MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_006461	TCC	2	6	1527887	1527892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981576
41503	NC_006461	GCC	2	6	1527910	1527915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981576
41504	NC_006461	CCG	2	6	1527918	1527923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981576
41505	NC_006461	GCC	2	6	1527929	1527934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981576
41506	NC_006461	TTC	2	6	1527964	1527969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981576
41507	NC_006461	GAG	3	9	1528048	1528056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981576
41508	NC_006461	CCT	2	6	1528210	1528215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981577
41509	NC_006461	AGGTGG	2	12	1528218	1528229	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55981577
41510	NC_006461	TCTTCC	2	12	1528299	1528310	0 %	50 %	0 %	50 %	55981577
41511	NC_006461	CGG	2	6	1528320	1528325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981577
41512	NC_006461	CTT	2	6	1528369	1528374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981577
41513	NC_006461	CTA	2	6	1528441	1528446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981577
41514	NC_006461	CCG	3	9	1528495	1528503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981577
41515	NC_006461	G	7	7	1528529	1528535	0 %	0 %	100 %	0 %	55981577
41516	NC_006461	TCC	2	6	1528591	1528596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981578
41517	NC_006461	CTC	2	6	1528614	1528619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981578
41518	NC_006461	TCC	2	6	1528621	1528626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981578
41519	NC_006461	CGCGG	2	10	1528658	1528667	0 %	0 %	60 %	40 %	55981578
41520	NC_006461	C	7	7	1528678	1528684	0 %	0 %	0 %	100 %	55981578
41521	NC_006461	GGC	2	6	1528765	1528770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981578
41522	NC_006461	GAG	2	6	1528788	1528793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981578
41523	NC_006461	CTC	2	6	1528806	1528811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981578
41524	NC_006461	GTG	3	9	1528869	1528877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981578
41525	NC_006461	CTC	2	6	1528986	1528991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981578
41526	NC_006461	GGT	2	6	1529012	1529017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981578
41527	NC_006461	GCC	2	6	1529045	1529050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981578
41528	NC_006461	TCC	2	6	1529103	1529108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981579
41529	NC_006461	CTTC	2	8	1529131	1529138	0 %	50 %	0 %	50 %	55981579
41530	NC_006461	CTT	2	6	1529153	1529158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981579
41531	NC_006461	GAT	2	6	1529195	1529200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981579
41532	NC_006461	G	7	7	1529205	1529211	0 %	0 %	100 %	0 %	55981579
41533	NC_006461	TGA	2	6	1529212	1529217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981579
41534	NC_006461	TCG	2	6	1529262	1529267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981579
41535	NC_006461	GTA	2	6	1529288	1529293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981579
41536	NC_006461	TCCC	2	8	1529338	1529345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41537	NC_006461	CTT	2	6	1529368	1529373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41538	NC_006461	GGCG	2	8	1529385	1529392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41539	NC_006461	C	6	6	1529402	1529407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41540	NC_006461	CCG	2	6	1529425	1529430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981580
41541	NC_006461	GCC	2	6	1529441	1529446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981580
41542	NC_006461	GCC	2	6	1529489	1529494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981580
41543	NC_006461	CTC	2	6	1529495	1529500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981580
41544	NC_006461	TCC	2	6	1529532	1529537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981580
41545	NC_006461	ACC	2	6	1529541	1529546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981580
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41547	NC_006461	CTA	2	6	1529599	1529604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981580
41548	NC_006461	CCT	2	6	1529674	1529679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981580
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41550	NC_006461	GGA	2	6	1529698	1529703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981580
41551	NC_006461	TGG	3	9	1529721	1529729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981580
41552	NC_006461	GGCCT	2	10	1529735	1529744	0 %	20 %	40 %	40 %	55981580
41553	NC_006461	AGG	2	6	1529802	1529807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981580
41554	NC_006461	GCC	2	6	1529813	1529818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981580
41555	NC_006461	GTG	2	6	1529828	1529833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981580
41556	NC_006461	CTC	2	6	1529843	1529848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981580
41557	NC_006461	ACC	2	6	1529889	1529894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981580
41558	NC_006461	TCC	3	9	1529999	1530007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981581
41559	NC_006461	GCG	2	6	1530049	1530054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981581
41560	NC_006461	GGAGC	2	10	1530069	1530078	20 %	0 %	60 %	20 %	55981581
41561	NC_006461	GCC	2	6	1530082	1530087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981581
41562	NC_006461	CG	3	6	1530094	1530099	0 %	0 %	50 %	50 %	55981581
41563	NC_006461	TGCGG	2	10	1530132	1530141	0 %	20 %	60 %	20 %	55981581
41564	NC_006461	GGA	4	12	1530147	1530158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981581
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41566	NC_006461	GAG	2	6	1530214	1530219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981581
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41568	NC_006461	GCCC	2	8	1530252	1530259	0 %	0 %	25 %	75 %	55981581
41569	NC_006461	CAC	2	6	1530355	1530360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981581
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41574	NC_006461	GAG	2	6	1530469	1530474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981581
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41579	NC_006461	TCT	2	6	1530680	1530685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981582
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41590	NC_006461	CCT	2	6	1530947	1530952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981582
41591	NC_006461	CCA	2	6	1531016	1531021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981582
41592	NC_006461	CGC	2	6	1531073	1531078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981582
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41601	NC_006461	CCA	2	6	1531409	1531414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981583
41602	NC_006461	ACCTCC	2	12	1531486	1531497	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55981583
41603	NC_006461	CGG	2	6	1531523	1531528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981583
41604	NC_006461	GCCACG	2	12	1531570	1531581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55981583
41605	NC_006461	TGC	2	6	1531673	1531678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981584
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41607	NC_006461	CTC	2	6	1531756	1531761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981584
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41612	NC_006461	TGGCCC	2	12	1531991	1532002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981584
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41616	NC_006461	GGCG	2	8	1532049	1532056	0 %	0 %	75 %	25 %	55981584
41617	NC_006461	GGA	2	6	1532058	1532063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981584
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41619	NC_006461	GCG	2	6	1532101	1532106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41620	NC_006461	G	6	6	1532118	1532123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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41844	NC_006461	CTCTTC	2	12	1540444	1540455	0 %	50 %	0 %	50 %	55981596
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