MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_006461	G	6	6	1510026	1510031	0 %	0 %	100 %	0 %	55981555
41003	NC_006461	CCG	2	6	1510052	1510057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981555
41004	NC_006461	GAA	2	6	1510127	1510132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981555
41005	NC_006461	G	7	7	1510176	1510182	0 %	0 %	100 %	0 %	55981555
41006	NC_006461	ATC	3	9	1510227	1510235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981555
41007	NC_006461	CCGACG	2	12	1510240	1510251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55981555
41008	NC_006461	CTC	3	9	1510275	1510283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981555
41009	NC_006461	CTT	2	6	1510286	1510291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981555
41010	NC_006461	GAA	2	6	1510370	1510375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981555
41011	NC_006461	CGA	2	6	1510394	1510399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981555
41012	NC_006461	AGC	2	6	1510483	1510488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981555
41013	NC_006461	ACC	2	6	1510497	1510502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981555
41014	NC_006461	AGG	2	6	1510588	1510593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981555
41015	NC_006461	CCA	2	6	1510717	1510722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981556
41016	NC_006461	C	8	8	1510750	1510757	0 %	0 %	0 %	100 %	55981556
41017	NC_006461	TGG	2	6	1510783	1510788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981556
41018	NC_006461	GAA	2	6	1510844	1510849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981556
41019	NC_006461	GAG	2	6	1510949	1510954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981556
41020	NC_006461	CGGCC	2	10	1510957	1510966	0 %	0 %	40 %	60 %	55981556
41021	NC_006461	TCGTAG	2	12	1510983	1510994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55981556
41022	NC_006461	CCA	2	6	1511095	1511100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981556
41023	NC_006461	TCG	2	6	1511109	1511114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981556
41024	NC_006461	AAGGCC	2	12	1511121	1511132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981556
41025	NC_006461	GGC	2	6	1511135	1511140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981556
41026	NC_006461	GAA	2	6	1511207	1511212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981556
41027	NC_006461	G	7	7	1511213	1511219	0 %	0 %	100 %	0 %	55981556
41028	NC_006461	CAC	2	6	1511228	1511233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981556
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41030	NC_006461	CGC	2	6	1511333	1511338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981556
41031	NC_006461	CCGTC	2	10	1511389	1511398	0 %	20 %	20 %	60 %	55981556
41032	NC_006461	G	6	6	1511460	1511465	0 %	0 %	100 %	0 %	55981556
41033	NC_006461	GCC	2	6	1511487	1511492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981556
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41036	NC_006461	G	7	7	1511711	1511717	0 %	0 %	100 %	0 %	55981557
41037	NC_006461	CCT	2	6	1511746	1511751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981557
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41039	NC_006461	CCA	2	6	1511773	1511778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981557
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41042	NC_006461	GAGGCG	2	12	1511855	1511866	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55981557
41043	NC_006461	CCT	2	6	1511890	1511895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981557
41044	NC_006461	CGG	2	6	1511920	1511925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981557
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41046	NC_006461	TCG	2	6	1511973	1511978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981557
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41050	NC_006461	CCGC	2	8	1512034	1512041	0 %	0 %	25 %	75 %	55981557
41051	NC_006461	GTA	2	6	1512053	1512058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981557
41052	NC_006461	GCCC	2	8	1512079	1512086	0 %	0 %	25 %	75 %	55981557
41053	NC_006461	TCCGCC	2	12	1512087	1512098	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981557
41054	NC_006461	GGAA	2	8	1512121	1512128	50 %	0 %	50 %	0 %	55981557
41055	NC_006461	CAC	2	6	1512206	1512211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981557
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41064	NC_006461	CCGG	2	8	1512528	1512535	0 %	0 %	50 %	50 %	55981558
41065	NC_006461	TCG	2	6	1512576	1512581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981558
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41071	NC_006461	TC	3	6	1512817	1512822	0 %	50 %	0 %	50 %	55981558
41072	NC_006461	GTA	2	6	1512830	1512835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981558
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41076	NC_006461	CCCA	2	8	1512957	1512964	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41077	NC_006461	GGA	2	6	1513014	1513019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981559
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41087	NC_006461	CCCG	2	8	1513206	1513213	0 %	0 %	25 %	75 %	55981559
41088	NC_006461	AGG	2	6	1513214	1513219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981559
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41091	NC_006461	GAG	4	12	1513372	1513383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981559
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41100	NC_006461	CTCCTT	2	12	1513715	1513726	0 %	50 %	0 %	50 %	55981560
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41104	NC_006461	CCT	2	6	1513831	1513836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981560
41105	NC_006461	GGA	2	6	1513846	1513851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981560
41106	NC_006461	TCC	2	6	1513857	1513862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981560
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41112	NC_006461	C	7	7	1514096	1514102	0 %	0 %	0 %	100 %	55981561
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41117	NC_006461	CCGC	2	8	1514288	1514295	0 %	0 %	25 %	75 %	55981561
41118	NC_006461	GGC	2	6	1514312	1514317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981561
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41120	NC_006461	GAG	2	6	1514487	1514492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981561
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41123	NC_006461	GGCG	2	8	1514615	1514622	0 %	0 %	75 %	25 %	55981561
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41239	NC_006461	G	6	6	1518756	1518761	0 %	0 %	100 %	0 %	55981565
41240	NC_006461	CCT	2	6	1518770	1518775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981565
41241	NC_006461	CTC	2	6	1518789	1518794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981565
41242	NC_006461	GAG	2	6	1518924	1518929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981565
41243	NC_006461	GCC	2	6	1518963	1518968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981565
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41246	NC_006461	GAG	2	6	1519047	1519052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981565
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41248	NC_006461	GAC	2	6	1519188	1519193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981565
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41251	NC_006461	GGA	2	6	1519271	1519276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981565
41252	NC_006461	CCT	2	6	1519310	1519315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981565
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41272	NC_006461	ACC	2	6	1519711	1519716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981565
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41284	NC_006461	G	7	7	1520172	1520178	0 %	0 %	100 %	0 %	55981565
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41288	NC_006461	GCC	2	6	1520362	1520367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981565
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41290	NC_006461	CCCT	2	8	1520386	1520393	0 %	25 %	0 %	75 %	55981565
41291	NC_006461	GCG	2	6	1520433	1520438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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41351	NC_006461	C	6	6	1522348	1522353	0 %	0 %	0 %	100 %	55981567
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41358	NC_006461	GGA	2	6	1522525	1522530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981567
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41476	NC_006461	CCCT	2	8	1526842	1526849	0 %	25 %	0 %	75 %	55981575
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41480	NC_006461	CCA	2	6	1527006	1527011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981575
41481	NC_006461	GCC	2	6	1527017	1527022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981575
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41483	NC_006461	CGC	2	6	1527057	1527062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981575
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41487	NC_006461	AGG	2	6	1527246	1527251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981575
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41499	NC_006461	CGC	2	6	1527747	1527752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981576
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