MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_006461	TGG	2	6	1582830	1582835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981644
43003	NC_006461	GCC	2	6	1582952	1582957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981644
43004	NC_006461	CCA	2	6	1583034	1583039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981644
43005	NC_006461	GCG	2	6	1583044	1583049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981644
43006	NC_006461	GTA	2	6	1583053	1583058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981644
43007	NC_006461	CAC	3	9	1583134	1583142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981644
43008	NC_006461	GAAGCG	2	12	1583152	1583163	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55981644
43009	NC_006461	GCCC	2	8	1583166	1583173	0 %	0 %	25 %	75 %	55981644
43010	NC_006461	GGATCA	2	12	1583196	1583207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55981644
43011	NC_006461	TCT	2	6	1583208	1583213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981644
43012	NC_006461	TCC	2	6	1583241	1583246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43013	NC_006461	GCC	2	6	1583260	1583265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981645
43014	NC_006461	GGCCC	2	10	1583371	1583380	0 %	0 %	40 %	60 %	55981645
43015	NC_006461	TTG	2	6	1583402	1583407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981645
43016	NC_006461	TCG	2	6	1583459	1583464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981645
43017	NC_006461	TC	3	6	1583586	1583591	0 %	50 %	0 %	50 %	55981645
43018	NC_006461	C	6	6	1583591	1583596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43019	NC_006461	CTT	2	6	1583601	1583606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981646
43020	NC_006461	GTA	2	6	1583649	1583654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981646
43021	NC_006461	GGC	2	6	1583703	1583708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981646
43022	NC_006461	GACCCG	2	12	1583742	1583753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55981646
43023	NC_006461	CCA	3	9	1583795	1583803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981646
43024	NC_006461	GCCC	2	8	1583836	1583843	0 %	0 %	25 %	75 %	55981646
43025	NC_006461	TGA	2	6	1583873	1583878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981646
43026	NC_006461	GGC	2	6	1583960	1583965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981646
43027	NC_006461	TCG	2	6	1583968	1583973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981646
43028	NC_006461	CTC	2	6	1584000	1584005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981646
43029	NC_006461	CAC	3	9	1584006	1584014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981646
43030	NC_006461	CTTGAC	2	12	1584060	1584071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55981646
43031	NC_006461	CAC	2	6	1584141	1584146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981647
43032	NC_006461	CGC	2	6	1584163	1584168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981647
43033	NC_006461	CGGT	2	8	1584192	1584199	0 %	25 %	50 %	25 %	55981647
43034	NC_006461	CGC	2	6	1584282	1584287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981647
43035	NC_006461	CCG	2	6	1584302	1584307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981647
43036	NC_006461	TGG	2	6	1584312	1584317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981647
43037	NC_006461	CGTCCA	2	12	1584394	1584405	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55981647
43038	NC_006461	TGA	2	6	1584421	1584426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981647
43039	NC_006461	CG	3	6	1584435	1584440	0 %	0 %	50 %	50 %	55981647
43040	NC_006461	TCC	2	6	1584456	1584461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981647
43041	NC_006461	C	7	7	1584605	1584611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43042	NC_006461	GCAG	2	8	1584679	1584686	25 %	0 %	50 %	25 %	55981648
43043	NC_006461	GAA	2	6	1584701	1584706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981648
43044	NC_006461	CCGCA	2	10	1584729	1584738	20 %	0 %	20 %	60 %	55981648
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43046	NC_006461	CGG	2	6	1584878	1584883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981649
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43049	NC_006461	GCT	2	6	1584953	1584958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981649
43050	NC_006461	GAG	2	6	1585047	1585052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981649
43051	NC_006461	CGC	2	6	1585081	1585086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981649
43052	NC_006461	CTT	2	6	1585143	1585148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981649
43053	NC_006461	TGA	2	6	1585178	1585183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981649
43054	NC_006461	GCC	2	6	1585198	1585203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981649
43055	NC_006461	TCC	2	6	1585222	1585227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981649
43056	NC_006461	TGA	2	6	1585250	1585255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981649
43057	NC_006461	GCG	2	6	1585302	1585307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981649
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43059	NC_006461	GTA	2	6	1585332	1585337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981649
43060	NC_006461	CTC	2	6	1585374	1585379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981650
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43062	NC_006461	TCT	2	6	1585418	1585423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981650
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43070	NC_006461	CTT	2	6	1585677	1585682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981650
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43078	NC_006461	C	6	6	1585921	1585926	0 %	0 %	0 %	100 %	55981651
43079	NC_006461	CCT	2	6	1585936	1585941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981651
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43118	NC_006461	G	6	6	1587389	1587394	0 %	0 %	100 %	0 %	55981655
43119	NC_006461	CCT	2	6	1587416	1587421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981655
43120	NC_006461	CTC	2	6	1587462	1587467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981655
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43218	NC_006461	A	7	7	1591308	1591314	100 %	0 %	0 %	0 %	55981663
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43223	NC_006461	CCT	2	6	1591476	1591481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981663
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43225	NC_006461	TCC	2	6	1591521	1591526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981663
43226	NC_006461	TCC	2	6	1591634	1591639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981663
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43228	NC_006461	CCA	2	6	1591863	1591868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981663
43229	NC_006461	GTC	2	6	1591885	1591890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981663
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43235	NC_006461	TCC	2	6	1592322	1592327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43473	NC_006461	G	7	7	1600534	1600540	0 %	0 %	100 %	0 %	55981674
43474	NC_006461	CGC	2	6	1600546	1600551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981674
43475	NC_006461	CGC	2	6	1600558	1600563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981674
43476	NC_006461	TGGCCC	2	12	1600587	1600598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981674
43477	NC_006461	GCCC	2	8	1600662	1600669	0 %	0 %	25 %	75 %	55981674
43478	NC_006461	CTC	2	6	1600742	1600747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981674
43479	NC_006461	TCC	2	6	1600773	1600778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981674
43480	NC_006461	TGG	3	9	1600800	1600808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981674
43481	NC_006461	GTG	2	6	1600826	1600831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981674
43482	NC_006461	AGGA	2	8	1600871	1600878	50 %	0 %	50 %	0 %	55981674
43483	NC_006461	CCT	3	9	1600909	1600917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981674
43484	NC_006461	GGACCG	2	12	1600918	1600929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981674
43485	NC_006461	GGA	2	6	1600930	1600935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981674
43486	NC_006461	CTT	2	6	1600961	1600966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981674
43487	NC_006461	ACT	2	6	1600977	1600982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981674
43488	NC_006461	CCG	2	6	1601055	1601060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981675
43489	NC_006461	CGG	2	6	1601111	1601116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981675
43490	NC_006461	CGC	4	12	1601134	1601145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981675
43491	NC_006461	TGG	2	6	1601154	1601159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981675
43492	NC_006461	TGG	2	6	1601214	1601219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981675
43493	NC_006461	CCT	2	6	1601233	1601238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981675
43494	NC_006461	TCC	2	6	1601244	1601249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981675
43495	NC_006461	TGA	2	6	1601322	1601327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981675
43496	NC_006461	TGG	2	6	1601328	1601333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981675
43497	NC_006461	CAT	2	6	1601335	1601340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981675
43498	NC_006461	GGGGTG	3	18	1601363	1601380	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	55981675
43499	NC_006461	CCTCGT	2	12	1601464	1601475	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55981675
43500	NC_006461	G	6	6	1601481	1601486	0 %	0 %	100 %	0 %	55981675

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