MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43503	NC_006461	CGC	2	6	1601608	1601613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981675
43504	NC_006461	CTC	2	6	1601645	1601650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981675
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43509	NC_006461	G	6	6	1601788	1601793	0 %	0 %	100 %	0 %	55981676
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43620	NC_006461	TCC	3	9	1606053	1606061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43621	NC_006461	TCC	2	6	1606065	1606070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43622	NC_006461	TCC	2	6	1606095	1606100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43623	NC_006461	CTC	2	6	1606103	1606108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43624	NC_006461	CTC	2	6	1606145	1606150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43625	NC_006461	TGG	3	9	1606173	1606181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981680
43626	NC_006461	ACC	2	6	1606203	1606208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981680
43627	NC_006461	CGGC	2	8	1606297	1606304	0 %	0 %	50 %	50 %	55981680
43628	NC_006461	CTC	2	6	1606358	1606363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43629	NC_006461	CCA	2	6	1606371	1606376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981680
43630	NC_006461	GTG	2	6	1606406	1606411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981680
43631	NC_006461	TATG	2	8	1606430	1606437	25 %	50 %	25 %	0 %	55981680
43632	NC_006461	CGT	2	6	1606478	1606483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981680
43633	NC_006461	GGA	2	6	1606495	1606500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981680
43634	NC_006461	CGGG	2	8	1606517	1606524	0 %	0 %	75 %	25 %	55981680
43635	NC_006461	CCT	2	6	1606525	1606530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43636	NC_006461	GAC	2	6	1606538	1606543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981680
43637	NC_006461	GCC	2	6	1606593	1606598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981680
43638	NC_006461	CGC	2	6	1606600	1606605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981680
43639	NC_006461	CCG	2	6	1606612	1606617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981680
43640	NC_006461	CCG	2	6	1606621	1606626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981680
43641	NC_006461	CCT	2	6	1606660	1606665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43642	NC_006461	CCT	4	12	1606717	1606728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43643	NC_006461	GGA	2	6	1606738	1606743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981680
43644	NC_006461	TCC	2	6	1606779	1606784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981680
43645	NC_006461	TGG	2	6	1606788	1606793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981680
43646	NC_006461	C	6	6	1606836	1606841	0 %	0 %	0 %	100 %	55981680
43647	NC_006461	AGG	2	6	1606863	1606868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981680
43648	NC_006461	GTG	2	6	1606874	1606879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981680
43649	NC_006461	TCCGTG	2	12	1606994	1607005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981680
43650	NC_006461	CCTC	2	8	1607007	1607014	0 %	25 %	0 %	75 %	55981680
43651	NC_006461	GAG	3	9	1607053	1607061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981681
43652	NC_006461	AAG	2	6	1607083	1607088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981681
43653	NC_006461	C	7	7	1607155	1607161	0 %	0 %	0 %	100 %	55981681
43654	NC_006461	CCG	2	6	1607172	1607177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981681
43655	NC_006461	GAA	2	6	1607179	1607184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981681
43656	NC_006461	CCTCC	2	10	1607190	1607199	0 %	20 %	0 %	80 %	55981681
43657	NC_006461	GGC	2	6	1607221	1607226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981681
43658	NC_006461	GAG	2	6	1607227	1607232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981681
43659	NC_006461	ACC	2	6	1607276	1607281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981681
43660	NC_006461	CCAG	2	8	1607361	1607368	25 %	0 %	25 %	50 %	55981681
43661	NC_006461	CAT	2	6	1607446	1607451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43662	NC_006461	GTG	2	6	1607467	1607472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981682
43663	NC_006461	GAG	2	6	1607494	1607499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981682
43664	NC_006461	GGC	2	6	1607529	1607534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981682
43665	NC_006461	CAC	2	6	1607577	1607582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981682
43666	NC_006461	C	6	6	1607657	1607662	0 %	0 %	0 %	100 %	55981682
43667	NC_006461	CCT	2	6	1607718	1607723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981682
43668	NC_006461	CCT	4	12	1607736	1607747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981682
43669	NC_006461	GGC	2	6	1607759	1607764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981682
43670	NC_006461	GCA	2	6	1607781	1607786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981682
43671	NC_006461	CCT	2	6	1607838	1607843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981682
43672	NC_006461	CCT	2	6	1607870	1607875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981683
43673	NC_006461	GAA	2	6	1607895	1607900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981683
43674	NC_006461	GCGG	2	8	1607919	1607926	0 %	0 %	75 %	25 %	55981683
43675	NC_006461	TCT	2	6	1607957	1607962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981683
43676	NC_006461	C	6	6	1607996	1608001	0 %	0 %	0 %	100 %	55981683
43677	NC_006461	GTC	2	6	1608009	1608014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981683
43678	NC_006461	TGA	2	6	1608032	1608037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981683
43679	NC_006461	TCC	2	6	1608062	1608067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981683
43680	NC_006461	CCTGGC	2	12	1608131	1608142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981683
43681	NC_006461	CCA	2	6	1608257	1608262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981683
43682	NC_006461	GCCTCC	2	12	1608322	1608333	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981683
43683	NC_006461	AGG	2	6	1608370	1608375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981683
43684	NC_006461	CAC	2	6	1608390	1608395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981683
43685	NC_006461	CCT	2	6	1608425	1608430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981683
43686	NC_006461	CTC	2	6	1608465	1608470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981683
43687	NC_006461	TCC	2	6	1608478	1608483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981683
43688	NC_006461	GGA	2	6	1608539	1608544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981683
43689	NC_006461	GTGG	2	8	1608564	1608571	0 %	25 %	75 %	0 %	55981683
43690	NC_006461	GGC	2	6	1608658	1608663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981684
43691	NC_006461	CGC	2	6	1608709	1608714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981684
43692	NC_006461	GAC	2	6	1608734	1608739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981684
43693	NC_006461	CTT	2	6	1608742	1608747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981684
43694	NC_006461	CCT	2	6	1608751	1608756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43695	NC_006461	TGG	2	6	1608767	1608772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43696	NC_006461	G	6	6	1608771	1608776	0 %	0 %	100 %	0 %	55981684
43697	NC_006461	TGG	2	6	1608777	1608782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43698	NC_006461	TGG	2	6	1608858	1608863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43699	NC_006461	G	6	6	1608872	1608877	0 %	0 %	100 %	0 %	55981684
43700	NC_006461	CGG	2	6	1608889	1608894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981684
43701	NC_006461	TCC	2	6	1608900	1608905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43702	NC_006461	CTC	3	9	1608938	1608946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43703	NC_006461	GGT	2	6	1609045	1609050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43704	NC_006461	CCT	2	6	1609063	1609068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43705	NC_006461	CTC	2	6	1609103	1609108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43706	NC_006461	GCCGGG	2	12	1609109	1609120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981684
43707	NC_006461	CGC	2	6	1609144	1609149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981684
43708	NC_006461	TCA	2	6	1609170	1609175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981684
43709	NC_006461	CTT	2	6	1609180	1609185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981684
43710	NC_006461	TCC	2	6	1609188	1609193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43711	NC_006461	GTG	2	6	1609247	1609252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43712	NC_006461	TCC	2	6	1609278	1609283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981684
43713	NC_006461	CAG	2	6	1609328	1609333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981684
43714	NC_006461	GGT	2	6	1609366	1609371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43715	NC_006461	AGG	2	6	1609392	1609397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981684
43716	NC_006461	CTT	2	6	1609441	1609446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981684
43717	NC_006461	C	6	6	1609480	1609485	0 %	0 %	0 %	100 %	55981684
43718	NC_006461	CCG	2	6	1609518	1609523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981684
43719	NC_006461	GCCC	2	8	1609552	1609559	0 %	0 %	25 %	75 %	55981684
43720	NC_006461	CCG	2	6	1609585	1609590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981684
43721	NC_006461	AAG	2	6	1609598	1609603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981684
43722	NC_006461	AGG	2	6	1609614	1609619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981684
43723	NC_006461	GGT	2	6	1609672	1609677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981684
43724	NC_006461	GGA	2	6	1609716	1609721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981685
43725	NC_006461	GGT	2	6	1609755	1609760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981685
43726	NC_006461	GGA	2	6	1609764	1609769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981685
43727	NC_006461	GGA	2	6	1609797	1609802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981685
43728	NC_006461	CTC	2	6	1609828	1609833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981685
43729	NC_006461	CGC	2	6	1609872	1609877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981685
43730	NC_006461	CGG	2	6	1609885	1609890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981685
43731	NC_006461	GGA	2	6	1609896	1609901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981685
43732	NC_006461	GGCCCC	2	12	1609917	1609928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981685
43733	NC_006461	CTC	2	6	1610050	1610055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981685
43734	NC_006461	AGG	2	6	1610057	1610062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981685
43735	NC_006461	ACC	2	6	1610078	1610083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981685
43736	NC_006461	GGA	2	6	1610085	1610090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981685
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43738	NC_006461	CCT	2	6	1610106	1610111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981685
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43977	NC_006461	CTC	2	6	1618492	1618497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981692
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43992	NC_006461	G	7	7	1619220	1619226	0 %	0 %	100 %	0 %	55981692
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43998	NC_006461	TGG	2	6	1619548	1619553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43999	NC_006461	ACCC	2	8	1619577	1619584	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44000	NC_006461	ACT	2	6	1619596	1619601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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