MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_006461	GTG	2	6	1564607	1564612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981619
42503	NC_006461	CCCACG	2	12	1564625	1564636	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55981619
42504	NC_006461	AGG	2	6	1564706	1564711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
42505	NC_006461	AGG	2	6	1564745	1564750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
42506	NC_006461	CCA	2	6	1564785	1564790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981619
42507	NC_006461	GCC	2	6	1564793	1564798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981619
42508	NC_006461	TGA	2	6	1564857	1564862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981619
42509	NC_006461	C	6	6	1564864	1564869	0 %	0 %	0 %	100 %	55981619
42510	NC_006461	CCAG	2	8	1564911	1564918	25 %	0 %	25 %	50 %	55981619
42511	NC_006461	GTA	2	6	1564927	1564932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981619
42512	NC_006461	CCA	2	6	1564938	1564943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981619
42513	NC_006461	GAA	2	6	1564978	1564983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981619
42514	NC_006461	GAG	2	6	1564984	1564989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
42515	NC_006461	CCG	2	6	1565037	1565042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981619
42516	NC_006461	GAG	2	6	1565050	1565055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
42517	NC_006461	GAG	2	6	1565062	1565067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
42518	NC_006461	AGG	2	6	1565108	1565113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
42519	NC_006461	TGCCC	2	10	1565127	1565136	0 %	20 %	20 %	60 %	55981619
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42522	NC_006461	TCCA	2	8	1565219	1565226	25 %	25 %	0 %	50 %	55981619
42523	NC_006461	AAG	2	6	1565239	1565244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981619
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42528	NC_006461	AGGG	2	8	1565360	1565367	25 %	0 %	75 %	0 %	55981619
42529	NC_006461	GAG	2	6	1565401	1565406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
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42533	NC_006461	GTA	2	6	1565485	1565490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981619
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42544	NC_006461	GAG	2	6	1566004	1566009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981620
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42554	NC_006461	GAG	2	6	1566325	1566330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981620
42555	NC_006461	TGA	2	6	1566351	1566356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981620
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42570	NC_006461	GGCG	2	8	1567008	1567015	0 %	0 %	75 %	25 %	55981620
42571	NC_006461	GCG	2	6	1567031	1567036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981620
42572	NC_006461	GAG	3	9	1567057	1567065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981620
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42583	NC_006461	CAC	3	9	1567506	1567514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981621
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42585	NC_006461	CTT	2	6	1567599	1567604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981621
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42596	NC_006461	AGGT	2	8	1568062	1568069	25 %	25 %	50 %	0 %	55981621
42597	NC_006461	CCCA	2	8	1568122	1568129	25 %	0 %	0 %	75 %	55981621
42598	NC_006461	CCG	2	6	1568156	1568161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981621
42599	NC_006461	G	6	6	1568171	1568176	0 %	0 %	100 %	0 %	55981621
42600	NC_006461	CCA	2	6	1568219	1568224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981621
42601	NC_006461	GCC	2	6	1568292	1568297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981621
42602	NC_006461	CCT	2	6	1568370	1568375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981621
42603	NC_006461	AAGG	2	8	1568412	1568419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42604	NC_006461	ACC	2	6	1568449	1568454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42605	NC_006461	CAC	2	6	1568493	1568498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981622
42606	NC_006461	CCT	2	6	1568558	1568563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981622
42607	NC_006461	TCC	2	6	1568605	1568610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981622
42608	NC_006461	GCC	2	6	1568650	1568655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981622
42609	NC_006461	AGA	2	6	1568672	1568677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981622
42610	NC_006461	GGC	3	9	1568750	1568758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981622
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42614	NC_006461	TCC	2	6	1568959	1568964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981622
42615	NC_006461	GTAGCG	2	12	1568976	1568987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55981622
42616	NC_006461	CGC	2	6	1568998	1569003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981622
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42618	NC_006461	CCAT	2	8	1569032	1569039	25 %	25 %	0 %	50 %	55981622
42619	NC_006461	CTC	2	6	1569111	1569116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981622
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42861	NC_006461	TCC	2	6	1577257	1577262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981633
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