MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_006461	CAC	2	6	1657304	1657309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981737
45003	NC_006461	GAG	2	6	1657349	1657354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981737
45004	NC_006461	C	7	7	1657366	1657372	0 %	0 %	0 %	100 %	55981737
45005	NC_006461	C	6	6	1657386	1657391	0 %	0 %	0 %	100 %	55981737
45006	NC_006461	CGGG	2	8	1657542	1657549	0 %	0 %	75 %	25 %	55981737
45007	NC_006461	GGT	3	9	1657555	1657563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981737
45008	NC_006461	CCT	2	6	1657716	1657721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981738
45009	NC_006461	GGGCCT	2	12	1657794	1657805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981738
45010	NC_006461	GA	3	6	1657835	1657840	50 %	0 %	50 %	0 %	55981738
45011	NC_006461	ACC	2	6	1657841	1657846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981738
45012	NC_006461	CGG	2	6	1657851	1657856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981738
45013	NC_006461	GGAC	2	8	1657887	1657894	25 %	0 %	50 %	25 %	55981738
45014	NC_006461	CCA	2	6	1657953	1657958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981738
45015	NC_006461	AGGT	2	8	1658039	1658046	25 %	25 %	50 %	0 %	55981738
45016	NC_006461	TTC	2	6	1658061	1658066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981738
45017	NC_006461	GCCC	2	8	1658206	1658213	0 %	0 %	25 %	75 %	55981739
45018	NC_006461	CCA	3	9	1658290	1658298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981739
45019	NC_006461	ACC	3	9	1658334	1658342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981739
45020	NC_006461	CGT	2	6	1658395	1658400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981739
45021	NC_006461	GCG	2	6	1658432	1658437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981739
45022	NC_006461	AGG	2	6	1658446	1658451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981739
45023	NC_006461	CGG	2	6	1658482	1658487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981739
45024	NC_006461	TTC	2	6	1658547	1658552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981739
45025	NC_006461	GCCCC	2	10	1658595	1658604	0 %	0 %	20 %	80 %	55981739
45026	NC_006461	GCCC	2	8	1658608	1658615	0 %	0 %	25 %	75 %	55981739
45027	NC_006461	CGGCG	2	10	1658656	1658665	0 %	0 %	60 %	40 %	55981739
45028	NC_006461	CCT	2	6	1658683	1658688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981739
45029	NC_006461	CTT	2	6	1658705	1658710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981739
45030	NC_006461	CCT	2	6	1658722	1658727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981739
45031	NC_006461	CCAGGG	2	12	1658761	1658772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981739
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45033	NC_006461	AGAGGT	2	12	1658845	1658856	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55981739
45034	NC_006461	C	6	6	1658930	1658935	0 %	0 %	0 %	100 %	55981739
45035	NC_006461	GAG	3	9	1658948	1658956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981739
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45037	NC_006461	ACC	2	6	1658996	1659001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45038	NC_006461	C	6	6	1659000	1659005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45039	NC_006461	GCGCCC	2	12	1659016	1659027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45040	NC_006461	GGC	2	6	1659041	1659046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45041	NC_006461	CCT	2	6	1659147	1659152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981740
45042	NC_006461	CCT	2	6	1659189	1659194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981740
45043	NC_006461	GGT	2	6	1659210	1659215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981740
45044	NC_006461	CCAAGG	2	12	1659219	1659230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981740
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45047	NC_006461	CTTCCG	2	12	1659304	1659315	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55981740
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45049	NC_006461	CAC	2	6	1659370	1659375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981740
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45052	NC_006461	C	8	8	1659450	1659457	0 %	0 %	0 %	100 %	55981740
45053	NC_006461	GCC	2	6	1659491	1659496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981740
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45055	NC_006461	GCCAGG	2	12	1659560	1659571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981740
45056	NC_006461	CCGC	2	8	1659648	1659655	0 %	0 %	25 %	75 %	55981740
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45061	NC_006461	C	6	6	1659771	1659776	0 %	0 %	0 %	100 %	55981740
45062	NC_006461	CGG	2	6	1659813	1659818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981740
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45085	NC_006461	AGGCG	2	10	1661061	1661070	20 %	0 %	60 %	20 %	55981742
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45103	NC_006461	GGCCC	2	10	1661662	1661671	0 %	0 %	40 %	60 %	55981742
45104	NC_006461	CGG	2	6	1661727	1661732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981742
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45107	NC_006461	CCCG	2	8	1661847	1661854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45108	NC_006461	CTT	2	6	1661923	1661928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45109	NC_006461	GGCG	2	8	1661937	1661944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45110	NC_006461	GAG	3	9	1661984	1661992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981743
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45120	NC_006461	GAG	2	6	1662266	1662271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981743
45121	NC_006461	AAG	2	6	1662303	1662308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981743
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45230	NC_006461	CG	4	8	1666252	1666259	0 %	0 %	50 %	50 %	55981749
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45235	NC_006461	CCA	2	6	1666395	1666400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981749
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45340	NC_006461	GCC	2	6	1670608	1670613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981754
45341	NC_006461	GAG	2	6	1670632	1670637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981754
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45343	NC_006461	ACC	2	6	1670747	1670752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45344	NC_006461	GCTG	2	8	1670802	1670809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45345	NC_006461	GGTTT	2	10	1670861	1670870	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45346	NC_006461	AGG	2	6	1670874	1670879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45347	NC_006461	CTC	3	9	1670895	1670903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981755
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45350	NC_006461	G	6	6	1670993	1670998	0 %	0 %	100 %	0 %	55981755
45351	NC_006461	TGGGC	2	10	1671028	1671037	0 %	20 %	60 %	20 %	55981755
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45353	NC_006461	GGT	2	6	1671167	1671172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981755
45354	NC_006461	GCCC	2	8	1671182	1671189	0 %	0 %	25 %	75 %	55981755
45355	NC_006461	CCT	2	6	1671263	1671268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981755
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45357	NC_006461	C	8	8	1671386	1671393	0 %	0 %	0 %	100 %	55981755
45358	NC_006461	CCT	2	6	1671413	1671418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981755
45359	NC_006461	GGA	2	6	1671431	1671436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981755
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45361	NC_006461	CTC	2	6	1671528	1671533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981755
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45479	NC_006461	C	6	6	1676039	1676044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45480	NC_006461	CGC	2	6	1676056	1676061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45481	NC_006461	GC	4	8	1676137	1676144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45482	NC_006461	GGCCCT	2	12	1676177	1676188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981763
45483	NC_006461	ACG	2	6	1676197	1676202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981763
45484	NC_006461	AAG	2	6	1676205	1676210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981763
45485	NC_006461	TGG	2	6	1676218	1676223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981763
45486	NC_006461	AGG	2	6	1676299	1676304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981763
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45490	NC_006461	TGG	2	6	1676500	1676505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981763
45491	NC_006461	CGG	2	6	1676506	1676511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981763
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45496	NC_006461	GCC	2	6	1676639	1676644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981764
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