	1810472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49156	NC_006461	CTC	2	6	1810491	1810496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49157	NC_006461	TCC	2	6	1810546	1810551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49158	NC_006461	CTC	2	6	1810557	1810562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981898
49159	NC_006461	GGC	2	6	1810574	1810579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981898
49160	NC_006461	GC	3	6	1810653	1810658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49161	NC_006461	CCGCGG	2	12	1810669	1810680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49162	NC_006461	CTCC	2	8	1810714	1810721	0 %	25 %	0 %	75 %	55981899
49163	NC_006461	AGA	2	6	1810735	1810740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981899
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49165	NC_006461	GCCC	2	8	1810780	1810787	0 %	0 %	25 %	75 %	55981899
49166	NC_006461	CTG	3	9	1810832	1810840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981899
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49168	NC_006461	GAG	2	6	1810886	1810891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981899
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49175	NC_006461	GGGC	2	8	1811147	1811154	0 %	0 %	75 %	25 %	55981899
49176	NC_006461	GAT	2	6	1811192	1811197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981899
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49179	NC_006461	ATG	2	6	1811331	1811336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981899
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49192	NC_006461	CCT	2	6	1812166	1812171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981900
49193	NC_006461	CCAC	2	8	1812178	1812185	25 %	0 %	0 %	75 %	55981900
49194	NC_006461	GGTG	2	8	1812205	1812212	0 %	25 %	75 %	0 %	55981900
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49201	NC_006461	CTC	2	6	1812386	1812391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981900
49202	NC_006461	TGGGCT	2	12	1812400	1812411	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55981900
49203	NC_006461	C	6	6	1812417	1812422	0 %	0 %	0 %	100 %	55981900
49204	NC_006461	CCT	2	6	1812475	1812480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981900
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49208	NC_006461	GAA	2	6	1812667	1812672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981901
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49212	NC_006461	GCG	2	6	1812764	1812769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981901
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49219	NC_006461	GGCC	2	8	1813044	1813051	0 %	0 %	50 %	50 %	55981901
49220	NC_006461	TCC	2	6	1813098	1813103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981901
49221	NC_006461	CTC	3	9	1813172	1813180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981902
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49224	NC_006461	G	6	6	1813289	1813294	0 %	0 %	100 %	0 %	55981902
49225	NC_006461	TGG	2	6	1813314	1813319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981902
49226	NC_006461	GGC	2	6	1813322	1813327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981902
49227	NC_006461	GCC	3	9	1813389	1813397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981902
49228	NC_006461	TGGGCC	2	12	1813413	1813424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981902
49229	NC_006461	GGGC	2	8	1813429	1813436	0 %	0 %	75 %	25 %	55981902
49230	NC_006461	CCT	2	6	1813444	1813449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981902
49231	NC_006461	TCCGC	2	10	1813456	1813465	0 %	20 %	20 %	60 %	55981902
49232	NC_006461	GA	3	6	1813471	1813476	50 %	0 %	50 %	0 %	55981902
49233	NC_006461	GCC	2	6	1813496	1813501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981902
49234	NC_006461	CAC	3	9	1813505	1813513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981902
49235	NC_006461	GGC	2	6	1813514	1813519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981902
49236	NC_006461	G	6	6	1813546	1813551	0 %	0 %	100 %	0 %	55981902
49237	NC_006461	C	6	6	1813614	1813619	0 %	0 %	0 %	100 %	55981902
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49239	NC_006461	CCG	2	6	1813692	1813697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981902
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49347	NC_006461	CGTACC	2	12	1818151	1818162	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55981907
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49500	NC_006461	G	6	6	1823504	1823509	0 %	0 %	100 %	0 %	55981914

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