MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44503	NC_006461	CCT	2	6	1638993	1638998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981719
44504	NC_006461	GAG	2	6	1639015	1639020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981719
44505	NC_006461	G	6	6	1639041	1639046	0 %	0 %	100 %	0 %	55981719
44506	NC_006461	GAG	2	6	1639069	1639074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981719
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44508	NC_006461	CCGC	2	8	1639151	1639158	0 %	0 %	25 %	75 %	55981719
44509	NC_006461	CAC	2	6	1639188	1639193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981720
44510	NC_006461	CCT	2	6	1639310	1639315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981720
44511	NC_006461	CGC	2	6	1639397	1639402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981720
44512	NC_006461	TCA	2	6	1639403	1639408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981720
44513	NC_006461	GGA	2	6	1639457	1639462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981720
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44515	NC_006461	GAG	2	6	1639671	1639676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981720
44516	NC_006461	C	7	7	1639683	1639689	0 %	0 %	0 %	100 %	55981720
44517	NC_006461	GTG	2	6	1639722	1639727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981720
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44520	NC_006461	GCG	2	6	1639801	1639806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981720
44521	NC_006461	GCG	2	6	1639809	1639814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981720
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44536	NC_006461	TTGG	2	8	1640312	1640319	0 %	50 %	50 %	0 %	55981721
44537	NC_006461	G	6	6	1640326	1640331	0 %	0 %	100 %	0 %	55981721
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44540	NC_006461	GAG	2	6	1640447	1640452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981721
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44543	NC_006461	AGA	2	6	1640536	1640541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981721
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44546	NC_006461	GGGCCA	2	12	1640596	1640607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981721
44547	NC_006461	CGG	3	9	1640616	1640624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981721
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44602	NC_006461	TCAA	2	8	1642406	1642413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44603	NC_006461	GCC	2	6	1642436	1642441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44606	NC_006461	CCG	2	6	1642519	1642524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981723
44607	NC_006461	CCGG	2	8	1642621	1642628	0 %	0 %	50 %	50 %	55981723
44608	NC_006461	GAA	2	6	1642646	1642651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981723
44609	NC_006461	GGGC	2	8	1642681	1642688	0 %	0 %	75 %	25 %	55981723
44610	NC_006461	GCC	2	6	1642718	1642723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981723
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44614	NC_006461	CCCG	2	8	1642843	1642850	0 %	0 %	25 %	75 %	55981723
44615	NC_006461	GTA	2	6	1642856	1642861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981723
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44617	NC_006461	C	6	6	1642992	1642997	0 %	0 %	0 %	100 %	55981723
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44861	NC_006461	CCT	3	9	1651645	1651653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981733
44862	NC_006461	CAC	2	6	1651658	1651663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981733
44863	NC_006461	TGT	2	6	1651669	1651674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981733
44864	NC_006461	G	7	7	1651766	1651772	0 %	0 %	100 %	0 %	55981733
44865	NC_006461	TCC	2	6	1651791	1651796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981733
44866	NC_006461	TGGGC	2	10	1651798	1651807	0 %	20 %	60 %	20 %	55981733
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44868	NC_006461	CTC	3	9	1651817	1651825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981733
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44879	NC_006461	GC	3	6	1652213	1652218	0 %	0 %	50 %	50 %	55981733
44880	NC_006461	G	6	6	1652242	1652247	0 %	0 %	100 %	0 %	55981733
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44884	NC_006461	GGCC	2	8	1652325	1652332	0 %	0 %	50 %	50 %	55981733
44885	NC_006461	CTC	2	6	1652351	1652356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981733
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44889	NC_006461	GGGC	2	8	1652446	1652453	0 %	0 %	75 %	25 %	55981733
44890	NC_006461	GGC	2	6	1652458	1652463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981733
44891	NC_006461	CGGG	2	8	1652475	1652482	0 %	0 %	75 %	25 %	55981733
44892	NC_006461	GCC	2	6	1652487	1652492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981733
44893	NC_006461	CCT	2	6	1652527	1652532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981733
44894	NC_006461	CCG	2	6	1652593	1652598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981733
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44896	NC_006461	GCG	2	6	1652665	1652670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981733
44897	NC_006461	GCG	2	6	1652727	1652732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981733
44898	NC_006461	GAG	3	9	1652753	1652761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981733
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44900	NC_006461	GGA	2	6	1652794	1652799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981733
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44910	NC_006461	AGG	2	6	1653033	1653038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981733
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44912	NC_006461	GGA	2	6	1653181	1653186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981733
44913	NC_006461	GGT	2	6	1653206	1653211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981733
44914	NC_006461	GGA	2	6	1653217	1653222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981733
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44918	NC_006461	GCCC	2	8	1653454	1653461	0 %	0 %	25 %	75 %	55981733
44919	NC_006461	CCA	2	6	1653463	1653468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981733
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44923	NC_006461	CCT	2	6	1653616	1653621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981733
44924	NC_006461	CCT	2	6	1653639	1653644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44925	NC_006461	CTC	2	6	1653677	1653682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981734
44926	NC_006461	G	6	6	1653683	1653688	0 %	0 %	100 %	0 %	55981734
44927	NC_006461	GAG	2	6	1653707	1653712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981734
44928	NC_006461	CACCC	2	10	1653879	1653888	20 %	0 %	0 %	80 %	55981734
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44932	NC_006461	CGG	2	6	1654081	1654086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981734
44933	NC_006461	GCC	2	6	1654162	1654167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981734
44934	NC_006461	GCT	2	6	1654174	1654179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981734
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44937	NC_006461	TACAC	2	10	1654342	1654351	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44938	NC_006461	GCC	2	6	1654387	1654392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44939	NC_006461	CTTCGC	2	12	1654415	1654426	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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44944	NC_006461	GCCC	2	8	1654791	1654798	0 %	0 %	25 %	75 %	55981735
44945	NC_006461	GGC	2	6	1654804	1654809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981735
44946	NC_006461	CGGGC	2	10	1654834	1654843	0 %	0 %	60 %	40 %	55981735
44947	NC_006461	GGCG	2	8	1654882	1654889	0 %	0 %	75 %	25 %	55981735
44948	NC_006461	GC	3	6	1654899	1654904	0 %	0 %	50 %	50 %	55981735
44949	NC_006461	CCCGGA	2	12	1654912	1654923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55981735
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44951	NC_006461	TCC	2	6	1655005	1655010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981735
44952	NC_006461	GGA	2	6	1655054	1655059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981735
44953	NC_006461	CTT	2	6	1655078	1655083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981735
44954	NC_006461	GACCCG	2	12	1655108	1655119	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55981735
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44956	NC_006461	CCCG	2	8	1655230	1655237	0 %	0 %	25 %	75 %	55981735
44957	NC_006461	C	6	6	1655257	1655262	0 %	0 %	0 %	100 %	55981735
44958	NC_006461	GCG	2	6	1655299	1655304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981735
44959	NC_006461	C	6	6	1655311	1655316	0 %	0 %	0 %	100 %	55981735
44960	NC_006461	GTA	2	6	1655324	1655329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981735
44961	NC_006461	CGTC	2	8	1655338	1655345	0 %	25 %	25 %	50 %	55981735
44962	NC_006461	TGA	2	6	1655371	1655376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981735
44963	NC_006461	GCG	2	6	1655465	1655470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981735
44964	NC_006461	TCC	2	6	1655493	1655498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981735
44965	NC_006461	GTAGCG	2	12	1655519	1655530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55981735
44966	NC_006461	GGA	2	6	1655569	1655574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981735
44967	NC_006461	GAT	2	6	1655777	1655782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981735
44968	NC_006461	GCG	2	6	1655953	1655958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981736
44969	NC_006461	CTC	2	6	1656001	1656006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981736
44970	NC_006461	AGG	2	6	1656017	1656022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981736
44971	NC_006461	CCT	2	6	1656024	1656029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981736
44972	NC_006461	CCA	2	6	1656096	1656101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981736
44973	NC_006461	GGA	2	6	1656111	1656116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981736
44974	NC_006461	CGG	2	6	1656144	1656149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981736
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44976	NC_006461	GGC	2	6	1656184	1656189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981736
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44978	NC_006461	C	6	6	1656278	1656283	0 %	0 %	0 %	100 %	55981736
44979	NC_006461	CGG	2	6	1656303	1656308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981736
44980	NC_006461	GGC	2	6	1656318	1656323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981736
44981	NC_006461	CGG	2	6	1656372	1656377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981736
44982	NC_006461	CAC	4	12	1656541	1656552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981736
44983	NC_006461	C	7	7	1656577	1656583	0 %	0 %	0 %	100 %	55981736
44984	NC_006461	GTC	2	6	1656595	1656600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981736
44985	NC_006461	GTG	2	6	1656665	1656670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981736
44986	NC_006461	TCCT	2	8	1656731	1656738	0 %	50 %	0 %	50 %	55981736
44987	NC_006461	CTC	2	6	1656754	1656759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981736
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44989	NC_006461	GGA	2	6	1656895	1656900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981737
44990	NC_006461	CTC	2	6	1656911	1656916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981737
44991	NC_006461	GGC	2	6	1656922	1656927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981737
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44993	NC_006461	GGC	2	6	1657082	1657087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981737
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