MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42004	NC_006461	GCG	2	6	1546021	1546026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981601
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42006	NC_006461	TGA	4	12	1546112	1546123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981601
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42013	NC_006461	GGC	2	6	1546305	1546310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981601
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42118	NC_006461	CCA	3	9	1550203	1550211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981604
42119	NC_006461	AGC	2	6	1550290	1550295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981604
42120	NC_006461	CCG	2	6	1550368	1550373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981604
42121	NC_006461	G	6	6	1550377	1550382	0 %	0 %	100 %	0 %	55981604
42122	NC_006461	CCA	2	6	1550410	1550415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981604
42123	NC_006461	CCT	2	6	1550423	1550428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42124	NC_006461	AGG	2	6	1550514	1550519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981605
42125	NC_006461	GAA	2	6	1550528	1550533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981605
42126	NC_006461	GGCT	2	8	1550543	1550550	0 %	25 %	50 %	25 %	55981605
42127	NC_006461	CACCTC	2	12	1550606	1550617	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55981605
42128	NC_006461	CGC	2	6	1550621	1550626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981605
42129	NC_006461	CACC	2	8	1550655	1550662	25 %	0 %	0 %	75 %	55981605
42130	NC_006461	CTC	2	6	1550663	1550668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
42131	NC_006461	TCCC	2	8	1550694	1550701	0 %	25 %	0 %	75 %	55981605
42132	NC_006461	CCT	2	6	1550761	1550766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
42133	NC_006461	G	6	6	1550768	1550773	0 %	0 %	100 %	0 %	55981605
42134	NC_006461	G	7	7	1550803	1550809	0 %	0 %	100 %	0 %	55981605
42135	NC_006461	CCT	2	6	1550851	1550856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
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42137	NC_006461	CCT	3	9	1550880	1550888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
42138	NC_006461	CTC	4	12	1550894	1550905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
42139	NC_006461	GAA	2	6	1550921	1550926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981605
42140	NC_006461	CGG	2	6	1550942	1550947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981605
42141	NC_006461	GCG	2	6	1550948	1550953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981605
42142	NC_006461	AGCG	2	8	1551014	1551021	25 %	0 %	50 %	25 %	55981605
42143	NC_006461	GGAGGG	2	12	1551052	1551063	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55981605
42144	NC_006461	ACC	2	6	1551075	1551080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981605
42145	NC_006461	C	7	7	1551079	1551085	0 %	0 %	0 %	100 %	55981605
42146	NC_006461	TGG	2	6	1551087	1551092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981605
42147	NC_006461	CGC	2	6	1551106	1551111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981605
42148	NC_006461	CAC	2	6	1551119	1551124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981605
42149	NC_006461	GGA	2	6	1551145	1551150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981605
42150	NC_006461	GGT	2	6	1551157	1551162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981605
42151	NC_006461	G	7	7	1551191	1551197	0 %	0 %	100 %	0 %	55981605
42152	NC_006461	GGC	2	6	1551241	1551246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981605
42153	NC_006461	GC	3	6	1551356	1551361	0 %	0 %	50 %	50 %	55981605
42154	NC_006461	GGA	3	9	1551370	1551378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981605
42155	NC_006461	CACCG	2	10	1551401	1551410	20 %	0 %	20 %	60 %	55981605
42156	NC_006461	GAG	2	6	1551425	1551430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981605
42157	NC_006461	GAC	2	6	1551455	1551460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981605
42158	NC_006461	GGCCT	2	10	1551494	1551503	0 %	20 %	40 %	40 %	55981605
42159	NC_006461	CAC	2	6	1551589	1551594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981605
42160	NC_006461	C	6	6	1551594	1551599	0 %	0 %	0 %	100 %	55981605
42161	NC_006461	AGG	2	6	1551603	1551608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981605
42162	NC_006461	G	6	6	1551625	1551630	0 %	0 %	100 %	0 %	55981605
42163	NC_006461	TCT	2	6	1551671	1551676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981606
42164	NC_006461	CAC	2	6	1551744	1551749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981606
42165	NC_006461	GAGG	2	8	1551798	1551805	25 %	0 %	75 %	0 %	55981606
42166	NC_006461	C	6	6	1551834	1551839	0 %	0 %	0 %	100 %	55981606
42167	NC_006461	ACC	2	6	1551848	1551853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981606
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42170	NC_006461	CGC	2	6	1551879	1551884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981606
42171	NC_006461	GCC	2	6	1551898	1551903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981606
42172	NC_006461	CCG	2	6	1551911	1551916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981606
42173	NC_006461	AAG	2	6	1551949	1551954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981606
42174	NC_006461	CG	3	6	1551978	1551983	0 %	0 %	50 %	50 %	55981606
42175	NC_006461	CCT	2	6	1551996	1552001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981606
42176	NC_006461	CGG	2	6	1552007	1552012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981606
42177	NC_006461	CTT	2	6	1552062	1552067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981606
42178	NC_006461	ACC	2	6	1552082	1552087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981606
42179	NC_006461	CCG	2	6	1552091	1552096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981606
42180	NC_006461	ACT	2	6	1552112	1552117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981606
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42183	NC_006461	GAC	2	6	1552309	1552314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981606
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42185	NC_006461	TGG	2	6	1552337	1552342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981606
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42188	NC_006461	GGCCC	2	10	1552414	1552423	0 %	0 %	40 %	60 %	55981606
42189	NC_006461	AGG	2	6	1552451	1552456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981606
42190	NC_006461	GCC	2	6	1552459	1552464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981606
42191	NC_006461	C	7	7	1552476	1552482	0 %	0 %	0 %	100 %	55981606
42192	NC_006461	AAGG	2	8	1552483	1552490	50 %	0 %	50 %	0 %	55981606
42193	NC_006461	C	6	6	1552517	1552522	0 %	0 %	0 %	100 %	55981606
42194	NC_006461	G	6	6	1552553	1552558	0 %	0 %	100 %	0 %	55981606
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42197	NC_006461	TCC	3	9	1552735	1552743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981607
42198	NC_006461	AGGG	2	8	1552773	1552780	25 %	0 %	75 %	0 %	55981607
42199	NC_006461	C	6	6	1552785	1552790	0 %	0 %	0 %	100 %	55981607
42200	NC_006461	TCC	2	6	1552791	1552796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981607
42201	NC_006461	GGA	2	6	1552814	1552819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981607
42202	NC_006461	AGG	3	9	1552846	1552854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981607
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42205	NC_006461	CCT	3	9	1552940	1552948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981607
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42209	NC_006461	G	6	6	1553077	1553082	0 %	0 %	100 %	0 %	55981607
42210	NC_006461	CGG	2	6	1553090	1553095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981607
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42218	NC_006461	GCC	2	6	1553420	1553425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981608
42219	NC_006461	CACCT	2	10	1553476	1553485	20 %	20 %	0 %	60 %	55981608
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42222	NC_006461	GGCG	2	8	1553556	1553563	0 %	0 %	75 %	25 %	55981608
42223	NC_006461	CCT	3	9	1553571	1553579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981608
42224	NC_006461	CTC	2	6	1553623	1553628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981608
42225	NC_006461	CTC	2	6	1553695	1553700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981608
42226	NC_006461	GTG	2	6	1553719	1553724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981608
42227	NC_006461	GGA	2	6	1553730	1553735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981608
42228	NC_006461	CCT	2	6	1553751	1553756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981608
42229	NC_006461	C	6	6	1553772	1553777	0 %	0 %	0 %	100 %	55981608
42230	NC_006461	CCT	2	6	1553827	1553832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981608
42231	NC_006461	GAG	2	6	1553848	1553853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981608
42232	NC_006461	GGA	2	6	1553900	1553905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981609
42233	NC_006461	CTT	2	6	1553936	1553941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981609
42234	NC_006461	CCTC	2	8	1554001	1554008	0 %	25 %	0 %	75 %	55981609
42235	NC_006461	GCCCCT	2	12	1554044	1554055	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981609
42236	NC_006461	G	6	6	1554154	1554159	0 %	0 %	100 %	0 %	55981609
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42238	NC_006461	GCC	2	6	1554184	1554189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981609
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42353	NC_006461	G	7	7	1558315	1558321	0 %	0 %	100 %	0 %	55981612
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42358	NC_006461	GTG	2	6	1558484	1558489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981612
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42452	NC_006461	GGGAA	2	10	1562383	1562392	40 %	0 %	60 %	0 %	55981616
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42465	NC_006461	GAG	2	6	1562768	1562773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981616
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42477	NC_006461	CCT	2	6	1563393	1563398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981616
42478	NC_006461	GGT	2	6	1563423	1563428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981616
42479	NC_006461	C	7	7	1563543	1563549	0 %	0 %	0 %	100 %	55981616
42480	NC_006461	TCC	2	6	1563569	1563574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981616
42481	NC_006461	G	6	6	1563577	1563582	0 %	0 %	100 %	0 %	55981616
42482	NC_006461	CTT	2	6	1563595	1563600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981616
42483	NC_006461	C	6	6	1563613	1563618	0 %	0 %	0 %	100 %	55981616
42484	NC_006461	CCT	2	6	1563633	1563638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981616
42485	NC_006461	AGA	2	6	1563690	1563695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981616
42486	NC_006461	GAG	2	6	1563733	1563738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981616
42487	NC_006461	GAA	2	6	1563742	1563747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981616
42488	NC_006461	CCT	2	6	1563957	1563962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981616
42489	NC_006461	G	7	7	1563979	1563985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42490	NC_006461	GTG	2	6	1564003	1564008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42491	NC_006461	AGACC	2	10	1564077	1564086	40 %	0 %	20 %	40 %	55981617
42492	NC_006461	GAG	2	6	1564119	1564124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981617
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42495	NC_006461	CCA	2	6	1564331	1564336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981618
42496	NC_006461	TCT	2	6	1564354	1564359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981618
42497	NC_006461	C	6	6	1564367	1564372	0 %	0 %	0 %	100 %	55981618
42498	NC_006461	GGCG	2	8	1564412	1564419	0 %	0 %	75 %	25 %	55981618
42499	NC_006461	CTG	2	6	1564516	1564521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981619
42500	NC_006461	AGA	2	6	1564530	1564535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981619

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