MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40005	NC_006461	AGG	2	6	1474479	1474484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981517
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40011	NC_006461	GTG	2	6	1474766	1474771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981517
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40121	NC_006461	GACCC	2	10	1478140	1478149	20 %	0 %	20 %	60 %	55981521
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40123	NC_006461	CTC	2	6	1478202	1478207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981521
40124	NC_006461	GCGG	2	8	1478234	1478241	0 %	0 %	75 %	25 %	55981521
40125	NC_006461	CTC	2	6	1478265	1478270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981521
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40130	NC_006461	GCC	2	6	1478400	1478405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981521
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40134	NC_006461	GCGG	2	8	1478570	1478577	0 %	0 %	75 %	25 %	55981521
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40152	NC_006461	CTC	3	9	1479054	1479062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981521
40153	NC_006461	GGCCT	2	10	1479103	1479112	0 %	20 %	40 %	40 %	55981521
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40182	NC_006461	AGG	2	6	1480043	1480048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40201	NC_006461	GGA	2	6	1480716	1480721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981524
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40203	NC_006461	G	6	6	1480794	1480799	0 %	0 %	100 %	0 %	55981525
40204	NC_006461	CTC	2	6	1480809	1480814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981525
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40214	NC_006461	GAAC	2	8	1481126	1481133	50 %	0 %	25 %	25 %	55981525
40215	NC_006461	GAGGC	2	10	1481145	1481154	20 %	0 %	60 %	20 %	55981525
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40223	NC_006461	GGGGC	2	10	1481500	1481509	0 %	0 %	80 %	20 %	55981526
40224	NC_006461	CGG	2	6	1481512	1481517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981526
40225	NC_006461	G	8	8	1481516	1481523	0 %	0 %	100 %	0 %	55981526
40226	NC_006461	CGGGA	2	10	1481548	1481557	20 %	0 %	60 %	20 %	55981526
40227	NC_006461	GAT	2	6	1481561	1481566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981526
40228	NC_006461	ACG	2	6	1481575	1481580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981526
40229	NC_006461	CTT	2	6	1481600	1481605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981526
40230	NC_006461	AAG	2	6	1481619	1481624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981526
40231	NC_006461	TGG	2	6	1481677	1481682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981526
40232	NC_006461	CCG	2	6	1481686	1481691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981526
40233	NC_006461	TCC	2	6	1481698	1481703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981526
40234	NC_006461	GAC	2	6	1481733	1481738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981526
40235	NC_006461	TCT	2	6	1481749	1481754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981526
40236	NC_006461	CAT	2	6	1481801	1481806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981526
40237	NC_006461	G	7	7	1481823	1481829	0 %	0 %	100 %	0 %	55981526
40238	NC_006461	TGA	2	6	1481842	1481847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981526
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40240	NC_006461	GGC	2	6	1481909	1481914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981526
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40478	NC_006461	GGC	2	6	1490512	1490517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981535
40479	NC_006461	GCG	2	6	1490548	1490553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981535
40480	NC_006461	CCT	2	6	1490571	1490576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981535
40481	NC_006461	GGC	2	6	1490611	1490616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981535
40482	NC_006461	CCAC	2	8	1490701	1490708	25 %	0 %	0 %	75 %	55981536
40483	NC_006461	GAG	2	6	1490729	1490734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981536
40484	NC_006461	CCA	2	6	1490761	1490766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981536
40485	NC_006461	TGG	2	6	1490781	1490786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981536
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40487	NC_006461	GGA	3	9	1490818	1490826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981536
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40489	NC_006461	CTC	2	6	1490876	1490881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981536
40490	NC_006461	GCC	2	6	1490893	1490898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981536
40491	NC_006461	GC	3	6	1490939	1490944	0 %	0 %	50 %	50 %	55981536
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40493	NC_006461	G	6	6	1490968	1490973	0 %	0 %	100 %	0 %	55981536
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40495	NC_006461	CGCCT	2	10	1491018	1491027	0 %	20 %	20 %	60 %	55981536
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40497	NC_006461	CCT	2	6	1491040	1491045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981536
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40499	NC_006461	CAC	2	6	1491068	1491073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981536
40500	NC_006461	TCC	2	6	1491087	1491092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981536

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